Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G186900.1
Synonym PRB1, Sb08g022830, ATPRB1
Functional annotation SCP-like extracellular protein, expressed
UniProt A0A1Z5R7L2
Pfam PF00188
Panther DB PTHR10334 PTHR10334:SF194
NCBI CDD KOG3017; Defense-related protein containing SCP domain
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G14580 : basic pathogenesis-related protein 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g43700.1 : SCP-like extracellular protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a025089
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G001720.1 , HORVU5Hr1G001720.2 , HORVU5Hr1G001690.1 , HORVU5Hr1G001690.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
2 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
3 Sobic.003G061700 - -
4 Sobic.005G010000 expressed protein -
5 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
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9 Sobic.008G028300 pollen allergen, putative, expressed -
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12 Sobic.009G089532 - -
13 Sobic.001G539700 expansin precursor, putative, expressed -
14 Sobic.008G028100 pollen allergen, putative, expressed -
15 Sobic.004G025500 - -
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20 Sobic.004G166100 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic008G186900--Sobic007G100800 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic008G186900--Sobic010G161400 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic008G186900--Sobic003G061700 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic008G186900--Sobic005G010000 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic008G186900--Sobic003G173800 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic008G186900--Sobic002G002600 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic008G186900--Sobic003G127200 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic008G186900--Sobic009G098900 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic008G186900--Sobic008G028300 Sobic007G100800--Sobic003G061700 Sobic007G100800--Sobic008G186900 Sobic007G100800--Sobic005G010000 Sobic007G100800--Sobic010G161400 Sobic007G100800--Sobic003G127200 Sobic007G100800--Sobic003G173800 Sobic007G100800--Sobic002G002600 Sobic007G100800--Sobic009G098900 Sobic007G100800--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic003G061700--Sobic007G100800 Sobic003G061700--Sobic008G186900 Sobic003G061700--Sobic005G010000 Sobic003G061700--Sobic010G161400 Sobic003G061700--Sobic003G173800 Sobic003G061700--Sobic003G127200 Sobic003G061700--Sobic002G002600 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic009G098900 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic003G127200--Sobic002G002600 Sobic003G127200--Sobic007G100800 Sobic003G127200--Sobic008G028300 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic008G186900 Sobic003G127200--Sobic010G161400 Sobic003G127200--Sobic003G061700 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic003G127200--Sobic001G002200 Sobic003G127200--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic008G028300--Sobic002G002600 Sobic008G028300--Sobic008G028100 Sobic008G028300--Sobic001G539700 Sobic008G028300--Sobic001G002200 Sobic008G028300--Sobic010G161400 Sobic008G028300--Sobic009G016700 Sobic008G028300--Sobic010G093600 Sobic008G028300--Sobic003G127200 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic008G028300--Sobic004G166100
Octagon: transcription factors


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