Gene annotation
Transcriptome id Sobic.K028900.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A109NDF3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G014850 - -
2 Sobic.010G158050 - -
3 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
4 Sobic.004G057000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G199800 expressed protein K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
6 Sobic.010G157900 - -
7 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G144150 - -
9 Sobic.003G406060 - -
10 Sobic.005G041450 - -
11 Sobic.004G075250 - -
12 Sobic.005G200100 - -
13 Sobic.005G201501 - -
14 Sobic.001G467400 expressed protein -
15 Sobic.006G276801 - -
16 Sobic.005G166432 - -
17 Sobic.002G223650 - -
18 Sobic.004G258000 expressed protein -
19 Sobic.003G191300 - -
20 Sobic.008G164000 OsFBX358 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample SobicK028900 SobicK028900 Sobic010G014850 Sobic010G014850 SobicK028900--Sobic010G014850 Sobic010G158050 Sobic010G158050 SobicK028900--Sobic010G158050 Sobic005G191200 Sobic005G191200 SobicK028900--Sobic005G191200 Sobic004G057000 Sobic004G057000 SobicK028900--Sobic004G057000 Sobic005G199800 Sobic005G199800 SobicK028900--Sobic005G199800 Sobic010G157900 Sobic010G157900 SobicK028900--Sobic010G157900 Sobic003G075300 Sobic003G075300 SobicK028900--Sobic003G075300 Sobic001G144150 Sobic001G144150 SobicK028900--Sobic001G144150 Sobic003G406060 Sobic003G406060 SobicK028900--Sobic003G406060 Sobic010G014850--Sobic010G158050 Sobic010G014850--Sobic004G057000 Sobic010G014850--SobicK028900 Sobic010G014850--Sobic010G157900 Sobic010G014850--Sobic005G191200 Sobic010G014850--Sobic005G199800 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic003G075300 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic010G014850--Sobic005G041450 Sobic010G158050--Sobic004G057000 Sobic010G158050--Sobic010G014850 Sobic010G158050--Sobic010G157900 Sobic010G158050--Sobic005G199800 Sobic010G158050--Sobic004G075250 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic010G158050--Sobic002G223650 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic003G075300 Sobic010G158050--SobicK028900 Sobic005G191200--Sobic010G014850 Sobic005G191200--Sobic003G406060 Sobic005G191200--Sobic003G075300 Sobic005G191200--SobicK028900 Sobic005G191200--Sobic001G144150 Sobic005G191200--Sobic010G158050 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic005G191200--Sobic008G164000 Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic005G191200--Sobic005G200100 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G191200--Sobic010G012700 Sobic004G057000--Sobic010G158050 Sobic004G057000--Sobic010G157900 Sobic004G057000--Sobic005G199800 Sobic004G057000--Sobic010G014850 Sobic004G057000--Sobic004G075250 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic004G057000--Sobic002G210150 Sobic004G057000--Sobic002G223650 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic004G057000--Sobic005G192000 Sobic004G057000--Sobic001G467400 Sobic005G199800--Sobic004G057000 Sobic005G199800--Sobic010G158050 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic005G199800--Sobic009G072600 Sobic005G199800--Sobic010G157900 Sobic002G061732 Sobic002G061732 Sobic005G199800--Sobic002G061732 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic005G199800--Sobic002G323200 Sobic005G199800--Sobic005G192000 Sobic005G199800--Sobic010G014850 Sobic005G199800--Sobic002G210150 Sobic010G157900--Sobic004G057000 Sobic010G157900--Sobic010G158050 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G075250 Sobic010G157900--Sobic002G223650 Sobic010G157900--Sobic005G199800 Sobic010G157900--Sobic002G210150 Sobic010G157900--Sobic005G192000 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic010G157900--Sobic003G274100 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic010G012700 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic003G075300--Sobic005G077001 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic003G075300--Sobic003G191300 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic003G075300--Sobic002G014300 Sobic003G075300--Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic010G014850 Sobic003G075300--Sobic010G158050 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G075300--Sobic004G258000 Sobic001G144150--Sobic005G191200 Sobic001G144150--Sobic010G014850 Sobic001G144150--Sobic003G075300 Sobic001G144150--SobicK028900 Sobic001G144150--Sobic010G158050 Sobic001G144150--Sobic003G406060 Sobic001G144150--Sobic010G012700 Sobic001G144150--Sobic005G201501 Sobic001G144150--Sobic008G164000 Sobic003G406060--Sobic005G191200 Sobic003G406060--Sobic005G200100 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic003G406060--Sobic006G189600 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic003G406060--Sobic001G251000 Sobic003G406060--Sobic010G014850 Sobic003G406060--SobicK028900 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic003G406060--Sobic002G106700 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic003G406060--Sobic003G078000 Sobic003G406060--Sobic008G164000
Octagon: transcription factors


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