Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G129800.1
Synonym Sb07g020560
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YKZ8
Pfam -
Panther DB PTHR11439 PTHR11439:SF161
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00980 : zinc knuckle (CCHC-type) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g32550.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.009G097000 - -


Gene co-expression network
sample Sobic007G129800 Sobic007G129800 Sobic010G107800 Sobic010G107800 Sobic007G129800--Sobic010G107800 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic007G129800--Sobic001G269200 Sobic002G414300 Sobic002G414300 Sobic007G129800--Sobic002G414300 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic007G129800--Sobic007G167000 Sobic002G414000 Sobic002G414000 Sobic007G129800--Sobic002G414000 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic007G129800--Sobic005G220500 Sobic001G269700 Sobic001G269700 Sobic007G129800--Sobic001G269700 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic007G129800--Sobic001G269600 Sobic006G043101 Sobic006G043101 Sobic007G129800--Sobic006G043101 Sobic010G107800--Sobic007G129800 Sobic010G107800--Sobic001G269200 Sobic010G107800--Sobic007G167000 Sobic010G107800--Sobic002G414300 Sobic010G107800--Sobic002G414000 Sobic010G107800--Sobic005G220500 Sobic010G107800--Sobic001G269700 Sobic010G107800--Sobic001G269600 Sobic010G107800--Sobic006G043101 Sobic001G269200--Sobic005G220500 Sobic001G269200--Sobic010G107800 Sobic001G269200--Sobic007G129800 Sobic001G269200--Sobic002G414000 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic001G269200--Sobic002G082400 Sobic001G269200--Sobic007G167000 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic001G269200--Sobic003G445300 Sobic001G269200--Sobic006G043101 Sobic005G220400 Sobic005G220400 Sobic001G269200--Sobic005G220400 Sobic002G414300--Sobic001G269700 Sobic002G414300--Sobic001G269600 Sobic001G269400 Sobic001G269400 Sobic002G414300--Sobic001G269400 Sobic002G414300--Sobic010G107800 Sobic002G414300--Sobic007G167000 Sobic009G097000 Sobic009G097000 Sobic002G414300--Sobic009G097000 Sobic002G414300--Sobic007G129800 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic002G414300--Sobic001G094700 Sobic007G167000--Sobic001G269600 Sobic007G167000--Sobic001G269200 Sobic007G167000--Sobic010G107800 Sobic007G167000--Sobic001G269700 Sobic007G167000--Sobic002G414300 Sobic007G167000--Sobic005G220500 Sobic007G167000--Sobic007G129800 Sobic007G167000--Sobic002G082400 Sobic003G175600 Sobic003G175600 Sobic007G167000--Sobic003G175600 Sobic002G414000--Sobic006G043101 Sobic005G214800 Sobic005G214800 Sobic002G414000--Sobic005G214800 Sobic001G246001 Sobic001G246001 Sobic002G414000--Sobic001G246001 Sobic002G414000--Sobic005G220400 Sobic002G414000--Sobic001G269200 Sobic002G414000--Sobic003G445300 Sobic002G414000--Sobic005G220500 Sobic002G414000--Sobic010G107800 Sobic002G414000--Sobic002G082400 Sobic005G220500--Sobic002G082400 Sobic005G220500--Sobic001G269200 Sobic005G220500--Sobic003G445300 Sobic005G220500--Sobic005G220400 Sobic005G220500--Sobic002G414000 Sobic005G220500--Sobic003G175600 Sobic005G220500--Sobic007G167000 Sobic005G220500--Sobic006G043101 Sobic005G220500--Sobic010G107800 Sobic001G269700--Sobic001G269600 Sobic001G269700--Sobic002G414300 Sobic001G269700--Sobic001G269400 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic001G269700--Sobic002G414150 Sobic001G269700--Sobic007G167000 Sobic001G269700--Sobic009G097000 Sobic001G269700--Sobic010G107800 Sobic001G269700--Sobic001G094700 Sobic001G269600--Sobic001G269700 Sobic001G269600--Sobic002G414300 Sobic001G269600--Sobic001G269400 Sobic001G269600--Sobic007G167000 Sobic001G269600--Sobic002G414150 Sobic001G269600--Sobic010G107800 Sobic001G269600--Sobic009G097000 Sobic001G269600--Sobic001G269200 Sobic001G269600--Sobic007G129800 Sobic006G043101--Sobic002G414000 Sobic006G043101--Sobic005G214800 Sobic006G043101--Sobic001G246001 Sobic006G043101--Sobic001G269200 Sobic006G043101--Sobic005G220400 Sobic006G043101--Sobic003G445300 Sobic006G043101--Sobic005G220500 Sobic006G043101--Sobic010G107800 Sobic006G043101--Sobic002G082400
Octagon: transcription factors


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