Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G057000.2
Synonym Sb04g004780
Functional annotation zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5RL19
Pfam PF13639
Panther DB PTHR14155 PTHR14155:SF181
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0008270; zinc ion binding GO:0005515protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G09100 : RING/U-box superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g11860.1 : zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a019096
Brachypodium KQK07050
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.005G041450 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic004G057000--Sobic010G158050 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic004G057000--Sobic010G157900 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic004G057000--Sobic005G199800 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic004G057000--Sobic010G014850 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic004G057000--Sobic004G075250 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic004G057000--Sobic002G210150 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic004G057000--Sobic002G223650 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic004G057000--Sobic005G192000 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic004G057000--Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic004G057000 Sobic010G158050--Sobic010G014850 Sobic010G158050--Sobic010G157900 Sobic010G158050--Sobic005G199800 Sobic010G158050--Sobic004G075250 Sobic010G158050--Sobic002G223650 Sobic010G158050--Sobic001G467400 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic010G158050--Sobic003G075300 SobicK028900 SobicK028900 Sobic010G158050--SobicK028900 Sobic010G157900--Sobic004G057000 Sobic010G157900--Sobic010G158050 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G075250 Sobic010G157900--Sobic002G223650 Sobic010G157900--Sobic005G199800 Sobic010G157900--Sobic002G210150 Sobic010G157900--Sobic005G192000 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic010G157900--Sobic003G274100 Sobic005G199800--Sobic004G057000 Sobic005G199800--Sobic010G158050 Sobic009G072600 Sobic009G072600 Sobic005G199800--Sobic009G072600 Sobic005G199800--Sobic010G157900 Sobic002G061732 Sobic002G061732 Sobic005G199800--Sobic002G061732 Sobic002G323200 Sobic002G323200 Sobic005G199800--Sobic002G323200 Sobic005G199800--Sobic005G192000 Sobic005G199800--Sobic010G014850 Sobic005G199800--Sobic002G210150 Sobic010G014850--Sobic010G158050 Sobic010G014850--Sobic004G057000 Sobic010G014850--SobicK028900 Sobic010G014850--Sobic010G157900 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic010G014850--Sobic005G191200 Sobic010G014850--Sobic005G199800 Sobic010G014850--Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic003G075300 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic010G014850--Sobic005G041450 Sobic004G075250--Sobic001G467400 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic004G075250--Sobic006G276801 Sobic004G075250--Sobic002G223650 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic004G075250--Sobic004G258000 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic004G075250--Sobic003G250160 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic004G075250--Sobic007G081701 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic004G075250--Sobic009G177750 Sobic004G075250--Sobic003G274100 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic004G075250--Sobic002G011300 Sobic002G210150--Sobic005G192000 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic002G210150--Sobic010G034200 Sobic006G219700 Sobic006G219700 Sobic002G210150--Sobic006G219700 Sobic001G400400 Sobic001G400400 Sobic002G210150--Sobic001G400400 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic002G210150--Sobic009G227500 Sobic002G395100 Sobic002G395100 Sobic002G210150--Sobic002G395100 Sobic009G259600 Sobic009G259600 Sobic002G210150--Sobic009G259600 Sobic002G429000 Sobic002G429000 Sobic002G210150--Sobic002G429000 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic002G210150--Sobic009G166000 Sobic002G223650--Sobic003G274100 Sobic002G223650--Sobic006G276801 Sobic002G223650--Sobic003G250160 Sobic002G223650--Sobic007G081701 Sobic002G223650--Sobic001G467400 Sobic002G223650--Sobic009G177750 Sobic002G223650--Sobic004G258000 Sobic007G042800 Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic007G042800 Sobic002G223650--Sobic004G075250 Sobic005G192000--Sobic002G210150 Sobic005G192000--Sobic002G323200 Sobic005G192000--Sobic010G034200 Sobic005G192000--Sobic002G429000 Sobic005G192000--Sobic009G166000 Sobic005G192000--Sobic009G227500 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic005G192000--Sobic004G331500 Sobic005G192000--Sobic001G400400 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic005G192000--Sobic005G209300 Sobic001G467400--Sobic003G250160 Sobic001G467400--Sobic004G075250 Sobic001G467400--Sobic007G081701 Sobic001G467400--Sobic006G276801 Sobic001G467400--Sobic009G177750 Sobic001G467400--Sobic002G223650 Sobic001G467400--Sobic004G258000 Sobic001G467400--Sobic003G274100 Sobic001G197050 Sobic001G197050 Sobic001G467400--Sobic001G197050
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