Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G021500.1
Synonym Sb02g001990
Functional annotation OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5X8P7
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF131
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G16210 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02890.1 : OsFBX209 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ81982
Barley -
Wheat TraesCS2B02G277100 , TraesCS5A02G487500 , TraesCS2D02G259000 , TraesCS5D02G461200
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G330200 mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim17, putative, expressed K17795: mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17
2 Sobic.001G392650 - -
3 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
4 Sobic.009G158300 - -
5 Sobic.002G406801 - -
6 Sobic.008G134600 - -
7 Sobic.007G042800 expressed protein -
8 Sobic.007G139300 exostosin family domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G099200 kinesin motor domain containing protein, expressed K10406: kinesin family member C2/C3
10 Sobic.003G160600 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.006G236400 glutaredoxin, putative, expressed -
12 Sobic.006G018701 - -
13 Sobic.001G525600 fringe-related protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G158400 - -
15 Sobic.009G060000 WD40-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.009G244100 - -
17 Sobic.002G279900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
18 Sobic.001G092500 protein kinase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.001G529800 phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
20 Sobic.001G366700 villin protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G021500 Sobic002G021500 Sobic002G330200 Sobic002G330200 Sobic002G021500--Sobic002G330200 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic002G021500--Sobic001G392650 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic002G021500--Sobic002G049700 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic002G021500--Sobic009G158300 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic002G021500--Sobic002G406801 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic002G021500--Sobic008G134600 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G021500--Sobic007G042800 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic002G021500--Sobic007G139300 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic002G021500--Sobic004G099200 Sobic002G330200--Sobic001G392650 Sobic002G330200--Sobic002G021500 Sobic002G330200--Sobic002G049700 Sobic002G330200--Sobic007G139300 Sobic002G330200--Sobic002G406801 Sobic002G330200--Sobic009G158300 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic002G330200--Sobic002G279900 Sobic002G330200--Sobic004G099200 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic002G330200--Sobic001G525600 Sobic001G392650--Sobic002G049700 Sobic001G392650--Sobic008G134600 Sobic001G392650--Sobic002G330200 Sobic001G392650--Sobic009G158300 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic001G392650--Sobic003G343000 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic001G392650--Sobic008G124301 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic001G392650--Sobic001G109900 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic009G060000 Sobic001G392650--Sobic007G139300 Sobic002G049700--Sobic001G392650 Sobic002G049700--Sobic008G134600 Sobic002G049700--Sobic009G060000 Sobic002G049700--Sobic009G158300 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic002G049700--Sobic001G092500 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic002G049700--Sobic001G188100 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic002G049700--Sobic004G134000 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic002G049700--Sobic008G043300 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic002G049700--Sobic010G276100 Sobic009G158300--Sobic009G060000 Sobic009G158300--Sobic002G049700 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic009G158300--Sobic006G018701 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic009G158300--Sobic003G160600 Sobic009G158300--Sobic001G392650 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic009G158300--Sobic009G158400 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic009G158300--Sobic003G445600 Sobic009G158300--Sobic008G134600 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic009G158300--Sobic001G409000 Sobic002G406801--Sobic006G018701 Sobic002G406801--Sobic001G392650 Sobic002G406801--Sobic002G330200 Sobic002G406801--Sobic002G021500 Sobic002G406801--Sobic009G158300 Sobic002G406801--Sobic002G049700 Sobic002G406801--Sobic003G160600 Sobic002G406801--Sobic009G060000 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic002G406801--Sobic010G026200 Sobic008G134600--Sobic008G124301 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic008G134600--Sobic003G317600 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic008G134600--Sobic007G175800 Sobic004G294200 Sobic004G294200 Sobic008G134600--Sobic004G294200 Sobic003G164700 Sobic003G164700 Sobic008G134600--Sobic003G164700 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic008G134600--Sobic002G197900 Sobic008G134600--Sobic004G134000 Sobic008G134600--Sobic008G043300 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic008G134600--Sobic001G097000 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic007G042800--Sobic005G191300 Sobic007G042800--Sobic001G092500 Sobic007G042800--Sobic008G043300 Sobic005G204600 Sobic005G204600 Sobic007G042800--Sobic005G204600 Sobic007G042800--Sobic004G134000 Sobic009G075400 Sobic009G075400 Sobic007G042800--Sobic009G075400 Sobic010G040400 Sobic010G040400 Sobic007G042800--Sobic010G040400 Sobic007G042800--Sobic010G276100 Sobic007G042800--Sobic001G109900 Sobic003G405800 Sobic003G405800 Sobic007G139300--Sobic003G405800 Sobic006G062100 Sobic006G062100 Sobic007G139300--Sobic006G062100 Sobic006G176200 Sobic006G176200 Sobic007G139300--Sobic006G176200 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic007G139300--Sobic001G366700 Sobic001G529800 Sobic001G529800 Sobic007G139300--Sobic001G529800 Sobic009G087200 Sobic009G087200 Sobic007G139300--Sobic009G087200 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic007G139300--Sobic001G220800 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic007G139300--Sobic003G313200 Sobic007G139300--Sobic009G158400 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic004G099200--Sobic001G135950 Sobic004G099200--Sobic001G525600 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic004G099200--Sobic004G071900 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic004G099200--Sobic005G145400 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic004G099200--Sobic002G125100 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic004G099200--Sobic006G215500 Sobic004G099200--Sobic003G313200 Sobic004G099200--Sobic010G276100 Sobic004G099200--Sobic002G279900
Octagon: transcription factors


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