Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G200100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PTM7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G251000 - -
2 Sobic.003G406060 - -
3 Sobic.003G302532 - -
4 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
5 Sobic.001G252151 - -
6 Sobic.010G014850 - -
7 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
8 Sobic.010G158050 - -
9 Sobic.004G059200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
10 Sobic.004G057000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
11 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.010G157900 - -
13 Sobic.010G026200 Sec1 family transport protein, putative, expressed K15292: STXBP1, syntaxin-binding protein 1
14 Sobic.K028900 - -
15 Sobic.004G075250 - -
16 Sobic.009G125100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
17 Sobic.005G199800 expressed protein K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
18 Sobic.001G196400 transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, putative, expressed -
19 Sobic.004G042800 protein kinase domain containing protein, expressed -
20 Sobic.001G272100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic005G200100 Sobic005G200100 Sobic001G251000 Sobic001G251000 Sobic005G200100--Sobic001G251000 Sobic003G406060 Sobic003G406060 Sobic005G200100--Sobic003G406060 Sobic003G302532 Sobic003G302532 Sobic005G200100--Sobic003G302532 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic005G200100--Sobic004G348000 Sobic001G252151 Sobic001G252151 Sobic005G200100--Sobic001G252151 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G200100--Sobic010G014850 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic005G200100--Sobic005G191200 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G200100--Sobic010G158050 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic005G200100--Sobic004G059200 Sobic001G251000--Sobic005G200100 Sobic001G251000--Sobic004G348000 Sobic001G251000--Sobic003G302532 Sobic001G251000--Sobic001G252151 Sobic001G251000--Sobic004G059200 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G251000--Sobic009G125100 Sobic004G252850 Sobic004G252850 Sobic001G251000--Sobic004G252850 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic001G251000--Sobic010G026200 Sobic001G251000--Sobic003G406060 Sobic003G406060--Sobic005G191200 Sobic003G406060--Sobic005G200100 Sobic006G189600 Sobic006G189600 Sobic003G406060--Sobic006G189600 Sobic003G406060--Sobic001G251000 Sobic003G406060--Sobic010G014850 SobicK028900 SobicK028900 Sobic003G406060--SobicK028900 Sobic002G106700 Sobic002G106700 Sobic003G406060--Sobic002G106700 Sobic003G078000 Sobic003G078000 Sobic003G406060--Sobic003G078000 Sobic008G164000 Sobic008G164000 Sobic003G406060--Sobic008G164000 Sobic003G302532--Sobic001G251000 Sobic003G302532--Sobic005G200100 Sobic003G302532--Sobic004G348000 Sobic003G302532--Sobic009G125100 Sobic003G302532--Sobic004G059200 Sobic003G302532--Sobic001G252151 Sobic003G302532--Sobic004G252850 Sobic010G217700 Sobic010G217700 Sobic003G302532--Sobic010G217700 Sobic001G272100 Sobic001G272100 Sobic003G302532--Sobic001G272100 Sobic004G348000--Sobic004G059200 Sobic004G348000--Sobic001G251000 Sobic004G348000--Sobic009G125100 Sobic004G060400 Sobic004G060400 Sobic004G348000--Sobic004G060400 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic004G348000--Sobic007G161100 Sobic009G176200 Sobic009G176200 Sobic004G348000--Sobic009G176200 Sobic004G348000--Sobic005G200100 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic004G348000--Sobic005G039000 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic004G348000--Sobic001G196400 Sobic001G252151--Sobic001G251000 Sobic001G252151--Sobic005G200100 Sobic001G252151--Sobic004G348000 Sobic001G252151--Sobic003G302532 Sobic001G252151--Sobic004G059200 Sobic001G252151--Sobic009G125100 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic001G252151--Sobic004G042800 Sobic001G252151--Sobic010G026200 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic001G252151--Sobic004G160000 Sobic010G014850--Sobic010G158050 Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic010G014850--Sobic004G057000 Sobic010G014850--SobicK028900 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic010G014850--Sobic010G157900 Sobic010G014850--Sobic005G191200 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic010G014850--Sobic005G199800 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic004G075250 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G014850--Sobic003G075300 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic010G014850--Sobic005G041450 Sobic005G191200--Sobic010G014850 Sobic005G191200--Sobic003G406060 Sobic005G191200--Sobic003G075300 Sobic005G191200--SobicK028900 Sobic001G144150 Sobic001G144150 Sobic005G191200--Sobic001G144150 Sobic005G191200--Sobic010G158050 Sobic005G191200--Sobic008G164000 Sobic005G191200--Sobic005G200100 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic005G191200--Sobic010G012700 Sobic010G158050--Sobic004G057000 Sobic010G158050--Sobic010G014850 Sobic010G158050--Sobic010G157900 Sobic010G158050--Sobic005G199800 Sobic010G158050--Sobic004G075250 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic010G158050--Sobic002G223650 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic003G075300 Sobic010G158050--SobicK028900 Sobic004G059200--Sobic007G161100 Sobic004G059200--Sobic010G026200 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic004G059200--Sobic004G327000 Sobic004G059200--Sobic004G160000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic004G059200--Sobic006G018701 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic004G059200--Sobic002G406801 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic004G059200--Sobic006G066050 Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic004G059200--Sobic009G103650 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic004G059200--Sobic009G021000
Octagon: transcription factors


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