Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G428500.1
Synonym Sb03g046060
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W1I0
Pfam PF03478
Panther DB PTHR11102 PTHR11102:SF82
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G17036 : F-box family protein with a domain of unknown function (DUF295)
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g08070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK24016
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -
2 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
3 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -
4 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G058000 expressed protein -
6 Sobic.001G364300 - -
7 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
8 Sobic.005G058200 expressed protein -
9 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
10 Sobic.010G202400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
11 Sobic.008G095500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
12 Sobic.008G177001 - -
13 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
14 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.004G086900 - -
16 Sobic.001G241700 MBTB52 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
17 Sobic.007G110800 expressed protein -
18 Sobic.004G002700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
19 Sobic.005G087732 - -
20 Sobic.007G167950 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic003G428500--Sobic001G021200 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic003G428500--Sobic008G168500 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic003G428500--Sobic008G088500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic003G428500--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic003G428500--Sobic005G058000 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic001G364300 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic003G428500--Sobic005G007200 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic003G428500--Sobic005G058200 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic003G428500--Sobic004G003300 Sobic001G021200--Sobic005G058000 Sobic001G021200--Sobic002G096600 Sobic001G021200--Sobic008G168500 Sobic001G021200--Sobic008G088500 Sobic001G021200--Sobic003G428500 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic001G021200--Sobic008G095500 Sobic001G021200--Sobic001G364300 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic001G021200--Sobic010G202400 Sobic001G021200--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic008G088500 Sobic008G168500--Sobic002G096600 Sobic008G168500--Sobic005G058000 Sobic008G168500--Sobic001G364300 Sobic008G168500--Sobic005G058200 Sobic008G168500--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic001G021200 Sobic008G168500--Sobic008G095500 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic008G168500--Sobic008G177001 Sobic008G088500--Sobic008G168500 Sobic008G088500--Sobic001G364300 Sobic008G088500--Sobic002G096600 Sobic008G088500--Sobic005G058000 Sobic008G088500--Sobic005G058200 Sobic008G088500--Sobic005G007200 Sobic008G088500--Sobic001G021200 Sobic008G088500--Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G177001 Sobic002G096600--Sobic005G058000 Sobic002G096600--Sobic008G168500 Sobic002G096600--Sobic008G088500 Sobic002G096600--Sobic001G021200 Sobic002G096600--Sobic001G364300 Sobic002G096600--Sobic005G007200 Sobic002G096600--Sobic008G095500 Sobic002G096600--Sobic005G058200 Sobic002G096600--Sobic010G202400 Sobic005G058000--Sobic002G096600 Sobic005G058000--Sobic008G168500 Sobic005G058000--Sobic008G088500 Sobic005G058000--Sobic001G021200 Sobic005G058000--Sobic001G364300 Sobic005G058000--Sobic005G007200 Sobic005G058000--Sobic008G095500 Sobic005G058000--Sobic005G058200 Sobic005G058000--Sobic010G202400 Sobic001G364300--Sobic005G058200 Sobic001G364300--Sobic008G088500 Sobic001G364300--Sobic008G168500 Sobic001G364300--Sobic005G007200 Sobic001G364300--Sobic002G096600 Sobic001G364300--Sobic005G058000 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic001G364300--Sobic007G082300 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic001G364300--Sobic004G086900 Sobic001G364300--Sobic008G177001 Sobic005G007200--Sobic005G058200 Sobic005G007200--Sobic001G364300 Sobic005G007200--Sobic008G088500 Sobic005G007200--Sobic008G168500 Sobic005G007200--Sobic007G082300 Sobic005G007200--Sobic004G086900 Sobic005G007200--Sobic002G096600 Sobic005G007200--Sobic005G058000 Sobic005G007200--Sobic008G177001 Sobic005G058200--Sobic001G364300 Sobic005G058200--Sobic005G007200 Sobic005G058200--Sobic008G088500 Sobic005G058200--Sobic007G082300 Sobic005G058200--Sobic008G168500 Sobic005G058200--Sobic004G086900 Sobic005G058200--Sobic008G177001 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic005G058200--Sobic007G110800 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic005G058200--Sobic005G087732 Sobic004G003300--Sobic001G021200 Sobic004G002700 Sobic004G002700 Sobic004G003300--Sobic004G002700 Sobic004G003300--Sobic003G428500 Sobic004G003300--Sobic010G202400 Sobic004G003300--Sobic008G088500 Sobic004G003300--Sobic008G168500 Sobic004G003300--Sobic005G058000 Sobic004G003300--Sobic002G096600 Sobic004G003300--Sobic008G095500
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.