Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G215500.1
Synonym
Functional annotation OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6PN85
Pfam -
Panther DB PTHR34591 PTHR34591:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g02280.1 : OsFBX114 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a046982
Brachypodium -
Barley HORVU7Hr1G017060.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.006G215500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G071900 expressed protein -
2 Sobic.001G135950 - -
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6 Sobic.001G220800 AGC_AGC_other_NDRh_TRCd.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K08790: STK38, serine/threonine kinase 38
7 Sobic.004G025500 - -
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10 Sobic.009G105100 expressed protein -
11 Sobic.002G279900 beta-galactosidase precursor, putative, expressed -
12 Sobic.009G158400 - -
13 Sobic.004G350400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
14 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -
15 Sobic.004G166100 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
16 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
17 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.001G540000 expansin precursor, putative, expressed -
19 Sobic.002G106800 expressed protein -
20 Sobic.002G384500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G215500 Sobic006G215500 Sobic004G071900 Sobic004G071900 Sobic006G215500--Sobic004G071900 Sobic001G135950 Sobic001G135950 Sobic006G215500--Sobic001G135950 Sobic006G022700 Sobic006G022700 Sobic006G215500--Sobic006G022700 Sobic002G125100 Sobic002G125100 Sobic006G215500--Sobic002G125100 Sobic003G313200 Sobic003G313200 Sobic006G215500--Sobic003G313200 Sobic001G220800 Sobic001G220800 Sobic006G215500--Sobic001G220800 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic006G215500--Sobic004G025500 Sobic009G102700 Sobic009G102700 Sobic006G215500--Sobic009G102700 Sobic004G099200 Sobic004G099200 Sobic006G215500--Sobic004G099200 Sobic004G071900--Sobic006G215500 Sobic004G071900--Sobic001G135950 Sobic004G071900--Sobic002G125100 Sobic004G071900--Sobic004G099200 Sobic009G105100 Sobic009G105100 Sobic004G071900--Sobic009G105100 Sobic004G071900--Sobic009G102700 Sobic004G071900--Sobic003G313200 Sobic004G071900--Sobic006G022700 Sobic002G279900 Sobic002G279900 Sobic004G071900--Sobic002G279900 Sobic001G135950--Sobic004G071900 Sobic001G135950--Sobic002G125100 Sobic001G135950--Sobic006G215500 Sobic001G135950--Sobic004G099200 Sobic001G135950--Sobic002G279900 Sobic010G001200 Sobic010G001200 Sobic001G135950--Sobic010G001200 Sobic001G525600 Sobic001G525600 Sobic001G135950--Sobic001G525600 Sobic005G145400 Sobic005G145400 Sobic001G135950--Sobic005G145400 Sobic001G135950--Sobic003G313200 Sobic006G022700--Sobic006G215500 Sobic006G022700--Sobic001G220800 Sobic006G022700--Sobic004G071900 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic006G022700--Sobic009G098400 Sobic006G022700--Sobic003G313200 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic006G022700--Sobic004G350400 Sobic006G022700--Sobic002G279900 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic006G022700--Sobic004G187400 Sobic006G022700--Sobic001G135950 Sobic002G125100--Sobic001G135950 Sobic002G125100--Sobic004G071900 Sobic002G125100--Sobic006G215500 Sobic002G125100--Sobic004G099200 Sobic002G125100--Sobic002G279900 Sobic002G125100--Sobic009G105100 Sobic002G125100--Sobic010G001200 Sobic002G125100--Sobic001G525600 Sobic002G125100--Sobic003G313200 Sobic003G313200--Sobic006G215500 Sobic003G313200--Sobic004G071900 Sobic003G313200--Sobic004G099200 Sobic003G313200--Sobic001G135950 Sobic003G313200--Sobic001G525600 Sobic003G313200--Sobic006G022700 Sobic003G313200--Sobic002G279900 Sobic003G313200--Sobic002G125100 Sobic003G313200--Sobic009G105100 Sobic001G220800--Sobic004G350400 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic001G220800--Sobic001G540000 Sobic002G282600 Sobic002G282600 Sobic001G220800--Sobic002G282600 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic001G220800--Sobic002G091200 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic001G220800--Sobic004G131400 Sobic001G220800--Sobic004G025500 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic001G220800--Sobic004G025600 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic001G220800--Sobic005G010000 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic001G220800--Sobic003G173800 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic004G025500--Sobic010G161400 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic009G102700--Sobic004G166100 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic009G102700--Sobic001G528700 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic009G102700--Sobic004G024000 Sobic009G102700--Sobic004G025500 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G102700--Sobic001G539700 Sobic007G057600 Sobic007G057600 Sobic009G102700--Sobic007G057600 Sobic010G252600 Sobic010G252600 Sobic009G102700--Sobic010G252600 Sobic007G222500 Sobic007G222500 Sobic009G102700--Sobic007G222500 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic009G102700--Sobic007G222400 Sobic004G099200--Sobic001G135950 Sobic004G099200--Sobic001G525600 Sobic004G099200--Sobic004G071900 Sobic004G099200--Sobic005G145400 Sobic004G099200--Sobic002G125100 Sobic004G099200--Sobic006G215500 Sobic004G099200--Sobic003G313200 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic004G099200--Sobic010G276100 Sobic004G099200--Sobic002G279900
Octagon: transcription factors


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