Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G056800.1
Synonym Sb08g004770
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6PBS5
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33120 PTHR33120:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g49126.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G304801 - -
2 Sobic.003G428500 expressed protein -
3 Sobic.002G099700 OsFBX195 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -
5 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
6 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G058000 expressed protein -
8 Sobic.002G014300 OsFBX213 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -
10 Sobic.010G129450 - -
11 Sobic.008G095500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
12 Sobic.005G058200 expressed protein -
13 Sobic.001G364300 - -
14 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
15 Sobic.004G003300 integral membrane protein DUF6 containing protein, expressed -
16 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
17 Sobic.008G177001 - -
18 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.010G202400 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.004G086900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G056800 Sobic008G056800 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic008G056800--Sobic002G304801 Sobic003G428500 Sobic003G428500 Sobic008G056800--Sobic003G428500 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic008G056800--Sobic002G099700 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G056800--Sobic001G021200 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic008G056800--Sobic008G168500 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic008G056800--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic008G056800--Sobic005G058000 Sobic002G014300 Sobic002G014300 Sobic008G056800--Sobic002G014300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic008G056800--Sobic008G088500 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic002G304801--Sobic007G082300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic002G304801--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic002G304801--Sobic004G086900 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic002G304801--Sobic005G007200 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic002G099700 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic002G304801--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic002G304801--Sobic007G167950 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic002G304801--Sobic010G196700 Sobic003G428500--Sobic001G021200 Sobic003G428500--Sobic008G168500 Sobic003G428500--Sobic008G088500 Sobic003G428500--Sobic002G096600 Sobic003G428500--Sobic005G058000 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic001G364300 Sobic003G428500--Sobic005G007200 Sobic003G428500--Sobic005G058200 Sobic004G003300 Sobic004G003300 Sobic003G428500--Sobic004G003300 Sobic002G099700--Sobic002G304801 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic002G099700--Sobic001G136000 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic002G099700--Sobic002G080450 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G099700--Sobic009G060100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic002G099700--Sobic010G129450 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G099700--Sobic007G128000 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic002G099700--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G099700--Sobic007G082100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G099700--Sobic004G168200 Sobic001G021200--Sobic005G058000 Sobic001G021200--Sobic002G096600 Sobic001G021200--Sobic008G168500 Sobic001G021200--Sobic008G088500 Sobic001G021200--Sobic003G428500 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic001G021200--Sobic008G095500 Sobic001G021200--Sobic001G364300 Sobic010G202400 Sobic010G202400 Sobic001G021200--Sobic010G202400 Sobic001G021200--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic008G088500 Sobic008G168500--Sobic002G096600 Sobic008G168500--Sobic005G058000 Sobic008G168500--Sobic001G364300 Sobic008G168500--Sobic005G058200 Sobic008G168500--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic001G021200 Sobic008G168500--Sobic008G095500 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic008G168500--Sobic008G177001 Sobic002G096600--Sobic005G058000 Sobic002G096600--Sobic008G168500 Sobic002G096600--Sobic008G088500 Sobic002G096600--Sobic001G021200 Sobic002G096600--Sobic001G364300 Sobic002G096600--Sobic005G007200 Sobic002G096600--Sobic008G095500 Sobic002G096600--Sobic005G058200 Sobic002G096600--Sobic010G202400 Sobic005G058000--Sobic002G096600 Sobic005G058000--Sobic008G168500 Sobic005G058000--Sobic008G088500 Sobic005G058000--Sobic001G021200 Sobic005G058000--Sobic001G364300 Sobic005G058000--Sobic005G007200 Sobic005G058000--Sobic008G095500 Sobic005G058000--Sobic005G058200 Sobic005G058000--Sobic010G202400 Sobic010G012700 Sobic010G012700 Sobic002G014300--Sobic010G012700 Sobic005G201501 Sobic005G201501 Sobic002G014300--Sobic005G201501 Sobic002G014300--Sobic003G428500 Sobic003G075300 Sobic003G075300 Sobic002G014300--Sobic003G075300 Sobic001G332100 Sobic001G332100 Sobic002G014300--Sobic001G332100 Sobic002G000800 Sobic002G000800 Sobic002G014300--Sobic002G000800 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic002G014300--Sobic005G077001 Sobic002G014300--Sobic001G021200 Sobic002G014300--Sobic010G129450 Sobic008G088500--Sobic008G168500 Sobic008G088500--Sobic001G364300 Sobic008G088500--Sobic002G096600 Sobic008G088500--Sobic005G058000 Sobic008G088500--Sobic005G058200 Sobic008G088500--Sobic005G007200 Sobic008G088500--Sobic001G021200 Sobic008G088500--Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G177001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.