Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G283000.1
Synonym HCT, Sb02g031580
Functional annotation transferase family protein, putative, expressed
UniProt A0A1W0W675
Pfam PF02458
Panther DB PTHR31642 PTHR31642:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016747; transferase activity, transferring acyl groups other than amino-acyl groups


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G48930 : hydroxycinnamoyl-CoA shikimate/quinate hydroxycinnamoyl transferase
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g37200.1 : transferase family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047828 , Zm00025a047827 , Zm00025a007608 , Zm00025a004037 , Zm00025a014483 , Zm00025a014486 , Zm00025a049287 , Zm00025a000974 , Zm00025a049286
Brachypodium KQJ96476 , KQJ91286 , KQJ91283 , KQK23250
Barley HORVU5Hr1G084980.2 , HORVU5Hr1G084980.3 , HORVU5Hr1G084980.1 , HORVU5Hr1G084980.4 , HORVU5Hr1G084980.5 , HORVU5Hr1G084810.1 , HORVU5Hr1G084820.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic002G283000--Sobic004G137200 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic002G283000--Sobic009G089532 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic002G283000--Sobic004G025500 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic002G283000--Sobic009G098900 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic002G283000--Sobic001G539700 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic002G283000--Sobic004G251900 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic002G283000--Sobic003G173800 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic002G283000--Sobic008G028100 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic002G283000--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G098900 Sobic004G137200--Sobic003G173800 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic004G025500 Sobic004G137200--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G089532 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic004G137200--Sobic001G540000 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic004G137200--Sobic002G091200 Sobic004G137200--Sobic002G283000 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic004G025500--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic004G251900--Sobic004G025500 Sobic004G251900--Sobic009G098900 Sobic004G251900--Sobic009G089532 Sobic004G251900--Sobic001G539700 Sobic004G251900--Sobic004G137200 Sobic004G251900--Sobic002G002600 Sobic004G251900--Sobic008G028100 Sobic004G251900--Sobic002G283000 Sobic004G251900--Sobic003G173800 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic008G028100--Sobic001G539700 Sobic008G028100--Sobic009G089532 Sobic008G028100--Sobic002G002600 Sobic008G028100--Sobic009G016700 Sobic008G028100--Sobic010G093600 Sobic008G028100--Sobic009G096700 Sobic008G028100--Sobic008G028300 Sobic008G028100--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200
Octagon: transcription factors


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