Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G025500.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YMB0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034967 , Zm00025a018810 , Zm00025a034968
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
2 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
4 Sobic.002G106800 expressed protein -
5 Sobic.004G251900 tetraspanin family protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G010000 expressed protein -
7 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
8 Sobic.009G089532 - -
9 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
10 Sobic.002G091200 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G540000 expansin precursor, putative, expressed -
12 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
15 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
16 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
17 Sobic.004G166100 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
18 Sobic.004G025600 - -
19 Sobic.003G061700 - -
20 Sobic.004G350400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase


Gene co-expression network
sample Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic004G025500--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic004G137200--Sobic009G098900 Sobic004G137200--Sobic003G173800 Sobic004G137200--Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic004G025500 Sobic004G137200--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G089532 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic004G137200--Sobic001G540000 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic004G137200--Sobic002G091200 Sobic004G137200--Sobic002G283000 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic004G251900--Sobic004G025500 Sobic004G251900--Sobic009G098900 Sobic004G251900--Sobic009G089532 Sobic004G251900--Sobic001G539700 Sobic004G251900--Sobic004G137200 Sobic004G251900--Sobic002G002600 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic004G251900--Sobic008G028100 Sobic004G251900--Sobic002G283000 Sobic004G251900--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic002G283000--Sobic004G137200 Sobic002G283000--Sobic009G089532 Sobic002G283000--Sobic004G025500 Sobic002G283000--Sobic009G098900 Sobic002G283000--Sobic001G539700 Sobic002G283000--Sobic004G251900 Sobic002G283000--Sobic003G173800 Sobic002G283000--Sobic008G028100 Sobic002G283000--Sobic005G010000 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800
Octagon: transcription factors


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