Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G438500.1
Synonym Sb03g046870
Functional annotation THION25 - Plant thionin family protein precursor, expressed
UniProt C5XJ87
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g03480.2 : THION24 - Plant thionin family protein precursor, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley HORVU5Hr1G085100.1
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G438500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G010000 expressed protein -
2 Sobic.003G173800 polygalacturonase, putative, expressed -
3 Sobic.007G100800 CSLD3 - cellulose synthase-like family D, expressed -
4 Sobic.008G186900 SCP-like extracellular protein, expressed -
5 Sobic.003G061700 - -
6 Sobic.002G106800 expressed protein -
7 Sobic.010G161400 polygalacturonase, putative, expressed K01213: galacturan 1,4-alpha-galacturonidase
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9 Sobic.002G091200 pectinesterase inhibitor domain containing protein, expressed -
10 Sobic.004G137200 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
11 Sobic.004G025500 - -
12 Sobic.003G127200 phosphatidylinositol kinase, putative, expressed -
13 Sobic.001G220800 AGC_AGC_other_NDRh_TRCd.3 - ACG kinases include homologs to PKA, PKG and PKC, expressed K08790: STK38, serine/threonine kinase 38
14 Sobic.001G540000 expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G002600 la domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G350400 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase
17 Sobic.002G283000 transferase family protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G351500 pollen allergen Cyn d 23, putative, expressed -
19 Sobic.009G089532 - -
20 Sobic.009G216400 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G438500 Sobic003G438500 Sobic005G010000 Sobic005G010000 Sobic003G438500--Sobic005G010000 Sobic003G173800 Sobic003G173800 Sobic003G438500--Sobic003G173800 Sobic007G100800 Sobic007G100800 Sobic003G438500--Sobic007G100800 Sobic008G186900 Sobic008G186900 Sobic003G438500--Sobic008G186900 Sobic003G061700 Sobic003G061700 Sobic003G438500--Sobic003G061700 Sobic002G106800 Sobic002G106800 Sobic003G438500--Sobic002G106800 Sobic010G161400 Sobic010G161400 Sobic003G438500--Sobic010G161400 Sobic009G098900 Sobic009G098900 Sobic003G438500--Sobic009G098900 Sobic002G091200 Sobic002G091200 Sobic003G438500--Sobic002G091200 Sobic005G010000--Sobic003G173800 Sobic005G010000--Sobic002G106800 Sobic005G010000--Sobic007G100800 Sobic005G010000--Sobic003G061700 Sobic005G010000--Sobic008G186900 Sobic005G010000--Sobic010G161400 Sobic005G010000--Sobic009G098900 Sobic004G137200 Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic004G137200 Sobic005G010000--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic005G010000 Sobic003G173800--Sobic002G106800 Sobic003G173800--Sobic009G098900 Sobic003G173800--Sobic010G161400 Sobic003G173800--Sobic008G186900 Sobic003G173800--Sobic004G137200 Sobic003G173800--Sobic002G091200 Sobic003G173800--Sobic007G100800 Sobic003G173800--Sobic003G061700 Sobic007G100800--Sobic003G061700 Sobic007G100800--Sobic008G186900 Sobic007G100800--Sobic005G010000 Sobic007G100800--Sobic010G161400 Sobic003G127200 Sobic003G127200 Sobic007G100800--Sobic003G127200 Sobic007G100800--Sobic003G173800 Sobic002G002600 Sobic002G002600 Sobic007G100800--Sobic002G002600 Sobic007G100800--Sobic009G098900 Sobic008G028300 Sobic008G028300 Sobic007G100800--Sobic008G028300 Sobic008G186900--Sobic007G100800 Sobic008G186900--Sobic010G161400 Sobic008G186900--Sobic003G061700 Sobic008G186900--Sobic005G010000 Sobic008G186900--Sobic003G173800 Sobic008G186900--Sobic002G002600 Sobic008G186900--Sobic003G127200 Sobic008G186900--Sobic009G098900 Sobic008G186900--Sobic008G028300 Sobic003G061700--Sobic007G100800 Sobic003G061700--Sobic008G186900 Sobic003G061700--Sobic005G010000 Sobic003G061700--Sobic010G161400 Sobic003G061700--Sobic003G173800 Sobic003G061700--Sobic003G127200 Sobic003G061700--Sobic002G002600 Sobic002G351500 Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic002G351500 Sobic003G061700--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic003G173800 Sobic002G106800--Sobic005G010000 Sobic002G106800--Sobic009G098900 Sobic002G106800--Sobic002G091200 Sobic002G106800--Sobic004G137200 Sobic001G540000 Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic001G540000 Sobic002G106800--Sobic010G161400 Sobic004G025500 Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic004G025500 Sobic002G106800--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic008G186900 Sobic010G161400--Sobic009G098900 Sobic010G161400--Sobic003G173800 Sobic010G161400--Sobic002G002600 Sobic010G161400--Sobic007G100800 Sobic010G161400--Sobic005G010000 Sobic010G161400--Sobic008G028300 Sobic010G161400--Sobic003G061700 Sobic010G161400--Sobic002G106800 Sobic009G098900--Sobic003G173800 Sobic009G098900--Sobic004G025500 Sobic009G098900--Sobic010G161400 Sobic009G098900--Sobic002G106800 Sobic009G089532 Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic009G089532 Sobic009G098900--Sobic004G137200 Sobic009G098900--Sobic005G010000 Sobic001G539700 Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic001G539700 Sobic009G098900--Sobic002G002600 Sobic002G091200--Sobic001G540000 Sobic004G025600 Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic004G025600 Sobic002G091200--Sobic002G106800 Sobic002G091200--Sobic003G173800 Sobic004G350400 Sobic004G350400 Sobic002G091200--Sobic004G350400 Sobic010G056500 Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic010G056500 Sobic002G091200--Sobic004G137200 Sobic004G131400 Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic004G131400 Sobic002G091200--Sobic005G010000
Octagon: transcription factors


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