Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G166432.1,Sobic.005G166432.3,Sobic.005G166432.2
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJG8 , A0A1Z5RIY2 , A0A1Z5RJ29
Pfam -
Panther DB PTHR36478 PTHR36478:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g10030.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
2 Sobic.010G014850 - -
3 Sobic.010G158050 - -
4 Sobic.005G201501 - -
5 Sobic.001G325850 - -
6 Sobic.004G057000 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G077001 - -
8 Sobic.004G075250 - -
9 Sobic.010G157900 - -
10 Sobic.004G258000 expressed protein -
11 Sobic.005G041450 - -
12 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
13 Sobic.003G191300 - -
14 Sobic.006G276801 - -
15 Sobic.005G199800 expressed protein K04730: interleukin-1 receptor-associated kinase 1
16 Sobic.001G467400 expressed protein -
17 Sobic.009G110333 - -
18 Sobic.002G223650 - -
19 Sobic.010G012700 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
20 Sobic.004G042800 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G166432 Sobic005G166432 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic005G166432--Sobic003G075300 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic005G166432--Sobic010G014850 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic005G166432--Sobic010G158050 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic005G166432--Sobic005G201501 Sobic001G325850 Sobic001G325850 Sobic005G166432--Sobic001G325850 Sobic004G057000 Sobic004G057000 Sobic005G166432--Sobic004G057000 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G166432--Sobic005G077001 Sobic004G075250 Sobic004G075250 Sobic005G166432--Sobic004G075250 Sobic010G157900 Sobic010G157900 Sobic005G166432--Sobic010G157900 Sobic003G075300--Sobic005G201501 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic003G075300--Sobic010G012700 Sobic003G075300--Sobic005G077001 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic003G075300--Sobic003G191300 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic003G075300--Sobic002G014300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic010G014850 Sobic003G075300--Sobic010G158050 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G075300--Sobic004G258000 Sobic010G014850--Sobic010G158050 Sobic010G014850--Sobic004G057000 SobicK028900 SobicK028900 Sobic010G014850--SobicK028900 Sobic010G014850--Sobic010G157900 Sobic010G014850--Sobic005G191200 Sobic005G199800 Sobic005G199800 Sobic010G014850--Sobic005G199800 Sobic010G014850--Sobic004G075250 Sobic010G014850--Sobic003G075300 Sobic005G041450 Sobic005G041450 Sobic010G014850--Sobic005G041450 Sobic010G158050--Sobic004G057000 Sobic010G158050--Sobic010G014850 Sobic010G158050--Sobic010G157900 Sobic010G158050--Sobic005G199800 Sobic010G158050--Sobic004G075250 Sobic002G223650 Sobic002G223650 Sobic010G158050--Sobic002G223650 Sobic001G467400 Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic001G467400 Sobic010G158050--Sobic003G075300 Sobic010G158050--SobicK028900 Sobic005G201501--Sobic005G077001 Sobic005G201501--Sobic003G075300 Sobic005G201501--Sobic003G191300 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic005G201501--Sobic005G058600 Sobic005G201501--Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic004G258000 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic002G014300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G201501--Sobic003G133201 Sobic001G325850--Sobic004G258000 Sobic001G325850--Sobic009G110333 Sobic006G276801 Sobic006G276801 Sobic001G325850--Sobic006G276801 Sobic005G112500 Sobic005G112500 Sobic001G325850--Sobic005G112500 Sobic001G325850--Sobic005G077001 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic001G325850--Sobic002G266500 Sobic002G011300 Sobic002G011300 Sobic001G325850--Sobic002G011300 Sobic007G081701 Sobic007G081701 Sobic001G325850--Sobic007G081701 Sobic001G325850--Sobic003G133201 Sobic004G057000--Sobic010G158050 Sobic004G057000--Sobic010G157900 Sobic004G057000--Sobic005G199800 Sobic004G057000--Sobic010G014850 Sobic004G057000--Sobic004G075250 Sobic002G210150 Sobic002G210150 Sobic004G057000--Sobic002G210150 Sobic004G057000--Sobic002G223650 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic004G057000--Sobic005G192000 Sobic004G057000--Sobic001G467400 Sobic005G077001--Sobic009G110333 Sobic005G077001--Sobic005G201501 Sobic005G077001--Sobic005G058600 Sobic005G077001--Sobic004G258000 Sobic005G077001--Sobic003G133201 Sobic005G077001--Sobic002G266500 Sobic005G077001--Sobic006G276801 Sobic005G077001--Sobic001G325850 Sobic005G077001--Sobic005G112500 Sobic004G075250--Sobic001G467400 Sobic004G075250--Sobic006G276801 Sobic004G075250--Sobic002G223650 Sobic004G075250--Sobic004G258000 Sobic003G250160 Sobic003G250160 Sobic004G075250--Sobic003G250160 Sobic004G075250--Sobic007G081701 Sobic009G177750 Sobic009G177750 Sobic004G075250--Sobic009G177750 Sobic003G274100 Sobic003G274100 Sobic004G075250--Sobic003G274100 Sobic004G075250--Sobic002G011300 Sobic010G157900--Sobic004G057000 Sobic010G157900--Sobic010G158050 Sobic004G168150 Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G168150 Sobic010G157900--Sobic004G075250 Sobic010G157900--Sobic002G223650 Sobic010G157900--Sobic005G199800 Sobic010G157900--Sobic002G210150 Sobic010G157900--Sobic005G192000 Sobic010G157900--Sobic003G274100
Octagon: transcription factors


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