Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G099700.1
Synonym
Functional annotation OsFBX195 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QA86
Pfam -
Panther DB PTHR32133 PTHR32133:SF134
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g20492.1 : OsFBX285 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a044931
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G304801 - -
2 Sobic.001G136000 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
3 Sobic.002G080450 - -
4 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
5 Sobic.010G129450 - -
6 Sobic.007G128000 cytochrome P450, putative, expressed -
7 Sobic.007G081100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
8 Sobic.007G082100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
9 Sobic.004G168200 ATPase, AAA family protein, expressed -
10 Sobic.008G056800 expressed protein -
11 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
12 Sobic.004G086900 - -
13 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
14 Sobic.005G087732 - -
15 Sobic.007G167950 - -
16 Sobic.007G110800 expressed protein -
17 Sobic.005G058300 expressed protein -
18 Sobic.002G204500 Phospholipase D alpha 2 PLD Alpha 2 (At)(PubMedID : 27208977)@phospholipase D, putative, expressed K01115: phospholipase D1/2
19 Sobic.001G417700 polyadenylate-binding protein, putative, expressed K13126: polyadenylate-binding protein
20 Sobic.007G081800 MBTB22 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein


Gene co-expression network
sample Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic002G099700--Sobic002G304801 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic002G099700--Sobic001G136000 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic002G099700--Sobic002G080450 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G099700--Sobic009G060100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic002G099700--Sobic010G129450 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G099700--Sobic007G128000 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic002G099700--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G099700--Sobic007G082100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G099700--Sobic004G168200 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic002G304801--Sobic007G082300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic002G304801--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic002G304801--Sobic004G086900 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic002G304801--Sobic005G007200 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic002G099700 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic002G304801--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic002G304801--Sobic007G167950 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic002G304801--Sobic010G196700 Sobic001G136000--Sobic007G128000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic001G136000--Sobic001G417700 Sobic001G136000--Sobic009G060100 Sobic001G136000--Sobic010G129450 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic001G136000--Sobic002G101600 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic001G136000--Sobic006G266400 Sobic001G136000--Sobic007G082100 Sobic001G136000--Sobic007G081100 Sobic001G240600 Sobic001G240600 Sobic001G136000--Sobic001G240600 Sobic002G080450--Sobic001G136000 Sobic002G080450--Sobic009G060100 Sobic002G080450--Sobic007G128000 Sobic008G029800 Sobic008G029800 Sobic002G080450--Sobic008G029800 Sobic002G080450--Sobic007G082100 Sobic002G080450--Sobic002G099700 Sobic002G123300 Sobic002G123300 Sobic002G080450--Sobic002G123300 Sobic002G080450--Sobic010G129450 Sobic002G080450--Sobic001G417700 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic009G060100--Sobic005G058300 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic009G060100--Sobic010G123800 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic009G060100--Sobic007G081800 Sobic009G060100--Sobic007G082100 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic009G060100--Sobic004G046700 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic009G060100--Sobic006G224400 Sobic009G060100--Sobic007G167950 Sobic009G060100--Sobic005G087732 Sobic009G060100--Sobic007G110800 Sobic010G129450--Sobic009G060100 Sobic010G129450--Sobic001G136000 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic010G129450--Sobic005G058600 Sobic010G129450--Sobic007G082100 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic010G129450--Sobic003G133201 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic010G129450--Sobic003G191200 Sobic010G129450--Sobic010G123800 Sobic010G129450--Sobic005G058300 Sobic010G129450--Sobic007G081100 Sobic007G128000--Sobic001G136000 Sobic007G128000--Sobic001G417700 Sobic007G128000--Sobic001G240600 Sobic007G128000--Sobic006G266400 Sobic007G128000--Sobic002G101600 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic007G128000--Sobic003G070400 Sobic009G250300 Sobic009G250300 Sobic007G128000--Sobic009G250300 Sobic007G128000--Sobic007G081100 Sobic002G189500 Sobic002G189500 Sobic007G128000--Sobic002G189500 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic007G081100--Sobic002G204500 Sobic007G081100--Sobic007G082100 Sobic007G081100--Sobic003G191200 Sobic007G081100--Sobic003G070400 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic007G081100--Sobic007G031200 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic007G081100--Sobic004G100300 Sobic007G081100--Sobic009G060100 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic007G081100--Sobic002G182701 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic007G081100--Sobic001G211700 Sobic007G082100--Sobic003G191200 Sobic007G082100--Sobic004G046700 Sobic007G082100--Sobic001G211700 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic007G082100--Sobic006G017900 Sobic007G082100--Sobic010G123800 Sobic007G082100--Sobic002G182701 Sobic007G082100--Sobic009G060100 Sobic007G082100--Sobic007G031200 Sobic007G082100--Sobic007G081800 Sobic004G168200--Sobic001G211700 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic004G168200--Sobic006G017700 Sobic004G168200--Sobic006G017900 Sobic004G168200--Sobic002G182701 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic004G168200--Sobic002G384900 Sobic005G049850 Sobic005G049850 Sobic004G168200--Sobic005G049850 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic004G168200--Sobic005G000900 Sobic004G168200--Sobic007G082100 Sobic004G168200--Sobic007G031200
Octagon: transcription factors


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