Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G001800.1
Synonym Sb07g000360
Functional annotation harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
UniProt C5YLD6
Pfam PF03168
Panther DB PTHR31415 PTHR31415:SF21
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G35460 : Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g58850.1 : harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a040115
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic007G001800--Sobic001G409000 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic007G001800--Sobic004G217200 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic007G001800--Sobic006G164800 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic007G001800--Sobic009G016900 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic007G001800--Sobic001G269600 Sobic001G269700 Sobic001G269700 Sobic007G001800--Sobic001G269700 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic007G001800--Sobic003G394801 Sobic002G414300 Sobic002G414300 Sobic007G001800--Sobic002G414300 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic007G001800--Sobic007G167000 Sobic001G409000--Sobic007G001800 Sobic001G409000--Sobic009G016900 Sobic001G409000--Sobic004G217200 Sobic001G409000--Sobic006G164800 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic001G409000--Sobic004G062300 Sobic008G153700 Sobic008G153700 Sobic001G409000--Sobic008G153700 Sobic001G409000--Sobic003G394801 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic001G409000--Sobic002G414150 Sobic001G409000--Sobic001G269600 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic004G217200--Sobic005G006300 Sobic004G217200--Sobic002G414150 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic004G217200--Sobic006G142200 Sobic004G217200--Sobic003G394801 Sobic001G269400 Sobic001G269400 Sobic004G217200--Sobic001G269400 Sobic005G009500 Sobic005G009500 Sobic004G217200--Sobic005G009500 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic004G217200--Sobic005G204500 Sobic004G217200--Sobic001G269600 Sobic004G217200--Sobic001G269700 Sobic006G164800--Sobic004G062300 Sobic006G164800--Sobic007G001800 Sobic006G164800--Sobic004G217200 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic006G164800--Sobic004G293300 Sobic006G164800--Sobic001G409000 Sobic006G164800--Sobic003G394801 Sobic006G164800--Sobic007G167000 Sobic003G175600 Sobic003G175600 Sobic006G164800--Sobic003G175600 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic006G164800--Sobic002G053800 Sobic009G016900--Sobic004G217200 Sobic009G016900--Sobic001G409000 Sobic009G016900--Sobic007G001800 Sobic009G016900--Sobic003G394801 Sobic009G016900--Sobic005G204500 Sobic009G016900--Sobic006G142200 Sobic009G016900--Sobic005G006300 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic009G016900--Sobic006G195000 Sobic004G049300 Sobic004G049300 Sobic009G016900--Sobic004G049300 Sobic001G269600--Sobic001G269700 Sobic001G269600--Sobic002G414300 Sobic001G269600--Sobic001G269400 Sobic001G269600--Sobic007G167000 Sobic001G269600--Sobic002G414150 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic001G269600--Sobic010G107800 Sobic009G097000 Sobic009G097000 Sobic001G269600--Sobic009G097000 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic001G269600--Sobic001G269200 Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic001G269600--Sobic007G129800 Sobic001G269700--Sobic001G269600 Sobic001G269700--Sobic002G414300 Sobic001G269700--Sobic001G269400 Sobic001G269700--Sobic002G414150 Sobic001G269700--Sobic007G167000 Sobic001G269700--Sobic009G097000 Sobic001G269700--Sobic010G107800 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic001G269700--Sobic001G094700 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic003G394801--Sobic001G306200 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic003G394801--Sobic009G169500 Sobic003G394801--Sobic005G006300 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic005G204500 Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic003G394801--Sobic005G142400 Sobic003G394801--Sobic002G414150 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic006G142200 Sobic002G414300--Sobic001G269700 Sobic002G414300--Sobic001G269600 Sobic002G414300--Sobic001G269400 Sobic002G414300--Sobic010G107800 Sobic002G414300--Sobic007G167000 Sobic002G414300--Sobic009G097000 Sobic002G414300--Sobic007G129800 Sobic002G414300--Sobic001G094700 Sobic007G167000--Sobic001G269600 Sobic007G167000--Sobic001G269200 Sobic007G167000--Sobic010G107800 Sobic007G167000--Sobic001G269700 Sobic007G167000--Sobic002G414300 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic007G167000--Sobic005G220500 Sobic007G167000--Sobic007G129800 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic007G167000--Sobic002G082400 Sobic007G167000--Sobic003G175600
Octagon: transcription factors


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