Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G006300.2
Synonym MEE55
Functional annotation TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RGY5
Pfam PF03348
Panther DB PTHR10383
NCBI CDD KOG2592; Tumor differentially expressed (TDE) protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016020; membrane


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G24460 : Serinc-domain containing serine and sphingolipid biosynthesis protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g08460.1 : TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G142200 Lung seven transmembrane receptor domain containing protein, putative, expressed -
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20 Sobic.004G293300 zinc-binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic005G006300--Sobic006G142200 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic005G006300--Sobic002G414150 Sobic005G009500 Sobic005G009500 Sobic005G006300--Sobic005G009500 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic005G006300--Sobic005G204500 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic005G006300--Sobic003G394801 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic005G006300--Sobic009G169500 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic005G006300--Sobic001G306200 Sobic001G269400 Sobic001G269400 Sobic005G006300--Sobic001G269400 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic005G006300--Sobic005G110120 Sobic006G142200--Sobic005G006300 Sobic006G142200--Sobic005G009500 Sobic006G142200--Sobic005G204500 Sobic006G142200--Sobic002G414150 Sobic006G142200--Sobic009G169500 Sobic006G142200--Sobic003G394801 Sobic006G142200--Sobic001G306200 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic006G142200--Sobic006G195000 Sobic006G142200--Sobic001G269400 Sobic002G414150--Sobic001G269400 Sobic002G414150--Sobic005G009500 Sobic002G414150--Sobic005G006300 Sobic002G414150--Sobic006G142200 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic002G414150--Sobic001G269600 Sobic001G269700 Sobic001G269700 Sobic002G414150--Sobic001G269700 Sobic002G414150--Sobic003G394801 Sobic002G414150--Sobic009G169500 Sobic002G414150--Sobic001G306200 Sobic005G009500--Sobic006G142200 Sobic005G009500--Sobic002G414150 Sobic005G009500--Sobic005G006300 Sobic005G009500--Sobic005G204500 Sobic005G009500--Sobic009G169500 Sobic005G009500--Sobic001G269400 Sobic005G009500--Sobic001G306200 Sobic005G009500--Sobic003G394801 Sobic005G009500--Sobic005G110120 Sobic005G204500--Sobic006G142200 Sobic005G204500--Sobic005G006300 Sobic005G204500--Sobic009G169500 Sobic005G204500--Sobic006G195000 Sobic005G204500--Sobic001G306200 Sobic005G204500--Sobic003G394801 Sobic005G204500--Sobic005G009500 Sobic005G204500--Sobic005G110120 Sobic010G162700 Sobic010G162700 Sobic005G204500--Sobic010G162700 Sobic003G394801--Sobic001G306200 Sobic003G394801--Sobic009G169500 Sobic003G394801--Sobic005G006300 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic005G204500 Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic003G394801--Sobic005G142400 Sobic003G394801--Sobic002G414150 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic006G142200 Sobic009G169500--Sobic001G306200 Sobic009G169500--Sobic003G394801 Sobic009G169500--Sobic005G204500 Sobic009G169500--Sobic005G110120 Sobic009G169500--Sobic005G142400 Sobic009G169500--Sobic008G154300 Sobic009G169500--Sobic010G162700 Sobic009G169500--Sobic006G195000 Sobic009G169500--Sobic005G006300 Sobic001G306200--Sobic009G169500 Sobic001G306200--Sobic003G394801 Sobic001G306200--Sobic005G142400 Sobic001G306200--Sobic008G154300 Sobic001G306200--Sobic005G204500 Sobic009G091300 Sobic009G091300 Sobic001G306200--Sobic009G091300 Sobic001G306200--Sobic010G162700 Sobic001G306200--Sobic005G110120 Sobic001G306200--Sobic005G006300 Sobic001G269400--Sobic001G269700 Sobic001G269400--Sobic002G414150 Sobic001G269400--Sobic001G269600 Sobic002G414300 Sobic002G414300 Sobic001G269400--Sobic002G414300 Sobic001G269400--Sobic005G009500 Sobic009G097000 Sobic009G097000 Sobic001G269400--Sobic009G097000 Sobic001G269400--Sobic005G006300 Sobic001G094700 Sobic001G094700 Sobic001G269400--Sobic001G094700 Sobic005G110120--Sobic009G169500 Sobic005G110120--Sobic009G091300 Sobic005G110120--Sobic001G306200 Sobic005G110120--Sobic005G204500 Sobic005G110120--Sobic006G195000 Sobic006G236300 Sobic006G236300 Sobic005G110120--Sobic006G236300 Sobic005G110120--Sobic010G162700 Sobic005G110120--Sobic005G009500 Sobic005G110120--Sobic005G006300
Octagon: transcription factors


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