Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G025600.1
Synonym
Functional annotation plant invertase/pectin methylesterase inhibitor domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PPT2
Pfam -
Panther DB PTHR31080 PTHR31080:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g12600.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G263500 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
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13 Sobic.003G073540 - -
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19 Sobic.003G400000 signal peptide peptidase-like 2B, putative, expressed -
20 Sobic.004G029032 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G025600 Sobic005G025600 Sobic006G263500 Sobic006G263500 Sobic005G025600--Sobic006G263500 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic005G025600--Sobic004G002800 Sobic010G006900 Sobic010G006900 Sobic005G025600--Sobic010G006900 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic005G025600--Sobic006G159000 Sobic005G023700 Sobic005G023700 Sobic005G025600--Sobic005G023700 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic005G025600--Sobic001G252900 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic005G025600--Sobic003G335200 Sobic008G028000 Sobic008G028000 Sobic005G025600--Sobic008G028000 Sobic008G027900 Sobic008G027900 Sobic005G025600--Sobic008G027900 Sobic006G263500--Sobic010G006900 Sobic006G263500--Sobic005G025600 Sobic006G263500--Sobic005G023700 Sobic006G263500--Sobic008G027900 Sobic006G263500--Sobic008G028000 Sobic006G263500--Sobic006G159000 Sobic006G263500--Sobic004G002800 Sobic009G091600 Sobic009G091600 Sobic006G263500--Sobic009G091600 Sobic004G029032 Sobic004G029032 Sobic006G263500--Sobic004G029032 Sobic004G002800--Sobic005G025600 Sobic004G002800--Sobic001G252900 Sobic009G082900 Sobic009G082900 Sobic004G002800--Sobic009G082900 Sobic004G002800--Sobic003G335200 Sobic004G002800--Sobic006G263500 Sobic004G002800--Sobic006G159000 Sobic004G002800--Sobic005G023700 Sobic004G002800--Sobic010G006900 Sobic003G073540 Sobic003G073540 Sobic004G002800--Sobic003G073540 Sobic010G006900--Sobic006G263500 Sobic010G006900--Sobic005G023700 Sobic010G006900--Sobic005G025600 Sobic010G006900--Sobic008G027900 Sobic010G006900--Sobic006G159000 Sobic010G006900--Sobic008G028000 Sobic010G006900--Sobic009G091600 Sobic002G066300 Sobic002G066300 Sobic010G006900--Sobic002G066300 Sobic010G006900--Sobic004G002800 Sobic006G159000--Sobic005G025600 Sobic006G159000--Sobic010G006900 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic006G159000--Sobic001G306400 Sobic006G159000--Sobic005G023700 Sobic006G159000--Sobic006G263500 Sobic001G412900 Sobic001G412900 Sobic006G159000--Sobic001G412900 Sobic001G288400 Sobic001G288400 Sobic006G159000--Sobic001G288400 Sobic006G159000--Sobic008G028000 Sobic006G159000--Sobic004G002800 Sobic005G023700--Sobic010G006900 Sobic005G023700--Sobic006G263500 Sobic005G023700--Sobic008G027900 Sobic005G023700--Sobic005G025600 Sobic005G023700--Sobic002G066300 Sobic005G023700--Sobic006G159000 Sobic005G023700--Sobic008G028000 Sobic005G023700--Sobic003G335200 Sobic005G023700--Sobic009G091600 Sobic001G252900--Sobic004G002800 Sobic001G252900--Sobic009G082900 Sobic001G252900--Sobic005G025600 Sobic001G252900--Sobic003G073540 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic001G252900--Sobic007G222500 Sobic001G252900--Sobic006G263500 Sobic001G252900--Sobic003G335200 Sobic001G252900--Sobic010G006900 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic001G252900--Sobic001G528700 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic003G335200--Sobic009G075400 Sobic003G335200--Sobic004G002800 Sobic003G335200--Sobic005G023700 Sobic003G335200--Sobic005G025600 Sobic003G335200--Sobic006G263500 Sobic003G335200--Sobic006G159000 Sobic003G335200--Sobic002G066300 Sobic003G335200--Sobic010G006900 Sobic003G335200--Sobic001G252900 Sobic008G028000--Sobic008G027900 Sobic008G028000--Sobic005G023700 Sobic008G028000--Sobic006G263500 Sobic008G028000--Sobic010G006900 Sobic008G028000--Sobic005G025600 Sobic008G028000--Sobic009G091600 Sobic008G028000--Sobic006G159000 Sobic008G028000--Sobic004G029032 Sobic008G028000--Sobic001G412900 Sobic008G027900--Sobic009G091600 Sobic008G027900--Sobic010G006900 Sobic008G027900--Sobic006G263500 Sobic008G027900--Sobic008G028000 Sobic008G027900--Sobic005G023700 Sobic008G027900--Sobic004G029032 Sobic008G027900--Sobic005G025600 Sobic003G400000 Sobic003G400000 Sobic008G027900--Sobic003G400000 Sobic008G027900--Sobic002G066300
Octagon: transcription factors


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