Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G538425.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5SBZ5
Pfam -
Panther DB PTHR16047
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G031200 - -
2 Sobic.003G191200 expressed protein -
3 Sobic.007G198900 MBTB32 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.007G081100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.007G082100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
7 Sobic.002G204500 Phospholipase D alpha 2 PLD Alpha 2 (At)(PubMedID : 27208977)@phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
8 Sobic.004G100300 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
9 Sobic.003G070400 expressed protein -
10 Sobic.004G095100 zinc knuckle family protein, expressed K03257: translation initiation factor 4A
11 Sobic.007G204200 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
12 Sobic.004G057300 expressed protein -
13 Sobic.009G182100 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
14 Sobic.007G110800 expressed protein -
15 Sobic.006G170500 aquaporin protein, putative, expressed K09873: aquaporin TIP
16 Sobic.010G123800 expressed protein -
17 Sobic.007G081800 MBTB22 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
18 Sobic.005G058300 expressed protein -
19 Sobic.004G046700 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
20 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase


Gene co-expression network
sample Sobic001G538425 Sobic001G538425 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic001G538425--Sobic007G031200 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic001G538425--Sobic003G191200 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic001G538425--Sobic007G198900 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic001G538425--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic001G538425--Sobic007G082100 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic001G538425--Sobic005G058600 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic001G538425--Sobic002G204500 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic001G538425--Sobic004G100300 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic001G538425--Sobic003G070400 Sobic007G031200--Sobic003G191200 Sobic007G031200--Sobic004G100300 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic007G031200--Sobic002G182701 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic007G031200--Sobic005G000900 Sobic007G031200--Sobic007G082100 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic007G031200--Sobic009G182100 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic007G031200--Sobic006G017900 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic007G031200--Sobic001G211700 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic007G031200--Sobic006G017700 Sobic003G191200--Sobic007G082100 Sobic003G191200--Sobic007G031200 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic003G191200--Sobic004G046700 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic003G191200--Sobic010G123800 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic003G191200--Sobic007G081800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic003G191200--Sobic005G058300 Sobic003G191200--Sobic006G017900 Sobic003G191200--Sobic004G100300 Sobic003G191200--Sobic001G211700 Sobic007G198900--Sobic003G191200 Sobic007G198900--Sobic007G082100 Sobic007G198900--Sobic005G058300 Sobic007G198900--Sobic007G081800 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic007G198900--Sobic007G110800 Sobic007G198900--Sobic010G123800 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic007G198900--Sobic007G167950 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic007G198900--Sobic005G087732 Sobic007G198900--Sobic007G031200 Sobic007G081100--Sobic002G204500 Sobic007G081100--Sobic007G082100 Sobic007G081100--Sobic003G191200 Sobic007G081100--Sobic003G070400 Sobic007G081100--Sobic007G031200 Sobic007G081100--Sobic004G100300 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic007G081100--Sobic009G060100 Sobic007G081100--Sobic002G182701 Sobic007G081100--Sobic001G211700 Sobic007G082100--Sobic003G191200 Sobic007G082100--Sobic004G046700 Sobic007G082100--Sobic001G211700 Sobic007G082100--Sobic006G017900 Sobic007G082100--Sobic010G123800 Sobic007G082100--Sobic002G182701 Sobic007G082100--Sobic009G060100 Sobic007G082100--Sobic007G031200 Sobic007G082100--Sobic007G081800 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic002G204500--Sobic007G081100 Sobic002G204500--Sobic003G070400 Sobic002G204500--Sobic007G031200 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G204500--Sobic004G168200 Sobic007G204200 Sobic007G204200 Sobic002G204500--Sobic007G204200 Sobic002G204500--Sobic004G100300 Sobic002G204500--Sobic007G082100 Sobic002G204500--Sobic003G191200 Sobic005G049850 Sobic005G049850 Sobic002G204500--Sobic005G049850 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic004G100300--Sobic002G384900 Sobic004G100300--Sobic002G182701 Sobic004G100300--Sobic006G017900 Sobic004G100300--Sobic005G000900 Sobic004G100300--Sobic006G017700 Sobic004G100300--Sobic007G031200 Sobic004G100300--Sobic001G211700 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic004G100300--Sobic005G221675 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic004G100300--Sobic002G156400 Sobic007G197000 Sobic007G197000 Sobic003G070400--Sobic007G197000 Sobic003G070400--Sobic007G204200 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic003G070400--Sobic010G121700 Sobic009G068400 Sobic009G068400 Sobic003G070400--Sobic009G068400 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic003G070400--Sobic009G234900 Sobic008G024200 Sobic008G024200 Sobic003G070400--Sobic008G024200 Sobic003G004000 Sobic003G004000 Sobic003G070400--Sobic003G004000 Sobic005G037700 Sobic005G037700 Sobic003G070400--Sobic005G037700 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G070400--Sobic009G047100
Octagon: transcription factors


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