Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G029032.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RLQ8
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G171500 ZOS4-09 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.003G400000 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed -
3 Sobic.008G027900 pollen allergen, putative, expressed -
4 Sobic.009G091600 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G348600 patatin, putative, expressed -
6 Sobic.002G150400 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G263500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
8 Sobic.008G028200 pollen allergen, putative, expressed -
9 Sobic.001G024800 uncharacterized Cys-rich domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G023700 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
11 Sobic.010G006900 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
12 Sobic.008G028000 pollen allergen, putative, expressed -
13 Sobic.002G066300 expressed protein -
14 Sobic.006G282000 cytochrome c, putative, expressed K08738: cytochrome c
15 Sobic.008G119501 - -
16 Sobic.005G025600 plant invertase/pectin methylesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G452500 MA3 domain-containing protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@MA3 domain containing protein, expressed -
18 Sobic.007G222500 - -
19 Sobic.004G134600 fasciclin-like arabinogalactan protein 8 precursor, putative, expressed -
20 Sobic.003G335200 monocopper oxidase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G029032 Sobic004G029032 Sobic006G171500 Sobic006G171500 Sobic004G029032--Sobic006G171500 Sobic003G400000 Sobic003G400000 Sobic004G029032--Sobic003G400000 Sobic008G027900 Sobic008G027900 Sobic004G029032--Sobic008G027900 Sobic009G091600 Sobic009G091600 Sobic004G029032--Sobic009G091600 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic004G029032--Sobic001G348600 Sobic002G150400 Sobic002G150400 Sobic004G029032--Sobic002G150400 Sobic006G263500 Sobic006G263500 Sobic004G029032--Sobic006G263500 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic004G029032--Sobic008G028200 Sobic001G024800 Sobic001G024800 Sobic004G029032--Sobic001G024800 Sobic006G171500--Sobic001G348600 Sobic006G171500--Sobic004G029032 Sobic006G171500--Sobic008G028200 Sobic006G171500--Sobic002G150400 Sobic006G171500--Sobic003G400000 Sobic006G171500--Sobic008G027900 Sobic006G171500--Sobic001G024800 Sobic002G140500 Sobic002G140500 Sobic006G171500--Sobic002G140500 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic006G171500--Sobic001G002200 Sobic003G400000--Sobic004G029032 Sobic003G400000--Sobic009G091600 Sobic003G400000--Sobic008G027900 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic003G400000--Sobic005G023700 Sobic002G066300 Sobic002G066300 Sobic003G400000--Sobic002G066300 Sobic003G400000--Sobic001G024800 Sobic003G400000--Sobic006G263500 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic003G400000--Sobic010G006900 Sobic003G400000--Sobic006G171500 Sobic008G027900--Sobic009G091600 Sobic008G027900--Sobic010G006900 Sobic008G027900--Sobic006G263500 Sobic008G028000 Sobic008G028000 Sobic008G027900--Sobic008G028000 Sobic008G027900--Sobic005G023700 Sobic008G027900--Sobic004G029032 Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic008G027900--Sobic005G025600 Sobic008G027900--Sobic003G400000 Sobic008G027900--Sobic002G066300 Sobic009G091600--Sobic008G027900 Sobic009G091600--Sobic004G029032 Sobic009G091600--Sobic005G023700 Sobic009G091600--Sobic003G400000 Sobic009G091600--Sobic010G006900 Sobic009G091600--Sobic008G028000 Sobic009G091600--Sobic006G263500 Sobic009G091600--Sobic002G066300 Sobic007G112400 Sobic007G112400 Sobic009G091600--Sobic007G112400 Sobic001G348600--Sobic006G171500 Sobic001G348600--Sobic008G028200 Sobic001G348600--Sobic004G029032 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic001G348600--Sobic007G222500 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic001G348600--Sobic001G228000 Sobic001G348600--Sobic002G150400 Sobic001G348600--Sobic002G140500 Sobic001G348600--Sobic001G002200 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic001G348600--Sobic008G027800 Sobic002G150400--Sobic008G028200 Sobic002G150400--Sobic006G171500 Sobic002G150400--Sobic004G029032 Sobic002G150400--Sobic001G024800 Sobic002G150400--Sobic001G348600 Sobic002G150400--Sobic001G002200 Sobic002G150400--Sobic003G400000 Sobic002G150400--Sobic008G027800 Sobic002G150400--Sobic001G228000 Sobic006G263500--Sobic010G006900 Sobic006G263500--Sobic005G025600 Sobic006G263500--Sobic005G023700 Sobic006G263500--Sobic008G027900 Sobic006G263500--Sobic008G028000 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic006G263500--Sobic006G159000 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic006G263500--Sobic004G002800 Sobic006G263500--Sobic009G091600 Sobic006G263500--Sobic004G029032 Sobic008G028200--Sobic006G171500 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic008G028200--Sobic010G093600 Sobic008G028200--Sobic008G027800 Sobic008G028200--Sobic001G348600 Sobic008G028200--Sobic002G150400 Sobic008G028200--Sobic001G002200 Sobic008G028200--Sobic004G029032 Sobic008G028200--Sobic002G140500 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic008G028200--Sobic009G016700 Sobic001G024800--Sobic002G150400 Sobic008G119501 Sobic008G119501 Sobic001G024800--Sobic008G119501 Sobic001G024800--Sobic004G029032 Sobic001G024800--Sobic003G400000 Sobic001G024800--Sobic006G171500 Sobic006G282000 Sobic006G282000 Sobic001G024800--Sobic006G282000 Sobic001G024800--Sobic002G066300 Sobic001G024800--Sobic001G348600 Sobic001G024800--Sobic009G091600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.