Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G091800.1
Synonym Sb10g008010
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Z725
Pfam -
Panther DB PTHR11439 PTHR11439:SF161
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G00980 : zinc knuckle (CCHC-type) family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g32560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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9 Sobic.003G175600 plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
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15 Sobic.002G414150 - -
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17 Sobic.001G269600 - -
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19 Sobic.007G222100 - -
20 Sobic.005G204500 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic010G091800--Sobic002G053800 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic010G091800--Sobic008G154300 Sobic004G293300 Sobic004G293300 Sobic010G091800--Sobic004G293300 Sobic001G269800 Sobic001G269800 Sobic010G091800--Sobic001G269800 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic010G091800--Sobic003G394801 Sobic008G017500 Sobic008G017500 Sobic010G091800--Sobic008G017500 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic010G091800--Sobic001G306200 Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic010G091800--Sobic005G142400 Sobic003G175600 Sobic003G175600 Sobic010G091800--Sobic003G175600 Sobic002G053800--Sobic010G091800 Sobic002G053800--Sobic004G293300 Sobic002G053800--Sobic008G017500 Sobic009G203900 Sobic009G203900 Sobic002G053800--Sobic009G203900 Sobic002G053800--Sobic008G154300 Sobic002G053800--Sobic001G269800 Sobic002G053800--Sobic003G175600 Sobic006G282100 Sobic006G282100 Sobic002G053800--Sobic006G282100 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic002G053800--Sobic001G306400 Sobic008G154300--Sobic005G142400 Sobic008G154300--Sobic001G306200 Sobic008G154300--Sobic008G017500 Sobic008G154300--Sobic010G091800 Sobic008G154300--Sobic003G394801 Sobic008G154300--Sobic001G306400 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic008G154300--Sobic009G169500 Sobic008G154300--Sobic002G053800 Sobic008G154300--Sobic001G269800 Sobic004G293300--Sobic002G053800 Sobic004G293300--Sobic010G091800 Sobic004G293300--Sobic009G203900 Sobic004G293300--Sobic001G269800 Sobic004G293300--Sobic003G175600 Sobic004G293300--Sobic008G017500 Sobic004G293300--Sobic006G282100 Sobic004G293300--Sobic008G154300 Sobic004G293300--Sobic003G394801 Sobic001G269800--Sobic010G091800 Sobic001G269800--Sobic001G306400 Sobic001G269800--Sobic008G154300 Sobic001G269800--Sobic005G142400 Sobic009G091300 Sobic009G091300 Sobic001G269800--Sobic009G091300 Sobic001G269800--Sobic002G053800 Sobic001G269800--Sobic004G293300 Sobic001G269800--Sobic009G203900 Sobic001G024900 Sobic001G024900 Sobic001G269800--Sobic001G024900 Sobic003G394801--Sobic001G306200 Sobic003G394801--Sobic009G169500 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic003G394801--Sobic005G006300 Sobic003G394801--Sobic008G154300 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic003G394801--Sobic005G204500 Sobic003G394801--Sobic005G142400 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic003G394801--Sobic002G414150 Sobic003G394801--Sobic010G091800 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic003G394801--Sobic006G142200 Sobic008G017500--Sobic008G154300 Sobic008G017500--Sobic002G053800 Sobic008G017500--Sobic010G091800 Sobic008G017500--Sobic005G142400 Sobic008G017500--Sobic001G306400 Sobic008G017500--Sobic004G293300 Sobic008G017500--Sobic003G394801 Sobic008G017500--Sobic001G306200 Sobic008G017500--Sobic001G269800 Sobic001G306200--Sobic009G169500 Sobic001G306200--Sobic003G394801 Sobic001G306200--Sobic005G142400 Sobic001G306200--Sobic008G154300 Sobic001G306200--Sobic005G204500 Sobic001G306200--Sobic009G091300 Sobic010G162700 Sobic010G162700 Sobic001G306200--Sobic010G162700 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic001G306200--Sobic005G110120 Sobic001G306200--Sobic005G006300 Sobic005G142400--Sobic008G154300 Sobic005G142400--Sobic001G306200 Sobic005G142400--Sobic009G169500 Sobic005G142400--Sobic009G091300 Sobic005G142400--Sobic001G306400 Sobic005G142400--Sobic003G394801 Sobic007G112400 Sobic007G112400 Sobic005G142400--Sobic007G112400 Sobic006G236300 Sobic006G236300 Sobic005G142400--Sobic006G236300 Sobic005G142400--Sobic010G162700 Sobic005G220500 Sobic005G220500 Sobic003G175600--Sobic005G220500 Sobic002G082400 Sobic002G082400 Sobic003G175600--Sobic002G082400 Sobic003G175600--Sobic009G203900 Sobic003G175600--Sobic002G053800 Sobic003G175600--Sobic004G293300 Sobic003G175600--Sobic010G091800 Sobic007G167000 Sobic007G167000 Sobic003G175600--Sobic007G167000 Sobic001G269200 Sobic001G269200 Sobic003G175600--Sobic001G269200 Sobic003G445300 Sobic003G445300 Sobic003G175600--Sobic003G445300
Octagon: transcription factors


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