Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G142400.1
Synonym Sb05g020770
Functional annotation plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PTX3
Pfam PF03140
Panther DB PTHR31549 PTHR31549:SF19
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G50170 : Plant protein of unknown function (DUF247)
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g34090.1 : plant protein of unknown function domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a033558
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6B02G285000 , TraesCS6B02G285000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G154300 flavin monooxygenase, putative, expressed -
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10 Sobic.001G269800 - -
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14 Sobic.005G110120 - -
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Gene co-expression network
sample Sobic005G142400 Sobic005G142400 Sobic008G154300 Sobic008G154300 Sobic005G142400--Sobic008G154300 Sobic001G306200 Sobic001G306200 Sobic005G142400--Sobic001G306200 Sobic009G169500 Sobic009G169500 Sobic005G142400--Sobic009G169500 Sobic009G091300 Sobic009G091300 Sobic005G142400--Sobic009G091300 Sobic001G306400 Sobic001G306400 Sobic005G142400--Sobic001G306400 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic005G142400--Sobic003G394801 Sobic007G112400 Sobic007G112400 Sobic005G142400--Sobic007G112400 Sobic006G236300 Sobic006G236300 Sobic005G142400--Sobic006G236300 Sobic010G162700 Sobic010G162700 Sobic005G142400--Sobic010G162700 Sobic008G154300--Sobic005G142400 Sobic008G154300--Sobic001G306200 Sobic008G017500 Sobic008G017500 Sobic008G154300--Sobic008G017500 Sobic010G091800 Sobic010G091800 Sobic008G154300--Sobic010G091800 Sobic008G154300--Sobic003G394801 Sobic008G154300--Sobic001G306400 Sobic008G154300--Sobic009G169500 Sobic002G053800 Sobic002G053800 Sobic008G154300--Sobic002G053800 Sobic001G269800 Sobic001G269800 Sobic008G154300--Sobic001G269800 Sobic001G306200--Sobic009G169500 Sobic001G306200--Sobic003G394801 Sobic001G306200--Sobic005G142400 Sobic001G306200--Sobic008G154300 Sobic005G204500 Sobic005G204500 Sobic001G306200--Sobic005G204500 Sobic001G306200--Sobic009G091300 Sobic001G306200--Sobic010G162700 Sobic005G110120 Sobic005G110120 Sobic001G306200--Sobic005G110120 Sobic005G006300 Sobic005G006300 Sobic001G306200--Sobic005G006300 Sobic009G169500--Sobic001G306200 Sobic009G169500--Sobic003G394801 Sobic009G169500--Sobic005G204500 Sobic009G169500--Sobic005G110120 Sobic009G169500--Sobic005G142400 Sobic009G169500--Sobic008G154300 Sobic009G169500--Sobic010G162700 Sobic006G195000 Sobic006G195000 Sobic009G169500--Sobic006G195000 Sobic009G169500--Sobic005G006300 Sobic009G091300--Sobic005G142400 Sobic009G091300--Sobic001G306200 Sobic009G091300--Sobic009G169500 Sobic009G091300--Sobic005G110120 Sobic009G091300--Sobic008G154300 Sobic009G091300--Sobic001G269800 Sobic009G091300--Sobic003G394801 Sobic009G091300--Sobic010G091800 Sobic009G091300--Sobic001G306400 Sobic001G306400--Sobic005G142400 Sobic001G306400--Sobic008G154300 Sobic006G159000 Sobic006G159000 Sobic001G306400--Sobic006G159000 Sobic001G306400--Sobic001G269800 Sobic001G306400--Sobic008G017500 Sobic001G024900 Sobic001G024900 Sobic001G306400--Sobic001G024900 Sobic001G306400--Sobic002G053800 Sobic001G306400--Sobic010G091800 Sobic001G306500 Sobic001G306500 Sobic001G306400--Sobic001G306500 Sobic003G394801--Sobic001G306200 Sobic003G394801--Sobic009G169500 Sobic003G394801--Sobic005G006300 Sobic003G394801--Sobic008G154300 Sobic003G394801--Sobic005G204500 Sobic003G394801--Sobic005G142400 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic003G394801--Sobic002G414150 Sobic003G394801--Sobic010G091800 Sobic006G142200 Sobic006G142200 Sobic003G394801--Sobic006G142200 Sobic007G112400--Sobic006G236300 Sobic007G112400--Sobic010G162700 Sobic007G112400--Sobic006G195000 Sobic007G112400--Sobic005G142400 Sobic007G112400--Sobic009G169500 Sobic007G112400--Sobic001G306200 Sobic007G112400--Sobic008G154300 Sobic007G112400--Sobic005G110120 Sobic009G091600 Sobic009G091600 Sobic007G112400--Sobic009G091600 Sobic006G236300--Sobic010G162700 Sobic006G236300--Sobic007G112400 Sobic006G236300--Sobic006G195000 Sobic006G236300--Sobic009G169500 Sobic006G236300--Sobic005G142400 Sobic006G236300--Sobic001G306200 Sobic006G236300--Sobic005G110120 Sobic006G236300--Sobic005G204500 Sobic006G236300--Sobic008G154300 Sobic010G162700--Sobic006G236300 Sobic010G162700--Sobic006G195000 Sobic010G162700--Sobic007G112400 Sobic010G162700--Sobic009G169500 Sobic010G162700--Sobic001G306200 Sobic010G162700--Sobic005G204500 Sobic010G162700--Sobic005G142400 Sobic010G162700--Sobic005G110120 Sobic010G162700--Sobic008G154300
Octagon: transcription factors


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