Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G402900.1
Synonym Sb02g041750
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X439
Pfam -
Panther DB PTHR34480 PTHR34480:SF2
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g08090.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G169101 - -
2 Sobic.001G529800 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
3 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
4 Sobic.005G191300 MBTB64 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.007G042800 expressed protein -
6 Sobic.001G525600 fringe-related protein, putative, expressed -
7 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
8 Sobic.002G223650 - -
9 Sobic.007G197000 "Candidate orthologue to the wheat Pm40 gene, probable glucan endo-1,3-betaglucosidase A6"(PubMedID : 27755575)@glucan endo-1,3-beta-glucosidase precursor, putative, expressed -
10 Sobic.001G092500 protein kinase domain containing protein, expressed -
11 Sobic.009G110333 - -
12 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.003G313200 expressed protein -
14 Sobic.005G112500 - -
15 Sobic.003G420500 Ca ATPase 3(PubMedID : 22196357)@calcium-transporting ATPase, plasma membrane-type, putative, expressed K01537: P-type Ca2+ transporter type 2C
16 Sobic.004G099200 kinesin motor domain containing protein, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
17 Sobic.001G392650 - -
18 Sobic.005G037700 OsFBX378 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.002G279900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
20 Sobic.004G258000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic002G402900--Sobic008G169101 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic002G402900--Sobic001G529800 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic002G402900--Sobic001G435300 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic002G402900--Sobic005G191300 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G402900--Sobic007G042800 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic002G402900--Sobic001G525600 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic002G402900--Sobic005G058600 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic002G402900--Sobic002G223650 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic002G402900--Sobic007G197000 Sobic008G169101--Sobic005G191300 Sobic008G169101--Sobic002G402900 Sobic008G169101--Sobic007G042800 Sobic008G169101--Sobic001G525600 Sobic008G169101--Sobic007G197000 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic008G169101--Sobic001G092500 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic008G169101--Sobic009G110700 Sobic003G420500 Sobic003G420500 Sobic008G169101--Sobic003G420500 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic008G169101--Sobic005G037700 Sobic001G529800--Sobic001G525600 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic001G529800--Sobic003G313200 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic001G529800--Sobic006G022700 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic001G529800--Sobic002G279900 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic001G529800--Sobic006G215500 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic001G529800--Sobic004G099200 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic001G529800--Sobic004G071900 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic001G529800--Sobic001G135950 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic001G529800--Sobic002G125100 Sobic001G435300--Sobic008G169101 Sobic001G435300--Sobic002G402900 Sobic001G435300--Sobic005G058600 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic001G435300--Sobic004G042800 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic001G435300--Sobic001G392650 Sobic001G435300--Sobic009G110700 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic001G435300--Sobic002G049700 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic001G435300--Sobic001G366700 Sobic001G435300--Sobic005G191300 Sobic005G191300--Sobic001G092500 Sobic005G191300--Sobic007G042800 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic005G191300--Sobic008G043300 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic005G191300--Sobic005G204600 Sobic010G040400 Sobic010G040400 Sobic005G191300--Sobic010G040400 Sobic010G016200 Sobic010G016200 Sobic005G191300--Sobic010G016200 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic005G191300--Sobic010G276100 Sobic005G191300--Sobic009G110700 Sobic008G043200 Sobic008G043200 Sobic005G191300--Sobic008G043200 Sobic007G042800--Sobic005G191300 Sobic007G042800--Sobic001G092500 Sobic007G042800--Sobic008G043300 Sobic007G042800--Sobic005G204600 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic007G042800--Sobic004G134000 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic007G042800--Sobic009G075400 Sobic007G042800--Sobic010G040400 Sobic007G042800--Sobic010G276100 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic007G042800--Sobic001G109900 Sobic001G525600--Sobic004G099200 Sobic001G525600--Sobic001G135950 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic001G525600--Sobic005G145400 Sobic001G525600--Sobic003G313200 Sobic001G525600--Sobic003G420500 Sobic001G525600--Sobic004G071900 Sobic001G525600--Sobic002G279900 Sobic001G525600--Sobic002G125100 Sobic001G525600--Sobic006G215500 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic002G223650--Sobic003G274100 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic002G223650--Sobic006G276801 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic002G223650--Sobic003G250160 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic002G223650--Sobic007G081701 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic002G223650--Sobic001G467400 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic002G223650--Sobic009G177750 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic002G223650--Sobic004G258000 Sobic002G223650--Sobic007G042800 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic002G223650--Sobic004G075250 Sobic007G197000--Sobic005G037700 Sobic007G197000--Sobic003G420500 Sobic004G192600 Sobic004G192600 Sobic007G197000--Sobic004G192600 Sobic001G089400 Sobic001G089400 Sobic007G197000--Sobic001G089400 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic007G197000--Sobic003G004000 Sobic007G197000--Sobic008G043200 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic007G197000--Sobic007G204200 Sobic007G197000--Sobic005G145400 Sobic007G197000--Sobic001G525600
Octagon: transcription factors


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