Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G173800.1,Sobic.003G173800.4,Sobic.003G173800.3,Sobic.003G173800.2
Synonym Sb03g021050
Functional annotation polygalacturonase, putative, expressed
UniProt A0A1W0VXT3 , C5XLH9
Pfam PF12708
Panther DB PTHR31375 PTHR31375:SF48
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G15450 : Pectin lyase-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g33300.1 : polygalacturonase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a024787 , Zm00025a036389
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G173800


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic008G186900--Sobic007G100800 Sobic008G186900--Sobic010G161400 Sobic008G186900--Sobic003G061700 Sobic008G186900--Sobic005G010000 Sobic008G186900--Sobic003G173800 Sobic008G186900--Sobic002G002600 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic008G186900--Sobic003G127200 Sobic008G186900--Sobic009G098900 Sobic008G186900--Sobic008G028300 Sobic004G137200--Sobic009G098900 Sobic004G137200--Sobic003G173800 Sobic004G137200--Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic004G025500 Sobic004G137200--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G089532 Sobic004G137200--Sobic001G540000 Sobic004G137200--Sobic002G091200 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G137200--Sobic002G283000 Sobic002G091200--Sobic001G540000 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic003G173800 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic002G091200--Sobic004G350400 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic004G137200 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic005G010000 Sobic007G100800--Sobic003G061700 Sobic007G100800--Sobic008G186900 Sobic007G100800--Sobic005G010000 Sobic007G100800--Sobic010G161400 Sobic007G100800--Sobic003G127200 Sobic007G100800--Sobic003G173800 Sobic007G100800--Sobic002G002600 Sobic007G100800--Sobic009G098900 Sobic007G100800--Sobic008G028300 Sobic003G061700--Sobic007G100800 Sobic003G061700--Sobic008G186900 Sobic003G061700--Sobic005G010000 Sobic003G061700--Sobic010G161400 Sobic003G061700--Sobic003G173800 Sobic003G061700--Sobic003G127200 Sobic003G061700--Sobic002G002600 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic009G098900
Octagon: transcription factors


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