Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G106800.1
Synonym Sb02g009110
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X3L1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g18070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
2 Sobic.005G010000 expressed protein -
3 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
4 Sobic.002G091200 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
5 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
6 Sobic.001G540000 expansin precursor, putative, expressed -
7 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
8 Sobic.004G025500 - -
9 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
10 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
11 Sobic.004G350400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
12 Sobic.004G025600 - -
13 Sobic.003G061700 - -
14 Sobic.009G089532 - -
15 Sobic.003G438500 THION25 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G131400 DEF7 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.010G056500 - -
19 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
20 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic002G091200--Sobic001G540000 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic003G173800 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic002G091200--Sobic004G350400 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic004G137200 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G098900 Sobic004G137200--Sobic003G173800 Sobic004G137200--Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic004G025500 Sobic004G137200--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G089532 Sobic004G137200--Sobic001G540000 Sobic004G137200--Sobic002G091200 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G137200--Sobic002G283000 Sobic001G540000--Sobic004G025600 Sobic001G540000--Sobic002G091200 Sobic001G540000--Sobic010G056500 Sobic001G540000--Sobic004G131400 Sobic001G540000--Sobic004G350400 Sobic001G540000--Sobic002G106800 Sobic001G540000--Sobic004G137200 Sobic001G540000--Sobic003G173800 Sobic001G540000--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic010G161400 Sobic008G186900--Sobic007G100800 Sobic008G186900--Sobic010G161400 Sobic008G186900--Sobic003G061700 Sobic008G186900--Sobic005G010000 Sobic008G186900--Sobic003G173800 Sobic008G186900--Sobic002G002600 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic008G186900--Sobic003G127200 Sobic008G186900--Sobic009G098900 Sobic008G186900--Sobic008G028300
Octagon: transcription factors


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