Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G188100.1,Sobic.001G188100.3
Synonym Sb01g016530
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5S6E3 , A0A1B6QJR5
Pfam PF05383 PF00076 PF05383
Panther DB PTHR22792 PTHR22792:SF62
NCBI CDD KOG1855; Predicted RNA-binding protein
KEGG Orthology K15191; La-related protein 7
Gene Ontology GO:0003676; nucleic acid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G19090 : RNA-binding protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g36900.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a006234
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G036400 Ca exchanger 2(PubMedID : 22196357)@sodium/calcium exchanger protein, putative, expressed K07300: chaA, Ca2+:H+ antiporter
2 Sobic.002G049700 potassium channel AKT1, putative, expressed -
3 Sobic.001G409000 - -
4 Sobic.006G164800 eukaryotic translation initiation factor 4G, putative, expressed K03260: translation initiation factor 4G
5 Sobic.007G001800 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
6 Sobic.009G060000 WD40-like domain containing protein, putative, expressed -
7 Sobic.003G445600 KIP1, putative, expressed -
8 Sobic.004G062300 fasciclin-like arabinogalactan precursor protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G134600 - -
10 Sobic.007G145500 adenylyl cyclase-associated protein, putative, expressed K17261: CAP1_2, adenylyl cyclase-associated protein
11 Sobic.009G016900 expressed protein -
12 Sobic.006G282100 DNA binding protein, putative, expressed -
13 Sobic.008G043300 - -
14 Sobic.008G053750 - -
15 Sobic.001G269800 - -
16 Sobic.003G317600 NADH-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial precursor, putative, expressed K17871: NADH:ubiquinone reductase (non-electrogenic)
17 Sobic.004G100900 tetratricopeptide repeat domain containing protein, expressed -
18 Sobic.001G024900 expressed protein -
19 Sobic.007G222100 - -
20 Sobic.001G288400 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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