Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G158400.1
Synonym Sb09g022145
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R3M1
Pfam PF06521
Panther DB PTHR33649
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G54040 : PAR1 protein
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043871
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G102700 glutaredoxin, putative, expressed K17479: glutaredoxin domain-containing cysteine-rich protein 1
2 Sobic.004G166100 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
3 Sobic.009G260900 expressed protein -
4 Sobic.001G528700 - -
5 Sobic.004G025500 - -
6 Sobic.003G127200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed -
7 Sobic.004G024000 OsCML11 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
8 Sobic.007G175800 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed -
9 Sobic.004G071900 expressed protein -
10 Sobic.010G252600 cyclin-related protein, putative, expressed -
11 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
12 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
14 Sobic.006G215500 OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G220800 AGC_AGC_other_NDRh_TRCd.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K08790: STK38, serine/threonine kinase 38
16 Sobic.010G093600 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
17 Sobic.007G057600 - -
18 Sobic.009G089532 - -
19 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
20 Sobic.007G222400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic009G158400 Sobic009G158400 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic009G158400--Sobic009G102700 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic009G158400--Sobic004G166100 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic009G158400--Sobic009G260900 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic009G158400--Sobic001G528700 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G158400--Sobic004G025500 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic009G158400--Sobic003G127200 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic009G158400--Sobic004G024000 Sobic007G175800 Sobic007G175800 Sobic009G158400--Sobic007G175800 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic009G158400--Sobic004G071900 Sobic009G102700--Sobic004G166100 Sobic009G102700--Sobic001G528700 Sobic009G102700--Sobic004G024000 Sobic009G102700--Sobic004G025500 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G102700--Sobic001G539700 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic009G102700--Sobic007G057600 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic009G102700--Sobic010G252600 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic009G102700--Sobic007G222500 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic009G102700--Sobic007G222400 Sobic004G166100--Sobic004G024000 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic004G166100--Sobic008G028300 Sobic004G166100--Sobic001G539700 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic004G166100--Sobic001G002200 Sobic004G166100--Sobic001G528700 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic004G166100--Sobic008G028100 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic004G166100--Sobic002G002600 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic004G166100--Sobic010G093600 Sobic004G166100--Sobic007G222400 Sobic009G260900--Sobic003G127200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic009G260900--Sobic007G100800 Sobic009G260900--Sobic008G028300 Sobic009G260900--Sobic002G002600 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic009G260900--Sobic010G161400 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic009G260900--Sobic008G186900 Sobic009G260900--Sobic001G002200 Sobic009G260900--Sobic008G028100 Sobic009G260900--Sobic001G539700 Sobic001G528700--Sobic007G222500 Sobic001G528700--Sobic004G166100 Sobic001G528700--Sobic009G102700 Sobic001G528700--Sobic004G024000 Sobic001G528700--Sobic007G057600 Sobic001G252900 Sobic001G252900 Sobic001G528700--Sobic001G252900 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic001G528700--Sobic008G028200 Sobic001G528700--Sobic010G093600 Sobic001G528700--Sobic001G002200 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic010G161400 Sobic003G127200--Sobic002G002600 Sobic003G127200--Sobic007G100800 Sobic003G127200--Sobic008G028300 Sobic003G127200--Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic008G186900 Sobic003G127200--Sobic010G161400 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G127200--Sobic003G061700 Sobic003G127200--Sobic001G002200 Sobic003G127200--Sobic001G539700 Sobic004G024000--Sobic004G166100 Sobic004G024000--Sobic001G002200 Sobic004G024000--Sobic008G028300 Sobic004G024000--Sobic007G222400 Sobic004G024000--Sobic010G093600 Sobic004G024000--Sobic001G539700 Sobic004G024000--Sobic002G002600 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic004G024000--Sobic009G016700 Sobic004G024000--Sobic008G028100 Sobic003G335200 Sobic003G335200 Sobic007G175800--Sobic003G335200 Sobic001G348600 Sobic001G348600 Sobic007G175800--Sobic001G348600 Sobic007G175800--Sobic007G222500 Sobic007G175800--Sobic007G057600 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic007G175800--Sobic001G228000 Sobic003G317600 Sobic003G317600 Sobic007G175800--Sobic003G317600 Sobic004G002800 Sobic004G002800 Sobic007G175800--Sobic004G002800 Sobic007G175800--Sobic001G252900 Sobic002G197900 Sobic002G197900 Sobic007G175800--Sobic002G197900 Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic004G071900--Sobic006G215500 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic004G071900--Sobic001G135950 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic004G071900--Sobic002G125100 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic004G071900--Sobic004G099200 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic004G071900--Sobic009G105100 Sobic004G071900--Sobic009G102700 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic004G071900--Sobic003G313200 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic004G071900--Sobic006G022700 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic004G071900--Sobic002G279900
Octagon: transcription factors


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