Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G304801.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6QE89
Pfam PF08387
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF91
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G49030 : FBD, F-box and Leucine Rich Repeat domains containing protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g36000.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
2 Sobic.005G058200 expressed protein -
3 Sobic.004G086900 - -
4 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
5 Sobic.007G110800 expressed protein -
6 Sobic.002G099700 OsFBX195 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G087732 - -
8 Sobic.007G167950 - -
9 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
10 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
11 Sobic.001G364300 - -
12 Sobic.004G168200 ATPase, AAA family protein, expressed -
13 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -
14 Sobic.008G177001 - -
15 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
16 Sobic.005G058300 expressed protein -
17 Sobic.008G095500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
18 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
19 Sobic.007G081800 MBTB22 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.009G047900 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1


Gene co-expression network
sample Sobic002G304801 Sobic002G304801 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic002G304801--Sobic007G082300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic002G304801--Sobic005G058200 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic002G304801--Sobic004G086900 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic002G304801--Sobic005G007200 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic002G304801--Sobic007G110800 Sobic002G099700 Sobic002G099700 Sobic002G304801--Sobic002G099700 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic002G304801--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic002G304801--Sobic007G167950 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic002G304801--Sobic010G196700 Sobic007G082300--Sobic004G086900 Sobic007G082300--Sobic005G087732 Sobic007G082300--Sobic007G167950 Sobic007G082300--Sobic007G110800 Sobic007G082300--Sobic005G058200 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic007G082300--Sobic006G224400 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic007G082300--Sobic005G058300 Sobic007G082300--Sobic005G007200 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic007G082300--Sobic007G081800 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic005G058200--Sobic001G364300 Sobic005G058200--Sobic005G007200 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic005G058200--Sobic008G088500 Sobic005G058200--Sobic007G082300 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic005G058200--Sobic008G168500 Sobic005G058200--Sobic004G086900 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic005G058200--Sobic008G177001 Sobic005G058200--Sobic007G110800 Sobic005G058200--Sobic005G087732 Sobic004G086900--Sobic007G082300 Sobic004G086900--Sobic005G087732 Sobic004G086900--Sobic007G167950 Sobic004G086900--Sobic007G110800 Sobic004G086900--Sobic006G224400 Sobic004G086900--Sobic005G058300 Sobic004G086900--Sobic005G058200 Sobic004G086900--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic004G086900--Sobic010G123800 Sobic005G007200--Sobic005G058200 Sobic005G007200--Sobic001G364300 Sobic005G007200--Sobic008G088500 Sobic005G007200--Sobic008G168500 Sobic005G007200--Sobic007G082300 Sobic005G007200--Sobic004G086900 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic005G007200--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic005G007200--Sobic005G058000 Sobic005G007200--Sobic008G177001 Sobic007G110800--Sobic005G087732 Sobic007G110800--Sobic007G167950 Sobic007G110800--Sobic004G086900 Sobic007G110800--Sobic007G082300 Sobic007G110800--Sobic005G058300 Sobic007G110800--Sobic006G224400 Sobic007G110800--Sobic007G081800 Sobic007G110800--Sobic010G123800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic007G110800--Sobic004G046700 Sobic002G099700--Sobic002G304801 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic002G099700--Sobic001G136000 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic002G099700--Sobic002G080450 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic002G099700--Sobic009G060100 Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic002G099700--Sobic010G129450 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic002G099700--Sobic007G128000 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic002G099700--Sobic007G081100 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic002G099700--Sobic007G082100 Sobic004G168200 Sobic004G168200 Sobic002G099700--Sobic004G168200 Sobic005G087732--Sobic007G167950 Sobic005G087732--Sobic007G110800 Sobic005G087732--Sobic004G086900 Sobic005G087732--Sobic007G082300 Sobic005G087732--Sobic005G058300 Sobic005G087732--Sobic006G224400 Sobic005G087732--Sobic007G081800 Sobic005G087732--Sobic010G123800 Sobic005G087732--Sobic004G046700 Sobic007G167950--Sobic005G087732 Sobic007G167950--Sobic007G110800 Sobic007G167950--Sobic004G086900 Sobic007G167950--Sobic007G082300 Sobic007G167950--Sobic005G058300 Sobic007G167950--Sobic006G224400 Sobic007G167950--Sobic007G081800 Sobic007G167950--Sobic010G123800 Sobic007G167950--Sobic004G046700 Sobic010G196700--Sobic005G058200 Sobic010G196700--Sobic007G082300 Sobic010G196700--Sobic004G086900 Sobic010G196700--Sobic001G364300 Sobic010G196700--Sobic007G110800 Sobic010G196700--Sobic005G007200 Sobic010G196700--Sobic008G088500 Sobic010G196700--Sobic005G087732 Sobic010G196700--Sobic007G167950
Octagon: transcription factors


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