Gene annotation
Transcriptome id
Sobic.009G091300.3
Synonym
YSL7, Sb09g009580
Functional annotation
-
UniProt
A0A1Z5R2P4
Pfam
PF03169
Panther DB
PTHR31645
PTHR31645:SF9
NCBI CDD
-
KEGG Orthology
-
Gene Ontology
-
Orthologs (automatic annotation)
TAIR
AT1G65730 : YELLOW STRIPE like 7
RAP-DB (Rice)
LOC_Os05g16290.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn)
Zm00025a037142
Brachypodium
-
Barley
-
Wheat
-
Populus
-
JBrowse
Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot
Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles
Rank
Gene
Function
KEGG orthology
1
Sobic.005G142400
plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
-
2
Sobic.001G306200
expansin precursor, putative, expressed
-
3
Sobic.009G169500
DEFL4 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
-
4
Sobic.005G110120
-
-
5
Sobic.008G154300
flavin monooxygenase, putative, expressed
-
6
Sobic.001G269800
-
-
7
Sobic.003G394801
-
-
8
Sobic.010G091800
expressed protein
-
9
Sobic.001G306400
expansin precursor, putative, expressed
-
10
Sobic.007G112400
polygalacturonase, putative, expressed
-
11
Sobic.006G236300
Up-reguralion under heat(PubMedID : 24916767)@Up-reguralion under combine stress of drought and heat(PubMedID : 24916767)@pectinesterase, putative, expressed
-
12
Sobic.005G204500
uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed
-
13
Sobic.006G195000
purine permease, putative, expressed
-
14
Sobic.010G162700
reticuline oxidase-like protein precursor, putative, expressed
-
15
Sobic.005G006300
TMS membrane protein/tumour differentially expressed protein, putative, expressed
-
16
Sobic.004G293300
zinc-binding protein, putative, expressed
-
17
Sobic.002G053800
glycosyl hydrolase family 10 protein, putative, expressed
-
18
Sobic.005G009500
expressed protein
-
19
Sobic.008G017500
-
-
20
Sobic.006G142200
Lung seven transmembrane receptor domain containing protein, putative, expressed
-
Gene co-expression network
sample
Sobic009G091300
Sobic009G091300
Sobic005G142400
Sobic005G142400
Sobic009G091300--Sobic005G142400
Sobic001G306200
Sobic001G306200
Sobic009G091300--Sobic001G306200
Sobic009G169500
Sobic009G169500
Sobic009G091300--Sobic009G169500
Sobic005G110120
Sobic005G110120
Sobic009G091300--Sobic005G110120
Sobic008G154300
Sobic008G154300
Sobic009G091300--Sobic008G154300
Sobic001G269800
Sobic001G269800
Sobic009G091300--Sobic001G269800
Sobic003G394801
Sobic003G394801
Sobic009G091300--Sobic003G394801
Sobic010G091800
Sobic010G091800
Sobic009G091300--Sobic010G091800
Sobic001G306400
Sobic001G306400
Sobic009G091300--Sobic001G306400
Sobic005G142400--Sobic008G154300
Sobic005G142400--Sobic001G306200
Sobic005G142400--Sobic009G169500
Sobic005G142400--Sobic009G091300
Sobic005G142400--Sobic001G306400
Sobic005G142400--Sobic003G394801
Sobic007G112400
Sobic007G112400
Sobic005G142400--Sobic007G112400
Sobic006G236300
Sobic006G236300
Sobic005G142400--Sobic006G236300
Sobic010G162700
Sobic010G162700
Sobic005G142400--Sobic010G162700
Sobic001G306200--Sobic009G169500
Sobic001G306200--Sobic003G394801
Sobic001G306200--Sobic005G142400
Sobic001G306200--Sobic008G154300
Sobic005G204500
Sobic005G204500
Sobic001G306200--Sobic005G204500
Sobic001G306200--Sobic009G091300
Sobic001G306200--Sobic010G162700
Sobic001G306200--Sobic005G110120
Sobic005G006300
Sobic005G006300
Sobic001G306200--Sobic005G006300
Sobic009G169500--Sobic001G306200
Sobic009G169500--Sobic003G394801
Sobic009G169500--Sobic005G204500
Sobic009G169500--Sobic005G110120
Sobic009G169500--Sobic005G142400
Sobic009G169500--Sobic008G154300
Sobic009G169500--Sobic010G162700
Sobic006G195000
Sobic006G195000
Sobic009G169500--Sobic006G195000
Sobic009G169500--Sobic005G006300
Sobic005G110120--Sobic009G169500
Sobic005G110120--Sobic009G091300
Sobic005G110120--Sobic001G306200
Sobic005G110120--Sobic005G204500
Sobic005G110120--Sobic006G195000
Sobic005G110120--Sobic006G236300
Sobic005G110120--Sobic010G162700
Sobic005G009500
Sobic005G009500
Sobic005G110120--Sobic005G009500
Sobic005G110120--Sobic005G006300
Sobic008G154300--Sobic005G142400
Sobic008G154300--Sobic001G306200
Sobic008G017500
Sobic008G017500
Sobic008G154300--Sobic008G017500
Sobic008G154300--Sobic010G091800
Sobic008G154300--Sobic003G394801
Sobic008G154300--Sobic001G306400
Sobic008G154300--Sobic009G169500
Sobic002G053800
Sobic002G053800
Sobic008G154300--Sobic002G053800
Sobic008G154300--Sobic001G269800
Sobic001G269800--Sobic010G091800
Sobic001G269800--Sobic001G306400
Sobic001G269800--Sobic008G154300
Sobic001G269800--Sobic005G142400
Sobic001G269800--Sobic009G091300
Sobic001G269800--Sobic002G053800
Sobic004G293300
Sobic004G293300
Sobic001G269800--Sobic004G293300
Sobic009G203900
Sobic009G203900
Sobic001G269800--Sobic009G203900
Sobic001G024900
Sobic001G024900
Sobic001G269800--Sobic001G024900
Sobic003G394801--Sobic001G306200
Sobic003G394801--Sobic009G169500
Sobic003G394801--Sobic005G006300
Sobic003G394801--Sobic008G154300
Sobic003G394801--Sobic005G204500
Sobic003G394801--Sobic005G142400
Sobic002G414150
Sobic002G414150
Sobic003G394801--Sobic002G414150
Sobic003G394801--Sobic010G091800
Sobic006G142200
Sobic006G142200
Sobic003G394801--Sobic006G142200
Sobic010G091800--Sobic002G053800
Sobic010G091800--Sobic008G154300
Sobic010G091800--Sobic004G293300
Sobic010G091800--Sobic001G269800
Sobic010G091800--Sobic003G394801
Sobic010G091800--Sobic008G017500
Sobic010G091800--Sobic001G306200
Sobic010G091800--Sobic005G142400
Sobic003G175600
Sobic003G175600
Sobic010G091800--Sobic003G175600
Sobic001G306400--Sobic005G142400
Sobic001G306400--Sobic008G154300
Sobic006G159000
Sobic006G159000
Sobic001G306400--Sobic006G159000
Sobic001G306400--Sobic001G269800
Sobic001G306400--Sobic008G017500
Sobic001G306400--Sobic001G024900
Sobic001G306400--Sobic002G053800
Sobic001G306400--Sobic010G091800
Sobic001G306500
Sobic001G306500
Sobic001G306400--Sobic001G306500
Octagon: transcription factors