Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G023700.1
Synonym Sb05g001956
Functional annotation pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed
UniProt C5Y407
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g24150.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G006900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
2 Sobic.006G263500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G027900 pollen allergen, putative, expressed -
4 Sobic.005G025600 plant invertase/pectin methylesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
5 Sobic.002G066300 expressed protein -
6 Sobic.006G159000 OsPLIM2b - LIM domain protein, putative actin-binding protein and transcription factor, expressed -
7 Sobic.008G028000 pollen allergen, putative, expressed -
8 Sobic.003G335200 monocopper oxidase, putative, expressed -
9 Sobic.009G091600 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
10 Sobic.003G400000 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed -
11 Sobic.004G002800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
12 Sobic.004G029032 - -
13 Sobic.001G412900 - -
14 Sobic.006G282000 cytochrome c, putative, expressed K08738: cytochrome c
15 Sobic.009G075400 RALFL17 - Rapid ALkalinization Factor RALF family protein precursor, expressed -
16 Sobic.008G119501 - -
17 Sobic.001G306400 expansin precursor, putative, expressed -
18 Sobic.001G252900 -(PubMedID : 26976818)@soluble inorganic pyrophosphatase, putative, expressed K01507: inorganic pyrophosphatase
19 Sobic.001G097000 WD-40 repeat family protein, putative, expressed -
20 Sobic.006G171500 ZOS4-09 - C2H2 zinc finger protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic005G023700--Sobic010G006900 Sobic006G263500 Sobic006G263500 Sobic005G023700--Sobic006G263500 Sobic008G027900 Sobic008G027900 Sobic005G023700--Sobic008G027900 Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic005G023700--Sobic005G025600 Sobic002G066300 Sobic002G066300 Sobic005G023700--Sobic002G066300 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic005G023700--Sobic006G159000 Sobic008G028000 Sobic008G028000 Sobic005G023700--Sobic008G028000 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic005G023700--Sobic003G335200 Sobic009G091600 Sobic009G091600 Sobic005G023700--Sobic009G091600 Sobic010G006900--Sobic006G263500 Sobic010G006900--Sobic005G023700 Sobic010G006900--Sobic005G025600 Sobic010G006900--Sobic008G027900 Sobic010G006900--Sobic006G159000 Sobic010G006900--Sobic008G028000 Sobic010G006900--Sobic009G091600 Sobic010G006900--Sobic002G066300 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic010G006900--Sobic004G002800 Sobic006G263500--Sobic010G006900 Sobic006G263500--Sobic005G025600 Sobic006G263500--Sobic005G023700 Sobic006G263500--Sobic008G027900 Sobic006G263500--Sobic008G028000 Sobic006G263500--Sobic006G159000 Sobic006G263500--Sobic004G002800 Sobic006G263500--Sobic009G091600 Sobic004G029032 Sobic004G029032 Sobic006G263500--Sobic004G029032 Sobic008G027900--Sobic009G091600 Sobic008G027900--Sobic010G006900 Sobic008G027900--Sobic006G263500 Sobic008G027900--Sobic008G028000 Sobic008G027900--Sobic005G023700 Sobic008G027900--Sobic004G029032 Sobic008G027900--Sobic005G025600 Sobic003G400000 Sobic003G400000 Sobic008G027900--Sobic003G400000 Sobic008G027900--Sobic002G066300 Sobic005G025600--Sobic006G263500 Sobic005G025600--Sobic004G002800 Sobic005G025600--Sobic010G006900 Sobic005G025600--Sobic006G159000 Sobic005G025600--Sobic005G023700 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic005G025600--Sobic001G252900 Sobic005G025600--Sobic003G335200 Sobic005G025600--Sobic008G028000 Sobic005G025600--Sobic008G027900 Sobic002G066300--Sobic005G023700 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic002G066300--Sobic008G119501 Sobic006G282000 Sobic006G282000 Sobic002G066300--Sobic006G282000 Sobic002G066300--Sobic009G091600 Sobic002G066300--Sobic003G400000 Sobic002G066300--Sobic010G006900 Sobic002G066300--Sobic008G027900 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic002G066300--Sobic001G097000 Sobic002G066300--Sobic006G263500 Sobic006G159000--Sobic005G025600 Sobic006G159000--Sobic010G006900 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic006G159000--Sobic001G306400 Sobic006G159000--Sobic005G023700 Sobic006G159000--Sobic006G263500 Sobic001G412900 Sobic001G412900 Sobic006G159000--Sobic001G412900 Sobic001G288400 Sobic001G288400 Sobic006G159000--Sobic001G288400 Sobic006G159000--Sobic008G028000 Sobic006G159000--Sobic004G002800 Sobic008G028000--Sobic008G027900 Sobic008G028000--Sobic005G023700 Sobic008G028000--Sobic006G263500 Sobic008G028000--Sobic010G006900 Sobic008G028000--Sobic005G025600 Sobic008G028000--Sobic009G091600 Sobic008G028000--Sobic006G159000 Sobic008G028000--Sobic004G029032 Sobic008G028000--Sobic001G412900 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic003G335200--Sobic009G075400 Sobic003G335200--Sobic004G002800 Sobic003G335200--Sobic005G023700 Sobic003G335200--Sobic005G025600 Sobic003G335200--Sobic006G263500 Sobic003G335200--Sobic006G159000 Sobic003G335200--Sobic002G066300 Sobic003G335200--Sobic010G006900 Sobic003G335200--Sobic001G252900 Sobic009G091600--Sobic008G027900 Sobic009G091600--Sobic004G029032 Sobic009G091600--Sobic005G023700 Sobic009G091600--Sobic003G400000 Sobic009G091600--Sobic010G006900 Sobic009G091600--Sobic008G028000 Sobic009G091600--Sobic006G263500 Sobic009G091600--Sobic002G066300 Sobic007G112400 Sobic007G112400 Sobic009G091600--Sobic007G112400
Octagon: transcription factors


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