Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G272100.1
Synonym Sb01g026680
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WPS6
Pfam -
Panther DB PTHR34791 PTHR34791:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g17210.1 : OsFBX43 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G015200 OsFBO11 - F-box and other domain containing protein, expressed -
2 Sobic.009G125100 pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16, putative, expressed K12813: pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase DHX16
3 Sobic.007G112832 - -
4 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
5 Sobic.004G059200 inactive receptor kinase At2g26730 precursor, putative, expressed -
6 Sobic.009G042800 expressed protein -
7 Sobic.003G066300 expressed protein -
8 Sobic.002G087600 OsFBX231 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.001G538425 - -
10 Sobic.002G406801 - -
11 Sobic.003G064100 expressed protein -
12 Sobic.004G348000 white-brown complex homolog protein, putative, expressed -
13 Sobic.009G103650 - -
14 Sobic.009G021000 exocyst complex component 6, putative, expressed -
15 Sobic.004G095100 zinc knuckle family protein, expressed K03257: translation initiation factor 4A
16 Sobic.006G066050 - -
17 Sobic.001G196400 transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, putative, expressed -
18 Sobic.004G277900 - -
19 Sobic.003G307500 zinc finger A20 and AN1 domain-containing stress-associated protein, putative, expressed -
20 Sobic.005G052400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G272100 Sobic001G272100 Sobic002G015200 Sobic002G015200 Sobic001G272100--Sobic002G015200 Sobic009G125100 Sobic009G125100 Sobic001G272100--Sobic009G125100 Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic001G272100--Sobic007G112832 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic001G272100--Sobic007G209900 Sobic004G059200 Sobic004G059200 Sobic001G272100--Sobic004G059200 Sobic009G042800 Sobic009G042800 Sobic001G272100--Sobic009G042800 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic001G272100--Sobic003G066300 Sobic002G087600 Sobic002G087600 Sobic001G272100--Sobic002G087600 Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic001G272100--Sobic001G538425 Sobic002G015200--Sobic001G272100 Sobic002G015200--Sobic009G042800 Sobic002G015200--Sobic002G087600 Sobic002G015200--Sobic009G125100 Sobic003G307500 Sobic003G307500 Sobic002G015200--Sobic003G307500 Sobic009G021000 Sobic009G021000 Sobic002G015200--Sobic009G021000 Sobic006G066050 Sobic006G066050 Sobic002G015200--Sobic006G066050 Sobic002G015200--Sobic007G112832 Sobic002G015200--Sobic004G059200 Sobic009G125100--Sobic009G042800 Sobic009G125100--Sobic004G059200 Sobic009G125100--Sobic009G021000 Sobic004G348000 Sobic004G348000 Sobic009G125100--Sobic004G348000 Sobic009G125100--Sobic006G066050 Sobic009G125100--Sobic002G087600 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic009G125100--Sobic007G161100 Sobic009G125100--Sobic001G272100 Sobic009G125100--Sobic002G015200 Sobic007G112832--Sobic007G209900 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G112832--Sobic001G196400 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic007G112832--Sobic001G386900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic007G112832--Sobic006G232700 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic007G112832--Sobic001G435300 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic007G112832--Sobic005G077001 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic007G112832--Sobic005G058600 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G112832--Sobic003G317000 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic007G112832--Sobic003G133201 Sobic007G209900--Sobic007G112832 Sobic007G209900--Sobic003G066300 Sobic007G209900--Sobic001G196400 Sobic007G209900--Sobic006G232700 Sobic007G209900--Sobic001G435300 Sobic007G209900--Sobic001G386900 Sobic003G391000 Sobic003G391000 Sobic007G209900--Sobic003G391000 Sobic004G277900 Sobic004G277900 Sobic007G209900--Sobic004G277900 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic007G209900--Sobic005G220680 Sobic004G059200--Sobic007G161100 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic004G059200--Sobic010G026200 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic004G059200--Sobic004G327000 Sobic004G160000 Sobic004G160000 Sobic004G059200--Sobic004G160000 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic004G059200--Sobic006G018701 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic004G059200--Sobic002G406801 Sobic004G059200--Sobic006G066050 Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic004G059200--Sobic009G103650 Sobic004G059200--Sobic009G021000 Sobic009G042800--Sobic009G021000 Sobic009G042800--Sobic006G066050 Sobic009G042800--Sobic009G125100 Sobic009G042800--Sobic007G161100 Sobic009G042800--Sobic004G059200 Sobic009G042800--Sobic002G015200 Sobic009G042800--Sobic002G087600 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic009G042800--Sobic003G054800 Sobic009G042800--Sobic004G327000 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic003G066300--Sobic003G064100 Sobic003G066300--Sobic007G209900 Sobic003G066300--Sobic001G435300 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic003G066300--Sobic003G208900 Sobic003G066300--Sobic007G112832 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic003G066300--Sobic004G042800 Sobic009G249400 Sobic009G249400 Sobic003G066300--Sobic009G249400 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic003G066300--Sobic004G031900 Sobic003G066300--Sobic001G196400 Sobic002G087600--Sobic009G021000 Sobic002G087600--Sobic006G066050 Sobic002G087600--Sobic009G125100 Sobic007G127800 Sobic007G127800 Sobic002G087600--Sobic007G127800 Sobic002G087600--Sobic009G042800 Sobic002G087600--Sobic004G059200 Sobic002G087600--Sobic002G015200 Sobic002G087600--Sobic007G161100 Sobic002G087600--Sobic002G406801 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic001G538425--Sobic007G031200 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic001G538425--Sobic003G191200 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic001G538425--Sobic007G198900 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic001G538425--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic001G538425--Sobic007G082100 Sobic001G538425--Sobic005G058600 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic001G538425--Sobic002G204500 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic001G538425--Sobic004G100300 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic001G538425--Sobic003G070400
Octagon: transcription factors


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