Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G010000.1
Synonym Sb05g000920
Functional annotation expressed protein
UniProt C5Y341
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g08680.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G010000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
2 Sobic.002G106800 expressed protein -
3 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
4 Sobic.003G061700 - -
5 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
6 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
7 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
8 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
9 Sobic.002G091200 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
10 Sobic.003G438500 THION25 - Plant thionin family protein precursor, expressed -
11 Sobic.004G025500 - -
12 Sobic.001G540000 expansin precursor, putative, expressed -
13 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
14 Sobic.009G089532 - -
15 Sobic.003G127200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed -
16 Sobic.004G350400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
17 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.004G025600 - -
19 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
20 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic007G100800--Sobic003G061700 Sobic007G100800--Sobic008G186900 Sobic007G100800--Sobic005G010000 Sobic007G100800--Sobic010G161400 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic007G100800--Sobic003G127200 Sobic007G100800--Sobic003G173800 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic007G100800--Sobic002G002600 Sobic007G100800--Sobic009G098900 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic007G100800--Sobic008G028300 Sobic003G061700--Sobic007G100800 Sobic003G061700--Sobic008G186900 Sobic003G061700--Sobic005G010000 Sobic003G061700--Sobic010G161400 Sobic003G061700--Sobic003G173800 Sobic003G061700--Sobic003G127200 Sobic003G061700--Sobic002G002600 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic009G098900 Sobic008G186900--Sobic007G100800 Sobic008G186900--Sobic010G161400 Sobic008G186900--Sobic003G061700 Sobic008G186900--Sobic005G010000 Sobic008G186900--Sobic003G173800 Sobic008G186900--Sobic002G002600 Sobic008G186900--Sobic003G127200 Sobic008G186900--Sobic009G098900 Sobic008G186900--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic004G137200--Sobic009G098900 Sobic004G137200--Sobic003G173800 Sobic004G137200--Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic004G025500 Sobic004G137200--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G089532 Sobic004G137200--Sobic001G540000 Sobic004G137200--Sobic002G091200 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G137200--Sobic002G283000 Sobic002G091200--Sobic001G540000 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic003G173800 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic002G091200--Sobic004G350400 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic004G137200 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic005G010000
Octagon: transcription factors


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