Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G112400.1
Synonym Sb07g016970
Functional annotation polygalacturonase, putative, expressed
UniProt C5YKE7
Pfam PF00295
Panther DB PTHR31375 PTHR31375:SF11
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0004650polygalacturonase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G18180 : Pectin lyase-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g23790.1 : polygalacturonase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030820 , Zm00025a017619 , Zm00025a004093 , Zm00025a038502
Brachypodium KQJ96034
Barley HORVU2Hr1G103020.29 , HORVU2Hr1G103020.28 , HORVU2Hr1G103020.23 , HORVU2Hr1G103020.22 , HORVU2Hr1G103020.21 , HORVU2Hr1G103020.20 , HORVU2Hr1G103020.27 , HORVU2Hr1G103020.26 , HORVU2Hr1G103020.25 , HORVU2Hr1G103020.24 , HORVU2Hr1G103020.38 , HORVU2Hr1G103020.39 , HORVU2Hr1G103020.30 , HORVU2Hr1G103020.31 , HORVU2Hr1G103020.32 , HORVU2Hr1G103020.33 , HORVU2Hr1G103020.34 , HORVU2Hr1G103020.8 , HORVU2Hr1G103020.9 , HORVU2Hr1G103020.1 , HORVU2Hr1G103020.2 , HORVU2Hr1G103020.3 , HORVU2Hr1G103020.4 , HORVU2Hr1G103020.5 , HORVU2Hr1G103020.6 , HORVU2Hr1G103020.7 , HORVU2Hr1G103020.12 , HORVU2Hr1G103020.13 , HORVU2Hr1G103020.10 , HORVU2Hr1G103020.11 , HORVU2Hr1G103020.16 , HORVU2Hr1G103020.17 , HORVU2Hr1G103020.14 , HORVU2Hr1G103020.15 , HORVU2Hr1G103020.18 , HORVU2Hr1G103020.19 , HORVU5Hr1G111650.5 , HORVU5Hr1G111650.4 , HORVU5Hr1G111650.3 , HORVU5Hr1G111650.1 , HORVU5Hr1G111650.2 , HORVU2Hr1G103020.41 , HORVU2Hr1G103020.40 , HORVU2Hr1G103020.42 , HORVU2Hr1G103020.36 , HORVU2Hr1G103020.37
Wheat TraesCS2A02G468400 , TraesCS2A02G468400 , TraesCS5D02G481800 , TraesCS7A02G404700 , TraesCS5A02G468900 , TraesCS2D02G468500 , TraesCS2D02G402000 , TraesCS2A02G405100 , TraesCS2B02G423200 , TraesCS5B02G481500
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cDNA sequences
Sobic.007G112400


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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