Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G191200.1
Synonym Sb05g024780
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJD4
Pfam PF00271 PF00270
Panther DB PTHR24031
NCBI CDD -
KEGG Orthology K12858; DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
Gene Ontology GO:0005524; ATP binding GO:0003676nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33730 : P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g50090.4 : transposon protein, putative, CACTA, En/Spm sub-class, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a007807 , Zm00025a017015
Brachypodium KQK13590
Barley HORVU4Hr1G007110.31 , HORVU4Hr1G007110.30 , HORVU4Hr1G007110.32 , HORVU4Hr1G007110.28 , HORVU4Hr1G007110.29 , HORVU4Hr1G007110.20 , HORVU4Hr1G007110.21 , HORVU4Hr1G007110.22 , HORVU4Hr1G007110.23 , HORVU4Hr1G007110.24 , HORVU4Hr1G007110.25 , HORVU4Hr1G007110.26 , HORVU4Hr1G007110.27 , HORVU4Hr1G007110.10 , HORVU4Hr1G007110.9 , HORVU4Hr1G007110.8 , HORVU4Hr1G007110.1 , HORVU4Hr1G007110.3 , HORVU4Hr1G007110.2 , HORVU4Hr1G007110.5 , HORVU4Hr1G007110.4 , HORVU4Hr1G007110.7 , HORVU4Hr1G007110.6 , HORVU4Hr1G007110.19 , HORVU4Hr1G007110.18 , HORVU4Hr1G007110.15 , HORVU4Hr1G007110.14 , HORVU4Hr1G007110.17 , HORVU4Hr1G007110.16 , HORVU4Hr1G007110.11 , HORVU4Hr1G007110.13 , HORVU4Hr1G007110.12 , HORVU6Hr1G080730.2 , HORVU6Hr1G080730.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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18 Sobic.006G230000 - -
19 Sobic.005G077001 - -
20 Sobic.004G075250 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G191200--Sobic010G014850 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic005G191200--Sobic003G406060 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic005G191200--Sobic003G075300 SobicK028900 SobicK028900 Sobic005G191200--SobicK028900 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic005G191200--Sobic001G144150 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G191200--Sobic010G158050 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic005G191200--Sobic008G164000 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic005G191200--Sobic005G200100 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G191200--Sobic010G012700 Sobic010G014850--Sobic010G158050 Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic010G014850--Sobic004G057000 Sobic010G014850--SobicK028900 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic010G014850--Sobic010G157900 Sobic010G014850--Sobic005G191200 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic010G014850--Sobic005G199800 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic003G075300 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic010G014850--Sobic005G041450 Sobic003G406060--Sobic005G191200 Sobic003G406060--Sobic005G200100 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic003G406060--Sobic006G189600 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic003G406060--Sobic001G251000 Sobic003G406060--Sobic010G014850 Sobic003G406060--SobicK028900 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic003G406060--Sobic002G106700 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic003G406060--Sobic003G078000 Sobic003G406060--Sobic008G164000 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic010G012700 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic003G075300--Sobic005G077001 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic003G075300--Sobic003G191300 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic003G075300--Sobic002G014300 Sobic003G075300--Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic010G014850 Sobic003G075300--Sobic010G158050 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G075300--Sobic004G258000 SobicK028900--Sobic010G014850 SobicK028900--Sobic010G158050 SobicK028900--Sobic005G191200 SobicK028900--Sobic004G057000 SobicK028900--Sobic005G199800 SobicK028900--Sobic010G157900 SobicK028900--Sobic003G075300 SobicK028900--Sobic001G144150 SobicK028900--Sobic003G406060 Sobic001G144150--Sobic005G191200 Sobic001G144150--Sobic010G014850 Sobic001G144150--Sobic003G075300 Sobic001G144150--SobicK028900 Sobic001G144150--Sobic010G158050 Sobic001G144150--Sobic003G406060 Sobic001G144150--Sobic010G012700 Sobic001G144150--Sobic005G201501 Sobic001G144150--Sobic008G164000 Sobic010G158050--Sobic004G057000 Sobic010G158050--Sobic010G014850 Sobic010G158050--Sobic010G157900 Sobic010G158050--Sobic005G199800 Sobic010G158050--Sobic004G075250 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic010G158050--Sobic002G223650 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic003G075300 Sobic010G158050--SobicK028900 Sobic008G164000--Sobic005G191200 Sobic008G164000--Sobic002G106700 Sobic008G164000--Sobic003G406060 Sobic008G091785 Sobic008G091785 Sobic008G164000--Sobic008G091785 Sobic006G230000 Sobic006G230000 Sobic008G164000--Sobic006G230000 Sobic007G007400 Sobic007G007400 Sobic008G164000--Sobic007G007400 Sobic008G164000--Sobic001G144150 Sobic001G135650 Sobic001G135650 Sobic008G164000--Sobic001G135650 Sobic008G164000--SobicK028900 Sobic005G200100--Sobic001G251000 Sobic005G200100--Sobic003G406060 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic005G200100--Sobic003G302532 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic005G200100--Sobic004G348000 Sobic001G252151 Sobic001G252151 Sobic005G200100--Sobic001G252151 Sobic005G200100--Sobic010G014850 Sobic005G200100--Sobic005G191200 Sobic005G200100--Sobic010G158050 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic005G200100--Sobic004G059200 Sobic010G012700--Sobic002G014300 Sobic010G012700--Sobic003G075300 Sobic010G012700--Sobic005G201501 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic010G012700--Sobic001G332100 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic003G191300 Sobic010G012700--Sobic005G077001 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic010G012700--Sobic003G428500 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic010G012700--Sobic010G129450
Octagon: transcription factors


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