Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G539700.1
Synonym Sb01g050190, EXPB2, ATHEXPBETA1.4, ATEXPB2
Functional annotation expansin precursor, putative, expressed
UniProt -
Pfam PF03330 PF01357
Panther DB PTHR31692 PTHR31692:SF21
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65680 : expansin B2
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g01610.1 : expansin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a051980 , Zm00025a021677 , Zm00025a021679 , Zm00025a021678 , Zm00025a003332 , Zm00025a003331 , Zm00025a024285 , Zm00025a021682 , Zm00025a021683 , Zm00025a021680 , Zm00025a021681
Brachypodium KQK07389
Barley HORVU0Hr1G005490.2 , HORVU0Hr1G005490.1
Wheat TraesCS2D02G459300 , TraesCS2B02G480700 , TraesCS2A02G458900
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.001G539700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic001G539700 Sobic008G028100--Sobic009G089532 Sobic008G028100--Sobic002G002600 Sobic008G028100--Sobic009G016700 Sobic008G028100--Sobic010G093600 Sobic008G028100--Sobic009G096700 Sobic008G028100--Sobic008G028300 Sobic008G028100--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic009G016700--Sobic010G093600 Sobic009G016700--Sobic008G028100 Sobic009G016700--Sobic001G539700 Sobic009G016700--Sobic002G002600 Sobic009G016700--Sobic007G222400 Sobic009G016700--Sobic009G096700 Sobic009G016700--Sobic008G028300 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic009G016700--Sobic008G027800 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic009G016700--Sobic001G002200 Sobic010G093600--Sobic009G096700 Sobic010G093600--Sobic009G016700 Sobic010G093600--Sobic008G028100 Sobic010G093600--Sobic008G027800 Sobic010G093600--Sobic001G539700 Sobic010G093600--Sobic001G002200 Sobic010G093600--Sobic002G002600 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic010G093600--Sobic008G028200 Sobic010G093600--Sobic008G028300 Sobic009G096700--Sobic010G093600 Sobic009G096700--Sobic008G028100 Sobic009G096700--Sobic009G089532 Sobic009G096700--Sobic001G539700 Sobic009G096700--Sobic008G027800 Sobic009G096700--Sobic009G016700 Sobic009G096700--Sobic002G002600 Sobic009G096700--Sobic001G002200 Sobic009G096700--Sobic008G028300 Sobic008G028300--Sobic002G002600 Sobic008G028300--Sobic008G028100 Sobic008G028300--Sobic001G539700 Sobic008G028300--Sobic001G002200 Sobic008G028300--Sobic010G161400 Sobic008G028300--Sobic009G016700 Sobic008G028300--Sobic010G093600 Sobic008G028300--Sobic003G127200 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic008G028300--Sobic004G166100 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic007G222400--Sobic009G016700 Sobic007G222400--Sobic001G539700 Sobic007G222400--Sobic008G028100 Sobic007G222400--Sobic010G093600 Sobic007G222400--Sobic008G028300 Sobic007G222400--Sobic004G166100 Sobic007G222400--Sobic002G002600 Sobic004G024000 Sobic004G024000 Sobic007G222400--Sobic004G024000 Sobic007G222400--Sobic009G096700
Octagon: transcription factors


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