Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G474100.1
Synonym APUM7, Sb01g044430, PUM7
Functional annotation pumilio-family RNA binding repeat domain containing protein, expressed
UniProt A0A1Z5SB17
Pfam PF00806
Panther DB PTHR12537 PTHR12537:SF64
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003723; RNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G78160 : pumilio 7
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g09150.1 : pumilio-family RNA binding repeat domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a053205 , Zm00025a001053
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G047900 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
2 Sobic.007G193600 - -
3 Sobic.004G256100 transporter-related, putative, expressed -
4 Sobic.008G144701 - -
5 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
6 Sobic.001G518900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
7 Sobic.001G103600 gp176, putative, expressed -
8 Sobic.008G095500 CPuORF14 - conserved peptide uORF-containing transcript, expressed K03262: translation initiation factor 5
9 Sobic.005G058200 expressed protein -
10 Sobic.008G168500 amino acid permease family protein, putative, expressed K03294: basic amino acid/polyamine antiporter, APA family
11 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -
12 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
13 Sobic.001G364300 - -
14 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
15 Sobic.004G086900 - -
16 Sobic.002G096600 OsFBX15 - F-box domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G058000 expressed protein -
18 Sobic.008G177001 - -
19 Sobic.007G110800 expressed protein -
20 Sobic.001G021200 elongation factor, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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