Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G012700.2
Synonym FTR, ERH3, ATKTN1, FRC2, FRA2, LUE1, KTN1, BOT1, AAA1, Sb10g001260
Functional annotation katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed
UniProt C5Z2U2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G80350 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g49000.1 : katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G201501 - -
4 Sobic.001G332100 - -
5 Sobic.002G000800 peptide transporter, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
6 Sobic.003G191300 - -
7 Sobic.005G077001 - -
8 Sobic.003G428500 expressed protein -
9 Sobic.010G129450 - -
10 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
11 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
12 Sobic.003G064100 expressed protein -
13 Sobic.007G041100 OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
14 Sobic.003G133201 - -
15 Sobic.001G325850 - -
16 Sobic.003G391000 lipase, putative, expressed -
17 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -
18 Sobic.009G110333 - -
19 Sobic.004G258000 expressed protein -
20 Sobic.005G110505 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic010G012700--Sobic002G014300 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G012700--Sobic003G075300 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic010G012700--Sobic005G201501 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic010G012700--Sobic001G332100 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic002G000800 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic010G012700--Sobic003G191300 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic010G012700--Sobic005G077001 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic010G012700--Sobic003G428500 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic010G012700--Sobic010G129450 Sobic002G014300--Sobic010G012700 Sobic002G014300--Sobic005G201501 Sobic002G014300--Sobic003G428500 Sobic002G014300--Sobic003G075300 Sobic002G014300--Sobic001G332100 Sobic002G014300--Sobic002G000800 Sobic002G014300--Sobic005G077001 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic010G129450 Sobic003G075300--Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic010G012700 Sobic003G075300--Sobic005G077001 Sobic003G075300--Sobic003G191300 Sobic003G075300--Sobic002G014300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic005G191200 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic003G075300--Sobic010G014850 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic003G075300--Sobic010G158050 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G075300--Sobic004G258000 Sobic005G201501--Sobic005G077001 Sobic005G201501--Sobic003G075300 Sobic005G201501--Sobic003G191300 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic005G201501--Sobic005G058600 Sobic005G201501--Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic004G258000 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic002G014300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G201501--Sobic003G133201 Sobic001G332100--Sobic010G012700 Sobic001G332100--Sobic002G014300 Sobic001G332100--Sobic002G000800 Sobic001G332100--Sobic003G075300 Sobic001G332100--Sobic005G201501 Sobic001G332100--Sobic003G428500 Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic001G332100--Sobic008G056800 Sobic004G174600 Sobic004G174600 Sobic001G332100--Sobic004G174600 Sobic001G332100--Sobic003G191300 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic002G000800--Sobic003G064100 Sobic002G000800--Sobic002G014300 Sobic002G000800--Sobic010G012700 Sobic002G000800--Sobic005G201501 Sobic002G000800--Sobic005G077001 Sobic002G000800--Sobic003G428500 Sobic002G000800--Sobic003G075300 Sobic002G000800--Sobic005G058600 Sobic002G000800--Sobic001G332100 Sobic003G191300--Sobic005G201501 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic003G191300--Sobic002G402900 Sobic003G191300--Sobic005G077001 Sobic003G191300--Sobic005G058600 Sobic003G191300--Sobic003G075300 Sobic008G121600 Sobic008G121600 Sobic003G191300--Sobic008G121600 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic003G191300--Sobic001G435300 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic003G191300--Sobic008G169101 Sobic003G191300--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic003G428500--Sobic001G021200 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic003G428500--Sobic008G168500 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic003G428500--Sobic008G088500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic003G428500--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic003G428500--Sobic005G058000 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic001G364300 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic003G428500--Sobic005G007200 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic003G428500--Sobic005G058200 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic003G428500--Sobic004G003300 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic010G129450--Sobic009G060100 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic010G129450--Sobic001G136000 Sobic010G129450--Sobic005G058600 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic003G133201 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic010G129450--Sobic003G191200 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic010G129450--Sobic010G123800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic010G129450--Sobic005G058300 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic010G129450--Sobic007G081100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.