Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G028300.1
Synonym Sb08g002500
Functional annotation pollen allergen, putative, expressed
UniProt C5YR98
Pfam PF01357
Panther DB PTHR31692 PTHR31692:SF13
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g45160.1 : pollen allergen, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
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19 Sobic.003G061700 - -
20 Sobic.001G228000 universal stress protein domain containing protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic008G028300--Sobic002G002600 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic008G028300--Sobic008G028100 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic008G028300--Sobic001G539700 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic008G028300--Sobic001G002200 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic008G028300--Sobic010G161400 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic008G028300--Sobic009G016700 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic008G028300--Sobic010G093600 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic008G028300--Sobic003G127200 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic008G028300--Sobic004G166100 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic008G028100--Sobic001G539700 Sobic008G028100--Sobic009G089532 Sobic008G028100--Sobic002G002600 Sobic008G028100--Sobic009G016700 Sobic008G028100--Sobic010G093600 Sobic008G028100--Sobic009G096700 Sobic008G028100--Sobic008G028300 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic007G222400 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic008G028100--Sobic009G098900 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic001G002200--Sobic008G027800 Sobic001G002200--Sobic010G093600 Sobic001G002200--Sobic008G028300 Sobic002G140500 Sobic002G140500 Sobic001G002200--Sobic002G140500 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic001G002200--Sobic001G228000 Sobic001G002200--Sobic002G002600 Sobic001G002200--Sobic009G096700 Sobic001G002200--Sobic009G016700 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic001G002200--Sobic008G028200 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic009G016700--Sobic010G093600 Sobic009G016700--Sobic008G028100 Sobic009G016700--Sobic001G539700 Sobic009G016700--Sobic002G002600 Sobic009G016700--Sobic007G222400 Sobic009G016700--Sobic009G096700 Sobic009G016700--Sobic008G028300 Sobic009G016700--Sobic008G027800 Sobic009G016700--Sobic001G002200 Sobic010G093600--Sobic009G096700 Sobic010G093600--Sobic009G016700 Sobic010G093600--Sobic008G028100 Sobic010G093600--Sobic008G027800 Sobic010G093600--Sobic001G539700 Sobic010G093600--Sobic001G002200 Sobic010G093600--Sobic002G002600 Sobic010G093600--Sobic008G028200 Sobic010G093600--Sobic008G028300 Sobic003G127200--Sobic002G002600 Sobic003G127200--Sobic007G100800 Sobic003G127200--Sobic008G028300 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic008G186900 Sobic003G127200--Sobic010G161400 Sobic003G127200--Sobic003G061700 Sobic003G127200--Sobic001G002200 Sobic003G127200--Sobic001G539700 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic004G166100--Sobic004G024000 Sobic004G166100--Sobic008G028300 Sobic004G166100--Sobic001G539700 Sobic004G166100--Sobic001G002200 Sobic001G528700 Sobic001G528700 Sobic004G166100--Sobic001G528700 Sobic004G166100--Sobic008G028100 Sobic004G166100--Sobic002G002600 Sobic004G166100--Sobic010G093600 Sobic004G166100--Sobic007G222400
Octagon: transcription factors


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