Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G137200.1
Synonym Sb04g015850, FLA3
Functional annotation fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed
UniProt C5Y0Q8
Pfam PF02469
Panther DB PTHR32382 PTHR32382:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G12660 : FASCICLIN-like arabinogalactan protein 14 precursor
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g26320.1 : fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019708
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G098900 rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed K12462: ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
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20 Sobic.010G056500 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic004G137200--Sobic009G098900 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic004G137200--Sobic003G173800 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic002G106800 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic004G137200--Sobic004G025500 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic005G010000 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic004G137200--Sobic009G089532 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic004G137200--Sobic001G540000 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic004G137200--Sobic002G091200 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G137200--Sobic002G283000 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic001G540000--Sobic004G025600 Sobic001G540000--Sobic002G091200 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic001G540000--Sobic010G056500 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic001G540000--Sobic004G131400 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic001G540000--Sobic004G350400 Sobic001G540000--Sobic002G106800 Sobic001G540000--Sobic004G137200 Sobic001G540000--Sobic003G173800 Sobic001G540000--Sobic005G010000 Sobic002G091200--Sobic001G540000 Sobic002G091200--Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic003G173800 Sobic002G091200--Sobic004G350400 Sobic002G091200--Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic004G137200 Sobic002G091200--Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic005G010000 Sobic002G283000--Sobic004G137200 Sobic002G283000--Sobic009G089532 Sobic002G283000--Sobic004G025500 Sobic002G283000--Sobic009G098900 Sobic002G283000--Sobic001G539700 Sobic002G283000--Sobic004G251900 Sobic002G283000--Sobic003G173800 Sobic002G283000--Sobic008G028100 Sobic002G283000--Sobic005G010000
Octagon: transcription factors


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