Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G047900.1
Synonym Sb09g004110
Functional annotation E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed
UniProt C5Z074
Pfam PF03145
Panther DB PTHR10315 PTHR10315:SF35
NCBI CDD -
KEGG Orthology K04506; E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
Gene Ontology GO:0007275; multicellular organism development GO:0006511ubiquitin-dependent protein catabolic process GO:0005634nucleus


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G37870 : Protein with RING/U-box and TRAF-like domains
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g06060.1 : E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic009G047900--Sobic010G196700 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic009G047900--Sobic005G058200 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic009G047900--Sobic005G007200 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic009G047900--Sobic001G364300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic009G047900--Sobic008G088500 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic009G047900--Sobic007G082300 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic009G047900--Sobic001G518900 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic009G047900--Sobic004G086900 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic009G047900--Sobic008G168500 Sobic010G196700--Sobic005G058200 Sobic010G196700--Sobic007G082300 Sobic010G196700--Sobic004G086900 Sobic010G196700--Sobic001G364300 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic010G196700--Sobic007G110800 Sobic010G196700--Sobic005G007200 Sobic010G196700--Sobic008G088500 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic010G196700--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic010G196700--Sobic007G167950 Sobic005G058200--Sobic001G364300 Sobic005G058200--Sobic005G007200 Sobic005G058200--Sobic008G088500 Sobic005G058200--Sobic007G082300 Sobic005G058200--Sobic008G168500 Sobic005G058200--Sobic004G086900 Sobic008G177001 Sobic008G177001 Sobic005G058200--Sobic008G177001 Sobic005G058200--Sobic007G110800 Sobic005G058200--Sobic005G087732 Sobic005G007200--Sobic005G058200 Sobic005G007200--Sobic001G364300 Sobic005G007200--Sobic008G088500 Sobic005G007200--Sobic008G168500 Sobic005G007200--Sobic007G082300 Sobic005G007200--Sobic004G086900 Sobic002G096600 Sobic002G096600 Sobic005G007200--Sobic002G096600 Sobic005G058000 Sobic005G058000 Sobic005G007200--Sobic005G058000 Sobic005G007200--Sobic008G177001 Sobic001G364300--Sobic005G058200 Sobic001G364300--Sobic008G088500 Sobic001G364300--Sobic008G168500 Sobic001G364300--Sobic005G007200 Sobic001G364300--Sobic002G096600 Sobic001G364300--Sobic005G058000 Sobic001G364300--Sobic007G082300 Sobic001G364300--Sobic004G086900 Sobic001G364300--Sobic008G177001 Sobic008G088500--Sobic008G168500 Sobic008G088500--Sobic001G364300 Sobic008G088500--Sobic002G096600 Sobic008G088500--Sobic005G058000 Sobic008G088500--Sobic005G058200 Sobic008G088500--Sobic005G007200 Sobic001G021200 Sobic001G021200 Sobic008G088500--Sobic001G021200 Sobic008G095500 Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G095500 Sobic008G088500--Sobic008G177001 Sobic007G082300--Sobic004G086900 Sobic007G082300--Sobic005G087732 Sobic007G082300--Sobic007G167950 Sobic007G082300--Sobic007G110800 Sobic007G082300--Sobic005G058200 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic007G082300--Sobic006G224400 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic007G082300--Sobic005G058300 Sobic007G082300--Sobic005G007200 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic007G082300--Sobic007G081800 Sobic001G518900--Sobic008G095500 Sobic001G518900--Sobic008G088500 Sobic001G518900--Sobic008G168500 Sobic001G518900--Sobic009G047900 Sobic001G518900--Sobic002G096600 Sobic001G518900--Sobic005G058000 Sobic001G518900--Sobic010G196700 Sobic001G518900--Sobic001G364300 Sobic001G518900--Sobic005G058200 Sobic004G086900--Sobic007G082300 Sobic004G086900--Sobic005G087732 Sobic004G086900--Sobic007G167950 Sobic004G086900--Sobic007G110800 Sobic004G086900--Sobic006G224400 Sobic004G086900--Sobic005G058300 Sobic004G086900--Sobic005G058200 Sobic004G086900--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic004G086900--Sobic010G123800 Sobic008G168500--Sobic008G088500 Sobic008G168500--Sobic002G096600 Sobic008G168500--Sobic005G058000 Sobic008G168500--Sobic001G364300 Sobic008G168500--Sobic005G058200 Sobic008G168500--Sobic005G007200 Sobic008G168500--Sobic001G021200 Sobic008G168500--Sobic008G095500 Sobic008G168500--Sobic008G177001
Octagon: transcription factors


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