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Transcriptome id Sobic.001G332100.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt C5WVP0
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G012700 katanin p60 ATPase-containing subunit, putative, expressed -
2 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -
3 Sobic.002G000800 peptide transporter, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
4 Sobic.003G075300 OsFBX64 - F-box domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G201501 - -
6 Sobic.003G428500 expressed protein -
7 Sobic.008G056800 expressed protein -
8 Sobic.004G174600 "domain confirmed by Pfam database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@multidrug resistance protein, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
9 Sobic.003G191300 - -
10 Sobic.005G191200 - K12858: DDX23, ATP-dependent RNA helicase DDX23/PRP28
11 Sobic.005G077001 - -
12 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -
13 Sobic.010G129450 - -
14 Sobic.003G064100 expressed protein -
15 Sobic.007G041100 OsFBD16 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
17 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
18 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
19 Sobic.005G058000 expressed protein -
20 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic001G332100--Sobic010G012700 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic001G332100--Sobic002G014300 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic001G332100--Sobic002G000800 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic001G332100--Sobic003G075300 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic001G332100--Sobic005G201501 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic001G332100--Sobic003G428500 Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic001G332100--Sobic008G056800 Sobic004G174600 Sobic004G174600 Sobic001G332100--Sobic004G174600 Sobic003G191300 Sobic003G191300 Sobic001G332100--Sobic003G191300 Sobic010G012700--Sobic002G014300 Sobic010G012700--Sobic003G075300 Sobic010G012700--Sobic005G201501 Sobic010G012700--Sobic001G332100 Sobic010G012700--Sobic002G000800 Sobic010G012700--Sobic003G191300 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic010G012700--Sobic005G077001 Sobic010G012700--Sobic003G428500 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic010G012700--Sobic010G129450 Sobic002G014300--Sobic010G012700 Sobic002G014300--Sobic005G201501 Sobic002G014300--Sobic003G428500 Sobic002G014300--Sobic003G075300 Sobic002G014300--Sobic001G332100 Sobic002G014300--Sobic002G000800 Sobic002G014300--Sobic005G077001 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic010G129450 Sobic003G064100 Sobic003G064100 Sobic002G000800--Sobic003G064100 Sobic002G000800--Sobic002G014300 Sobic002G000800--Sobic010G012700 Sobic002G000800--Sobic005G201501 Sobic002G000800--Sobic005G077001 Sobic002G000800--Sobic003G428500 Sobic002G000800--Sobic003G075300 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic002G000800--Sobic005G058600 Sobic002G000800--Sobic001G332100 Sobic003G075300--Sobic005G201501 Sobic003G075300--Sobic010G012700 Sobic003G075300--Sobic005G077001 Sobic003G075300--Sobic003G191300 Sobic003G075300--Sobic002G014300 Sobic005G191200 Sobic005G191200 Sobic003G075300--Sobic005G191200 Sobic010G014850 Sobic010G014850 Sobic003G075300--Sobic010G014850 Sobic010G158050 Sobic010G158050 Sobic003G075300--Sobic010G158050 Sobic004G258000 Sobic004G258000 Sobic003G075300--Sobic004G258000 Sobic005G201501--Sobic005G077001 Sobic005G201501--Sobic003G075300 Sobic005G201501--Sobic003G191300 Sobic005G201501--Sobic005G058600 Sobic005G201501--Sobic010G012700 Sobic005G201501--Sobic004G258000 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic009G110333 Sobic005G201501--Sobic002G014300 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic005G201501--Sobic003G133201 Sobic003G428500--Sobic001G021200 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic003G428500--Sobic008G168500 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic003G428500--Sobic008G088500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic003G428500--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic003G428500--Sobic005G058000 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic001G364300 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic003G428500--Sobic005G007200 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic003G428500--Sobic005G058200 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic003G428500--Sobic004G003300 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic008G056800--Sobic002G304801 Sobic008G056800--Sobic003G428500 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic008G056800--Sobic002G099700 Sobic008G056800--Sobic001G021200 Sobic008G056800--Sobic008G168500 Sobic008G056800--Sobic002G096600 Sobic008G056800--Sobic005G058000 Sobic008G056800--Sobic002G014300 Sobic008G056800--Sobic008G088500 Sobic006G276600 Sobic006G276600 Sobic004G174600--Sobic006G276600 Sobic004G254700 Sobic004G254700 Sobic004G174600--Sobic004G254700 Sobic005G041500 Sobic005G041500 Sobic004G174600--Sobic005G041500 Sobic002G019300 Sobic002G019300 Sobic004G174600--Sobic002G019300 Sobic009G149100 Sobic009G149100 Sobic004G174600--Sobic009G149100 Sobic004G335400 Sobic004G335400 Sobic004G174600--Sobic004G335400 Sobic008G071700 Sobic008G071700 Sobic004G174600--Sobic008G071700 Sobic004G174600--Sobic002G014300 Sobic002G298600 Sobic002G298600 Sobic004G174600--Sobic002G298600 Sobic003G191300--Sobic005G201501 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic003G191300--Sobic002G402900 Sobic003G191300--Sobic005G077001 Sobic003G191300--Sobic005G058600 Sobic003G191300--Sobic003G075300 Sobic008G121600 Sobic008G121600 Sobic003G191300--Sobic008G121600 Sobic001G435300 Sobic001G435300 Sobic003G191300--Sobic001G435300 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic003G191300--Sobic008G169101 Sobic003G191300--Sobic004G258000
Octagon: transcription factors


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