Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G002600.1
Synonym Sb02g000420
Functional annotation la domain containing protein, expressed
UniProt C5X739
Pfam PF00076 PF05383
Panther DB PTHR22792 PTHR22792:SF62
NCBI CDD KOG1855; Predicted RNA-binding protein
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19090 : RNA-binding protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g01260.1 : la domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044836
Brachypodium -
Barley HORVU2Hr1G064590.14 , HORVU2Hr1G064590.12 , HORVU2Hr1G064590.13 , HORVU2Hr1G064590.10 , HORVU2Hr1G064590.11 , HORVU2Hr1G064590.8 , HORVU2Hr1G064590.9 , HORVU2Hr1G064590.4 , HORVU2Hr1G064590.5 , HORVU2Hr1G064590.6 , HORVU2Hr1G064590.7 , HORVU2Hr1G064590.2 , HORVU2Hr1G064590.3
Wheat TraesCS2D02G265900 , TraesCS2A02G256900 , TraesCS2B02G285700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G010000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic002G002600--Sobic008G028300 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic002G002600--Sobic001G539700 Sobic008G028100 Sobic008G028100 Sobic002G002600--Sobic008G028100 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic002G002600--Sobic009G089532 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic002G002600--Sobic010G161400 Sobic009G016700 Sobic009G016700 Sobic002G002600--Sobic009G016700 Sobic010G093600 Sobic010G093600 Sobic002G002600--Sobic010G093600 Sobic009G096700 Sobic009G096700 Sobic002G002600--Sobic009G096700 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic002G002600--Sobic003G127200 Sobic008G028300--Sobic002G002600 Sobic008G028300--Sobic008G028100 Sobic008G028300--Sobic001G539700 Sobic001G002200 Sobic001G002200 Sobic008G028300--Sobic001G002200 Sobic008G028300--Sobic010G161400 Sobic008G028300--Sobic009G016700 Sobic008G028300--Sobic010G093600 Sobic008G028300--Sobic003G127200 Sobic004G166100 Sobic004G166100 Sobic008G028300--Sobic004G166100 Sobic001G539700--Sobic008G028100 Sobic001G539700--Sobic009G089532 Sobic001G539700--Sobic002G002600 Sobic001G539700--Sobic009G016700 Sobic001G539700--Sobic010G093600 Sobic001G539700--Sobic009G096700 Sobic001G539700--Sobic008G028300 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic001G539700--Sobic009G098900 Sobic007G222400 Sobic007G222400 Sobic001G539700--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic001G539700 Sobic008G028100--Sobic009G089532 Sobic008G028100--Sobic002G002600 Sobic008G028100--Sobic009G016700 Sobic008G028100--Sobic010G093600 Sobic008G028100--Sobic009G096700 Sobic008G028100--Sobic008G028300 Sobic008G028100--Sobic007G222400 Sobic008G028100--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic001G539700 Sobic009G089532--Sobic008G028100 Sobic009G089532--Sobic002G002600 Sobic009G089532--Sobic009G096700 Sobic009G089532--Sobic009G098900 Sobic009G089532--Sobic010G093600 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic004G137200 Sobic009G089532--Sobic009G016700 Sobic009G089532--Sobic008G028300 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic009G016700--Sobic010G093600 Sobic009G016700--Sobic008G028100 Sobic009G016700--Sobic001G539700 Sobic009G016700--Sobic002G002600 Sobic009G016700--Sobic007G222400 Sobic009G016700--Sobic009G096700 Sobic009G016700--Sobic008G028300 Sobic008G027800 Sobic008G027800 Sobic009G016700--Sobic008G027800 Sobic009G016700--Sobic001G002200 Sobic010G093600--Sobic009G096700 Sobic010G093600--Sobic009G016700 Sobic010G093600--Sobic008G028100 Sobic010G093600--Sobic008G027800 Sobic010G093600--Sobic001G539700 Sobic010G093600--Sobic001G002200 Sobic010G093600--Sobic002G002600 Sobic008G028200 Sobic008G028200 Sobic010G093600--Sobic008G028200 Sobic010G093600--Sobic008G028300 Sobic009G096700--Sobic010G093600 Sobic009G096700--Sobic008G028100 Sobic009G096700--Sobic009G089532 Sobic009G096700--Sobic001G539700 Sobic009G096700--Sobic008G027800 Sobic009G096700--Sobic009G016700 Sobic009G096700--Sobic002G002600 Sobic009G096700--Sobic001G002200 Sobic009G096700--Sobic008G028300 Sobic003G127200--Sobic002G002600 Sobic003G127200--Sobic007G100800 Sobic003G127200--Sobic008G028300 Sobic009G260900 Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic009G260900 Sobic003G127200--Sobic008G186900 Sobic003G127200--Sobic010G161400 Sobic003G127200--Sobic003G061700 Sobic003G127200--Sobic001G002200 Sobic003G127200--Sobic001G539700
Octagon: transcription factors


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