Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G096700.1
Synonym CIPK10, SbCIPK15, PKS2, CBL-interacting protein kinases, SNRK3.8, SIP1, Sb09g013580
Functional annotation Interacting factor of CBLs (PubMedID : 19860013)
CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed
UniProt A0A1Z5R2J4
Pfam PF14531 PF03822
Panther DB PTHR24347 PTHR24347:SF217
NCBI CDD KOG0583; Serine/threonine protein kinase
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0007165; signal transduction


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G58380 : SOS3-interacting protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g26820.1 : CAMK_KIN1/SNF1/Nim1_like.20 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043496
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G093600 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
2 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
3 Sobic.009G089532 - -
4 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
5 Sobic.008G027800 pollen allergen, putative, expressed -
6 Sobic.009G016700 glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, putative, expressed K00134: GAPDH, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase
7 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G002200 myosin, putative, expressed K10357: myosin V
9 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
10 Sobic.008G028200 pollen allergen, putative, expressed -
11 Sobic.007G222400 - -
12 Sobic.004G024000 OsCML11 - Calmodulin-related calcium sensor protein, expressed K13448: calcium-binding protein CML
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17 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
18 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.001G528700 - -
20 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase


Gene co-expression network
sample Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G096700--Sobic010G093600 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic009G096700--Sobic008G028100 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G096700--Sobic009G089532 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G096700--Sobic001G539700 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic009G096700--Sobic008G027800 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic009G096700--Sobic009G016700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G096700--Sobic002G002600 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic009G096700--Sobic001G002200 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic009G096700--Sobic008G028300 Sobic010G093600--Sobic009G096700 Sobic010G093600--Sobic009G016700 Sobic010G093600--Sobic008G028100 Sobic010G093600--Sobic008G027800 Sobic010G093600--Sobic001G539700 Sobic010G093600--Sobic001G002200 Sobic010G093600--Sobic002G002600 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic010G093600--Sobic008G028200 Sobic010G093600--Sobic008G028300 Sobic008G028100--Sobic001G539700 Sobic008G028100--Sobic009G089532 Sobic008G028100--Sobic002G002600 Sobic008G028100--Sobic009G016700 Sobic008G028100--Sobic010G093600 Sobic008G028100--Sobic009G096700 Sobic008G028100--Sobic008G028300 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic007G222400 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic008G028100--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic008G027800--Sobic010G093600 Sobic008G027800--Sobic001G002200 Sobic008G027800--Sobic009G096700 Sobic008G027800--Sobic008G028200 Sobic008G027800--Sobic009G016700 Sobic008G027800--Sobic008G028100 Sobic008G027800--Sobic008G028300 Sobic002G140500 Sobic002G140500 Sobic008G027800--Sobic002G140500 Sobic008G027800--Sobic002G002600 Sobic009G016700--Sobic010G093600 Sobic009G016700--Sobic008G028100 Sobic009G016700--Sobic001G539700 Sobic009G016700--Sobic002G002600 Sobic009G016700--Sobic007G222400 Sobic009G016700--Sobic009G096700 Sobic009G016700--Sobic008G028300 Sobic009G016700--Sobic008G027800 Sobic009G016700--Sobic001G002200 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic001G002200--Sobic008G027800 Sobic001G002200--Sobic010G093600 Sobic001G002200--Sobic008G028300 Sobic001G002200--Sobic002G140500 Sobic001G228000 Sobic001G228000 Sobic001G002200--Sobic001G228000 Sobic001G002200--Sobic002G002600 Sobic001G002200--Sobic009G096700 Sobic001G002200--Sobic009G016700 Sobic001G002200--Sobic008G028200 Sobic008G028300--Sobic002G002600 Sobic008G028300--Sobic008G028100 Sobic008G028300--Sobic001G539700 Sobic008G028300--Sobic001G002200 Sobic008G028300--Sobic010G161400 Sobic008G028300--Sobic009G016700 Sobic008G028300--Sobic010G093600 Sobic008G028300--Sobic003G127200 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic008G028300--Sobic004G166100
Octagon: transcription factors


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