Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G098900.1
Synonym SCN1, Sb09g015030
Functional annotation rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed
UniProt C5YW61
Pfam PF02115
Panther DB PTHR10980 PTHR10980:SF17
NCBI CDD KOG3205; Rho GDP-dissociation inhibitor
KEGG Orthology K12462; ARHGDI, Rho GDP-dissociation inhibitor
Gene Ontology GO:0005737; cytoplasm GO:0005094Rho GDP-dissociation inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G07880 : Immunoglobulin E-set superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68540.1 : rho GDP-dissociation inhibitor 1, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a043491 , Zm00025a037542 , Zm00025a037543
Brachypodium KQK11161
Barley HORVU3Hr1G092980.10 , HORVU3Hr1G092980.9 , HORVU3Hr1G092980.8 , HORVU3Hr1G092980.7 , HORVU3Hr1G092980.6 , HORVU3Hr1G092980.5 , HORVU3Hr1G092980.4 , HORVU3Hr1G092980.1 , HORVU3Hr1G092980.3 , HORVU3Hr1G092980.2
Wheat TraesCS7B02G186700 , TraesCS3B02G454500 , TraesCS3A02G419200 , TraesCS3D02G414900
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic004G025500--Sobic009G098900 Sobic004G025500--Sobic004G137200 Sobic004G025500--Sobic003G173800 Sobic004G025500--Sobic002G106800 Sobic004G251900 Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic004G251900 Sobic004G025500--Sobic005G010000 Sobic002G283000 Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic002G283000 Sobic004G025500--Sobic009G089532 Sobic004G025500--Sobic010G161400 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic004G137200--Sobic009G098900 Sobic004G137200--Sobic003G173800 Sobic004G137200--Sobic002G106800 Sobic004G137200--Sobic004G025500 Sobic004G137200--Sobic005G010000 Sobic004G137200--Sobic009G089532 Sobic004G137200--Sobic001G540000 Sobic004G137200--Sobic002G091200 Sobic004G137200--Sobic002G283000 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic002G002600--Sobic003G127200
Octagon: transcription factors


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