Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G060000.1
Synonym Sb09g005066, ATG18D, ATATG18D
Functional annotation WD40-like domain containing protein, putative, expressed
UniProt A0A1B6P6T1
Pfam -
Panther DB PTHR11227 PTHR11227:SF25
NCBI CDD KOG2111; Uncharacterized conserved protein, contains WD40 repeats
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G56440 : homolog of yeast autophagy 18 (ATG18) D
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g07710.1 : WD40-like domain containing protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G158300 - -
2 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
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9 Sobic.009G016900 expressed protein -
10 Sobic.010G051000 "domain confirmed by Pfam database, expressed in flower, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@auxin efflux carrier component, putative, expressed K13947: auxin efflux carrier family protein
11 Sobic.001G332000 pollen allergen, putative, expressed -
12 Sobic.001G269800 - -
13 Sobic.001G130500 - -
14 Sobic.003G175950 - -
15 Sobic.005G040700 amino acid permease family protein, putative, expressed -
16 Sobic.001G306500 expansin precursor, putative, expressed -
17 Sobic.001G024900 expressed protein -
18 Sobic.007G222100 - -
19 Sobic.001G329200 rab GDP dissociation inhibitor alpha, putative, expressed K17255: Rab GDP dissociation inhibitor
20 Sobic.008G134600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic009G060000--Sobic009G158300 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic009G060000--Sobic002G049700 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic009G060000--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic009G060000--Sobic007G001800 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic009G060000--Sobic003G445600 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic009G060000--Sobic003G160600 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic009G060000--Sobic006G164800 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic009G060000--Sobic007G145500 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic009G060000--Sobic009G016900 Sobic009G158300--Sobic009G060000 Sobic009G158300--Sobic002G049700 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic009G158300--Sobic006G018701 Sobic009G158300--Sobic003G160600 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic009G158300--Sobic001G392650 Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic009G158300--Sobic009G158400 Sobic009G158300--Sobic003G445600 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic009G158300--Sobic008G134600 Sobic009G158300--Sobic001G409000 Sobic002G049700--Sobic001G392650 Sobic002G049700--Sobic008G134600 Sobic002G049700--Sobic009G060000 Sobic002G049700--Sobic009G158300 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic002G049700--Sobic001G092500 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic002G049700--Sobic001G188100 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic002G049700--Sobic004G134000 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic002G049700--Sobic008G043300 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic002G049700--Sobic010G276100 Sobic001G409000--Sobic007G001800 Sobic001G409000--Sobic009G016900 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic001G409000--Sobic004G217200 Sobic001G409000--Sobic006G164800 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic001G409000--Sobic004G062300 Sobic008G153700 Sobic008G153700 Sobic001G409000--Sobic008G153700 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic001G409000--Sobic003G394801 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic001G409000--Sobic002G414150 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic001G409000--Sobic001G269600 Sobic007G001800--Sobic001G409000 Sobic007G001800--Sobic004G217200 Sobic007G001800--Sobic006G164800 Sobic007G001800--Sobic009G016900 Sobic007G001800--Sobic001G269600 Sobic001G269700 Sobic001G269700 Sobic007G001800--Sobic001G269700 Sobic007G001800--Sobic003G394801 Sobic002G414300 Sobic002G414300 Sobic007G001800--Sobic002G414300 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic007G001800--Sobic007G167000 Sobic002G303500 Sobic002G303500 Sobic003G445600--Sobic002G303500 Sobic003G445600--Sobic009G016900 Sobic006G282000 Sobic006G282000 Sobic003G445600--Sobic006G282000 Sobic001G097000 Sobic001G097000 Sobic003G445600--Sobic001G097000 Sobic010G229801 Sobic010G229801 Sobic003G445600--Sobic010G229801 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic003G445600--Sobic003G317600 Sobic004G242600 Sobic004G242600 Sobic003G445600--Sobic004G242600 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic003G445600--Sobic007G175800 Sobic004G134600 Sobic004G134600 Sobic003G445600--Sobic004G134600 Sobic003G160600--Sobic003G445600 Sobic003G160600--Sobic009G158300 Sobic003G160600--Sobic008G134600 Sobic003G160600--Sobic009G016900 Sobic003G160600--Sobic001G409000 Sobic003G160600--Sobic009G060000 Sobic003G160600--Sobic006G018701 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic003G160600--Sobic008G124301 Sobic003G160600--Sobic002G049700 Sobic006G164800--Sobic004G062300 Sobic006G164800--Sobic007G001800 Sobic006G164800--Sobic004G217200 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic006G164800--Sobic004G293300 Sobic006G164800--Sobic001G409000 Sobic006G164800--Sobic003G394801 Sobic006G164800--Sobic007G167000 Sobic003G175600 Sobic003G175600 Sobic006G164800--Sobic003G175600 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic006G164800--Sobic002G053800 Sobic001G165700 Sobic001G165700 Sobic007G145500--Sobic001G165700 Sobic001G171300 Sobic001G171300 Sobic007G145500--Sobic001G171300 Sobic001G287400 Sobic001G287400 Sobic007G145500--Sobic001G287400 Sobic001G261416 Sobic001G261416 Sobic007G145500--Sobic001G261416 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic007G145500--Sobic010G215000 Sobic001G329200 Sobic001G329200 Sobic007G145500--Sobic001G329200 Sobic003G175950 Sobic003G175950 Sobic007G145500--Sobic003G175950 Sobic001G130500 Sobic001G130500 Sobic007G145500--Sobic001G130500 Sobic006G005300 Sobic006G005300 Sobic007G145500--Sobic006G005300 Sobic009G016900--Sobic004G217200 Sobic009G016900--Sobic001G409000 Sobic009G016900--Sobic007G001800 Sobic009G016900--Sobic003G394801 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic009G016900--Sobic005G204500 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic009G016900--Sobic006G142200 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic009G016900--Sobic005G006300 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic009G016900--Sobic006G195000 Sobic004G049300 Sobic004G049300 Sobic009G016900--Sobic004G049300
Octagon: transcription factors


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