Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G144701.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5R6T4
Pfam -
Panther DB PTHR36014 PTHR36014:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26340 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g31880.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G047900 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
2 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
3 Sobic.002G307400 MATH domain containing protein, expressed -
4 Sobic.004G086900 - -
5 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
6 Sobic.007G110800 expressed protein -
7 Sobic.005G087732 - -
8 Sobic.007G167950 - -
9 Sobic.001G253750 - -
10 Sobic.005G058300 expressed protein -
11 Sobic.007G081800 MBTB22 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
13 Sobic.005G058200 expressed protein -
14 Sobic.010G123800 expressed protein -
15 Sobic.004G046700 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
17 Sobic.001G364300 - -
18 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
19 Sobic.008G071800 - -
20 Sobic.001G474100 pumilio-family RNA binding repeat domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G144701--Sobic009G047900 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic008G144701--Sobic010G196700 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G144701--Sobic002G307400 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic008G144701--Sobic004G086900 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic008G144701--Sobic007G082300 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic008G144701--Sobic007G110800 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic008G144701--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic008G144701--Sobic007G167950 Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic008G144701--Sobic001G253750 Sobic009G047900--Sobic010G196700 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic009G047900--Sobic005G058200 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic009G047900--Sobic005G007200 Sobic001G364300 Sobic001G364300 Sobic009G047900--Sobic001G364300 Sobic008G088500 Sobic008G088500 Sobic009G047900--Sobic008G088500 Sobic009G047900--Sobic007G082300 Sobic001G518900 Sobic001G518900 Sobic009G047900--Sobic001G518900 Sobic009G047900--Sobic004G086900 Sobic008G168500 Sobic008G168500 Sobic009G047900--Sobic008G168500 Sobic010G196700--Sobic005G058200 Sobic010G196700--Sobic007G082300 Sobic010G196700--Sobic004G086900 Sobic010G196700--Sobic001G364300 Sobic010G196700--Sobic007G110800 Sobic010G196700--Sobic005G007200 Sobic010G196700--Sobic008G088500 Sobic010G196700--Sobic005G087732 Sobic010G196700--Sobic007G167950 Sobic005G221675 Sobic005G221675 Sobic002G307400--Sobic005G221675 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic002G307400--Sobic007G081800 Sobic006G200300 Sobic006G200300 Sobic002G307400--Sobic006G200300 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic002G307400--Sobic005G058300 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic002G307400--Sobic004G100300 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic002G307400--Sobic003G191200 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic002G307400--Sobic002G384900 Sobic007G198900 Sobic007G198900 Sobic002G307400--Sobic007G198900 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic002G307400--Sobic006G224400 Sobic004G086900--Sobic007G082300 Sobic004G086900--Sobic005G087732 Sobic004G086900--Sobic007G167950 Sobic004G086900--Sobic007G110800 Sobic004G086900--Sobic006G224400 Sobic004G086900--Sobic005G058300 Sobic004G086900--Sobic005G058200 Sobic004G086900--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic004G086900--Sobic010G123800 Sobic007G082300--Sobic004G086900 Sobic007G082300--Sobic005G087732 Sobic007G082300--Sobic007G167950 Sobic007G082300--Sobic007G110800 Sobic007G082300--Sobic005G058200 Sobic007G082300--Sobic006G224400 Sobic007G082300--Sobic005G058300 Sobic007G082300--Sobic005G007200 Sobic007G082300--Sobic007G081800 Sobic007G110800--Sobic005G087732 Sobic007G110800--Sobic007G167950 Sobic007G110800--Sobic004G086900 Sobic007G110800--Sobic007G082300 Sobic007G110800--Sobic005G058300 Sobic007G110800--Sobic006G224400 Sobic007G110800--Sobic007G081800 Sobic007G110800--Sobic010G123800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic007G110800--Sobic004G046700 Sobic005G087732--Sobic007G167950 Sobic005G087732--Sobic007G110800 Sobic005G087732--Sobic004G086900 Sobic005G087732--Sobic007G082300 Sobic005G087732--Sobic005G058300 Sobic005G087732--Sobic006G224400 Sobic005G087732--Sobic007G081800 Sobic005G087732--Sobic010G123800 Sobic005G087732--Sobic004G046700 Sobic007G167950--Sobic005G087732 Sobic007G167950--Sobic007G110800 Sobic007G167950--Sobic004G086900 Sobic007G167950--Sobic007G082300 Sobic007G167950--Sobic005G058300 Sobic007G167950--Sobic006G224400 Sobic007G167950--Sobic007G081800 Sobic007G167950--Sobic010G123800 Sobic007G167950--Sobic004G046700 Sobic001G253750--Sobic008G144701 Sobic001G253750--Sobic004G086900 Sobic001G253750--Sobic007G082300 Sobic001G253750--Sobic005G087732 Sobic001G253750--Sobic007G167950 Sobic001G253750--Sobic007G110800 Sobic001G253750--Sobic005G058300 Sobic001G253750--Sobic006G224400 Sobic008G078200 Sobic008G078200 Sobic001G253750--Sobic008G078200
Octagon: transcription factors


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