Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G112832.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R984
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g20920.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G209900 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
2 Sobic.001G196400 transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 4, putative, expressed -
3 Sobic.001G386900 pyruvate kinase, putative, expressed K00873: PK, pyruvate kinase
4 Sobic.006G232700 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
5 Sobic.001G435300 C2 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.005G077001 - -
7 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
8 Sobic.003G317000 BTBN12 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with non-phototropic hypocotyl 3 NPH3 and coiled-coil domains, expressed -
9 Sobic.003G133201 - -
10 Sobic.001G272100 expressed protein -
11 Sobic.007G031200 - -
12 Sobic.004G277900 - -
13 Sobic.009G110333 - -
14 Sobic.001G538425 - -
15 Sobic.009G182100 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
16 Sobic.004G095100 zinc knuckle family protein, expressed K03257: translation initiation factor 4A
17 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
18 Sobic.004G042800 protein kinase domain containing protein, expressed -
19 Sobic.009G103650 - -
20 Sobic.003G066300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic007G112832 Sobic007G112832 Sobic007G209900 Sobic007G209900 Sobic007G112832--Sobic007G209900 Sobic001G196400 Sobic001G196400 Sobic007G112832--Sobic001G196400 Sobic001G386900 Sobic001G386900 Sobic007G112832--Sobic001G386900 Sobic006G232700 Sobic006G232700 Sobic007G112832--Sobic006G232700 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic007G112832--Sobic001G435300 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic007G112832--Sobic005G077001 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic007G112832--Sobic005G058600 Sobic003G317000 Sobic003G317000 Sobic007G112832--Sobic003G317000 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic007G112832--Sobic003G133201 Sobic007G209900--Sobic007G112832 Sobic003G066300 Sobic003G066300 Sobic007G209900--Sobic003G066300 Sobic007G209900--Sobic001G196400 Sobic007G209900--Sobic006G232700 Sobic007G209900--Sobic001G435300 Sobic007G209900--Sobic001G386900 Sobic003G391000 Sobic003G391000 Sobic007G209900--Sobic003G391000 Sobic004G277900 Sobic004G277900 Sobic007G209900--Sobic004G277900 Sobic005G220680 Sobic005G220680 Sobic007G209900--Sobic005G220680 Sobic001G196400--Sobic003G317000 Sobic001G196400--Sobic006G232700 Sobic007G161100 Sobic007G161100 Sobic001G196400--Sobic007G161100 Sobic003G208900 Sobic003G208900 Sobic001G196400--Sobic003G208900 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic001G196400--Sobic004G327000 Sobic004G042800 Sobic004G042800 Sobic001G196400--Sobic004G042800 Sobic003G305500 Sobic003G305500 Sobic001G196400--Sobic003G305500 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic001G196400--Sobic010G026200 Sobic005G039000 Sobic005G039000 Sobic001G196400--Sobic005G039000 Sobic002G070100 Sobic002G070100 Sobic001G386900--Sobic002G070100 Sobic001G386900--Sobic001G435300 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic001G386900--Sobic004G050900 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic001G386900--Sobic009G182100 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic001G386900--Sobic005G000900 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic001G386900--Sobic007G031200 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic001G386900--Sobic002G156400 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic001G386900--Sobic002G384900 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic001G386900--Sobic006G017700 Sobic006G232700--Sobic001G196400 Sobic006G232700--Sobic003G317000 Sobic010G030500 Sobic010G030500 Sobic006G232700--Sobic010G030500 Sobic006G232700--Sobic003G208900 Sobic006G232700--Sobic004G042800 Sobic006G232700--Sobic003G305500 Sobic006G232700--Sobic001G435300 Sobic010G074000 Sobic010G074000 Sobic006G232700--Sobic010G074000 Sobic002G298201 Sobic002G298201 Sobic006G232700--Sobic002G298201 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic001G435300--Sobic008G169101 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic001G435300--Sobic002G402900 Sobic001G435300--Sobic005G058600 Sobic001G435300--Sobic004G042800 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic001G435300--Sobic001G392650 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic001G435300--Sobic009G110700 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic001G435300--Sobic002G049700 Sobic001G366700 Sobic001G366700 Sobic001G435300--Sobic001G366700 Sobic005G191300 Sobic005G191300 Sobic001G435300--Sobic005G191300 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic003G317000--Sobic001G196400 Sobic003G317000--Sobic003G305500 Sobic009G062600 Sobic009G062600 Sobic003G317000--Sobic009G062600 Sobic003G317000--Sobic003G208900 Sobic001G002400 Sobic001G002400 Sobic003G317000--Sobic001G002400 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic003G317000--Sobic003G343000 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic003G317000--Sobic006G164800 Sobic003G317000--Sobic006G232700 Sobic003G317000--Sobic004G042800 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic003G133201--Sobic006G017700
Octagon: transcription factors


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