Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G103650.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R2X7
Pfam -
Panther DB PTHR11972 PTHR11972:SF44
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G19230 : Riboflavin synthase-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g26660.1 : ferric reductase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G060000 WD40-like domain containing protein, putative, expressed -
2 Sobic.001G053500 expressed protein -
3 Sobic.004G308800 expressed protein -
4 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
5 Sobic.009G244100 - -
6 Sobic.001G409000 - -
7 Sobic.001G392650 - -
8 Sobic.006G018701 - -
9 Sobic.002G406801 - -
10 Sobic.003G160600 uncharacterized protein At4g06744 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.004G327000 STE_PAK_Ste20_STLK.2 - STE kinases include homologs to sterile 7, sterile 11 and sterile 20 from yeast, expressed K08835: OXSR1, serine/threonine-protein kinase OSR1/STK39
12 Sobic.009G110700 OsFBL58 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.009G158300 - -
14 Sobic.010G026200 Sec1 family transport protein, putative, expressed K15292: STXBP1, syntaxin-binding protein 1
15 Sobic.004G160000 potassium transporter, putative, expressed K03549: KUP system potassium uptake protein
16 Sobic.007G001800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.001G188100 expressed protein K15191: La-related protein 7
18 Sobic.008G134600 - -
19 Sobic.006G164800 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
20 Sobic.008G153700 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G103650 Sobic009G103650 Sobic009G060000 Sobic009G060000 Sobic009G103650--Sobic009G060000 Sobic001G053500 Sobic001G053500 Sobic009G103650--Sobic001G053500 Sobic004G308800 Sobic004G308800 Sobic009G103650--Sobic004G308800 Sobic002G049700 Sobic002G049700 Sobic009G103650--Sobic002G049700 Sobic009G244100 Sobic009G244100 Sobic009G103650--Sobic009G244100 Sobic001G409000 Sobic001G409000 Sobic009G103650--Sobic001G409000 Sobic001G392650 Sobic001G392650 Sobic009G103650--Sobic001G392650 Sobic006G018701 Sobic006G018701 Sobic009G103650--Sobic006G018701 Sobic002G406801 Sobic002G406801 Sobic009G103650--Sobic002G406801 Sobic009G158300 Sobic009G158300 Sobic009G060000--Sobic009G158300 Sobic009G060000--Sobic002G049700 Sobic009G060000--Sobic001G409000 Sobic007G001800 Sobic007G001800 Sobic009G060000--Sobic007G001800 Sobic003G445600 Sobic003G445600 Sobic009G060000--Sobic003G445600 Sobic003G160600 Sobic003G160600 Sobic009G060000--Sobic003G160600 Sobic006G164800 Sobic006G164800 Sobic009G060000--Sobic006G164800 Sobic007G145500 Sobic007G145500 Sobic009G060000--Sobic007G145500 Sobic009G016900 Sobic009G016900 Sobic009G060000--Sobic009G016900 Sobic009G110700 Sobic009G110700 Sobic001G053500--Sobic009G110700 Sobic003G245300 Sobic003G245300 Sobic001G053500--Sobic003G245300 Sobic001G192300 Sobic001G192300 Sobic001G053500--Sobic001G192300 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic001G053500--Sobic007G122600 Sobic005G006100 Sobic005G006100 Sobic001G053500--Sobic005G006100 Sobic001G053500--Sobic009G060000 Sobic010G216100 Sobic010G216100 Sobic001G053500--Sobic010G216100 Sobic001G053500--Sobic002G049700 Sobic010G207800 Sobic010G207800 Sobic001G053500--Sobic010G207800 Sobic004G308800--Sobic009G110700 Sobic004G308800--Sobic003G245300 Sobic004G308800--Sobic007G145500 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic004G308800--Sobic002G194300 Sobic004G308800--Sobic010G216100 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic004G308800--Sobic003G351100 Sobic007G095333 Sobic007G095333 Sobic004G308800--Sobic007G095333 Sobic010G215000 Sobic010G215000 Sobic004G308800--Sobic010G215000 Sobic007G160501 Sobic007G160501 Sobic004G308800--Sobic007G160501 Sobic002G049700--Sobic001G392650 Sobic008G134600 Sobic008G134600 Sobic002G049700--Sobic008G134600 Sobic002G049700--Sobic009G060000 Sobic002G049700--Sobic009G158300 Sobic001G092500 Sobic001G092500 Sobic002G049700--Sobic001G092500 Sobic001G188100 Sobic001G188100 Sobic002G049700--Sobic001G188100 Sobic004G134000 Sobic004G134000 Sobic002G049700--Sobic004G134000 Sobic008G043300 Sobic008G043300 Sobic002G049700--Sobic008G043300 Sobic010G276100 Sobic010G276100 Sobic002G049700--Sobic010G276100 Sobic005G198800 Sobic005G198800 Sobic009G244100--Sobic005G198800 Sobic009G244100--Sobic009G110700 Sobic004G054900 Sobic004G054900 Sobic009G244100--Sobic004G054900 Sobic009G244100--Sobic002G049700 Sobic009G244100--Sobic001G392650 Sobic009G244100--Sobic001G053500 Sobic001G063300 Sobic001G063300 Sobic009G244100--Sobic001G063300 Sobic002G021500 Sobic002G021500 Sobic009G244100--Sobic002G021500 Sobic009G244100--Sobic004G308800 Sobic001G409000--Sobic007G001800 Sobic001G409000--Sobic009G016900 Sobic004G217200 Sobic004G217200 Sobic001G409000--Sobic004G217200 Sobic001G409000--Sobic006G164800 Sobic004G062300 Sobic004G062300 Sobic001G409000--Sobic004G062300 Sobic008G153700 Sobic008G153700 Sobic001G409000--Sobic008G153700 Sobic003G394801 Sobic003G394801 Sobic001G409000--Sobic003G394801 Sobic002G414150 Sobic002G414150 Sobic001G409000--Sobic002G414150 Sobic001G269600 Sobic001G269600 Sobic001G409000--Sobic001G269600 Sobic001G392650--Sobic002G049700 Sobic001G392650--Sobic008G134600 Sobic002G330200 Sobic002G330200 Sobic001G392650--Sobic002G330200 Sobic001G392650--Sobic009G158300 Sobic003G343000 Sobic003G343000 Sobic001G392650--Sobic003G343000 Sobic008G124301 Sobic008G124301 Sobic001G392650--Sobic008G124301 Sobic001G109900 Sobic001G109900 Sobic001G392650--Sobic001G109900 Sobic001G392650--Sobic009G060000 Sobic007G139300 Sobic007G139300 Sobic001G392650--Sobic007G139300 Sobic006G018701--Sobic009G158300 Sobic006G018701--Sobic003G160600 Sobic006G018701--Sobic001G392650 Sobic006G018701--Sobic002G049700 Sobic006G018701--Sobic003G343000 Sobic006G018701--Sobic002G406801 Sobic004G327000 Sobic004G327000 Sobic006G018701--Sobic004G327000 Sobic006G018701--Sobic009G060000 Sobic003G343300 Sobic003G343300 Sobic006G018701--Sobic003G343300 Sobic002G406801--Sobic006G018701 Sobic002G406801--Sobic001G392650 Sobic002G406801--Sobic002G330200 Sobic002G406801--Sobic002G021500 Sobic002G406801--Sobic009G158300 Sobic002G406801--Sobic002G049700 Sobic002G406801--Sobic003G160600 Sobic002G406801--Sobic009G060000 Sobic010G026200 Sobic010G026200 Sobic002G406801--Sobic010G026200
Octagon: transcription factors


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