Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G204500.1
Synonym
Functional annotation uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed
UniProt A0A1B6PTP7
Pfam PF08263
Panther DB PTHR32093 PTHR32093:SF34
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19020 : Leucine-rich repeat (LRR) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g35710.1 : uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029203 , Zm00025a054345
Brachypodium KQK17443 , PNT63078
Barley HORVU1Hr1G002420.3 , HORVU1Hr1G002420.2 , HORVU1Hr1G002420.1 , HORVU1Hr1G002420.6 , HORVU1Hr1G002420.5 , HORVU1Hr1G002420.4 , HORVU5Hr1G024380.2 , HORVU5Hr1G024380.3 , HORVU5Hr1G024380.1 , HORVU5Hr1G024380.4 , HORVU5Hr1G024380.5
Wheat TraesCS6B02G136600 , TraesCS1D02G011400
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G142200 Lung seven transmembrane receptor domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G006300 TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed -
3 Sobic.009G169500 DEFL4 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
4 Sobic.006G195000 purine permease, putative, expressed -
5 Sobic.001G306200 expansin precursor, putative, expressed -
6 Sobic.003G394801 - -
7 Sobic.005G009500 expressed protein -
8 Sobic.005G110120 - -
9 Sobic.010G162700 reticuline oxidase-like protein precursor, putative, expressed -
10 Sobic.002G414150 - -
11 Sobic.006G236300 Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@pectinesterase, putative, expressed -
12 Sobic.005G142400 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
13 Sobic.007G112400 polygalacturonase, putative, expressed -
14 Sobic.008G154300 flavin monooxygenase, putative, expressed -
15 Sobic.009G091300 - -
16 Sobic.001G269400 - -
17 Sobic.004G217200 Lung seven transmembrane receptor domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.010G091800 expressed protein -
19 Sobic.008G017500 - -
20 Sobic.004G293300 zinc-binding protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic005G204500--Sobic006G142200 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic005G204500--Sobic005G006300 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic005G204500--Sobic009G169500 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic005G204500--Sobic006G195000 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic005G204500--Sobic001G306200 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic005G204500--Sobic003G394801 Sobic005G009500 Sobic005G009500 Sobic005G204500--Sobic005G009500 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic005G204500--Sobic005G110120 Sobic010G162700 Sobic010G162700 Sobic005G204500--Sobic010G162700 Sobic006G142200--Sobic005G006300 Sobic006G142200--Sobic005G009500 Sobic006G142200--Sobic005G204500 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic006G142200--Sobic002G414150 Sobic006G142200--Sobic009G169500 Sobic006G142200--Sobic003G394801 Sobic006G142200--Sobic001G306200 Sobic006G142200--Sobic006G195000 Sobic001G269400 Sobic001G269400 Sobic006G142200--Sobic001G269400 Sobic005G006300--Sobic006G142200 Sobic005G006300--Sobic002G414150 Sobic005G006300--Sobic005G009500 Sobic005G006300--Sobic005G204500 Sobic005G006300--Sobic003G394801 Sobic005G006300--Sobic009G169500 Sobic005G006300--Sobic001G306200 Sobic005G006300--Sobic001G269400 Sobic005G006300--Sobic005G110120 Sobic009G169500--Sobic001G306200 Sobic009G169500--Sobic003G394801 Sobic009G169500--Sobic005G204500 Sobic009G169500--Sobic005G110120 Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic009G169500--Sobic005G142400 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic009G169500--Sobic008G154300 Sobic009G169500--Sobic010G162700 Sobic009G169500--Sobic006G195000 Sobic009G169500--Sobic005G006300 Sobic006G195000--Sobic010G162700 Sobic006G236300 Sobic006G236300 Sobic006G195000--Sobic006G236300 Sobic007G112400 Sobic007G112400 Sobic006G195000--Sobic007G112400 Sobic006G195000--Sobic005G204500 Sobic006G195000--Sobic009G169500 Sobic006G195000--Sobic001G306200 Sobic006G195000--Sobic005G110120 Sobic006G195000--Sobic006G142200 Sobic006G195000--Sobic005G142400 Sobic001G306200--Sobic009G169500 Sobic001G306200--Sobic003G394801 Sobic001G306200--Sobic005G142400 Sobic001G306200--Sobic008G154300 Sobic001G306200--Sobic005G204500 Sobic009G091300 Sobic009G091300 Sobic001G306200--Sobic009G091300 Sobic001G306200--Sobic010G162700 Sobic001G306200--Sobic005G110120 Sobic001G306200--Sobic005G006300 Sobic003G394801--Sobic001G306200 Sobic003G394801--Sobic009G169500 Sobic003G394801--Sobic005G006300 Sobic003G394801--Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic005G204500 Sobic003G394801--Sobic005G142400 Sobic003G394801--Sobic002G414150 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic010G091800 Sobic003G394801--Sobic006G142200 Sobic005G009500--Sobic006G142200 Sobic005G009500--Sobic002G414150 Sobic005G009500--Sobic005G006300 Sobic005G009500--Sobic005G204500 Sobic005G009500--Sobic009G169500 Sobic005G009500--Sobic001G269400 Sobic005G009500--Sobic001G306200 Sobic005G009500--Sobic003G394801 Sobic005G009500--Sobic005G110120 Sobic005G110120--Sobic009G169500 Sobic005G110120--Sobic009G091300 Sobic005G110120--Sobic001G306200 Sobic005G110120--Sobic005G204500 Sobic005G110120--Sobic006G195000 Sobic005G110120--Sobic006G236300 Sobic005G110120--Sobic010G162700 Sobic005G110120--Sobic005G009500 Sobic005G110120--Sobic005G006300 Sobic010G162700--Sobic006G236300 Sobic010G162700--Sobic006G195000 Sobic010G162700--Sobic007G112400 Sobic010G162700--Sobic009G169500 Sobic010G162700--Sobic001G306200 Sobic010G162700--Sobic005G204500 Sobic010G162700--Sobic005G142400 Sobic010G162700--Sobic005G110120 Sobic010G162700--Sobic008G154300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.