Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G253750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S7B2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G144701 - -
2 Sobic.004G086900 - -
3 Sobic.007G082300 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
4 Sobic.005G087732 - -
5 Sobic.007G167950 - -
6 Sobic.007G110800 expressed protein -
7 Sobic.005G058300 expressed protein -
8 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
9 Sobic.008G078200 EDM2, putative, expressed -
10 Sobic.005G058200 expressed protein -
11 Sobic.007G081800 MBTB22 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.010G123800 expressed protein -
13 Sobic.010G196700 gp176, putative, expressed -
14 Sobic.004G046700 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G518900 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
16 Sobic.009G047900 E3 ubiquitin-protein ligase SINA-like 2, putative, expressed K04506: E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1
17 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
18 Sobic.001G364300 - -
19 Sobic.005G007200 DEFL53 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
20 Sobic.008G088500 amino acid transporter, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G253750 Sobic001G253750 Sobic008G144701 Sobic008G144701 Sobic001G253750--Sobic008G144701 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic001G253750--Sobic004G086900 Sobic007G082300 Sobic007G082300 Sobic001G253750--Sobic007G082300 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic001G253750--Sobic005G087732 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic001G253750--Sobic007G167950 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic001G253750--Sobic007G110800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic001G253750--Sobic005G058300 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic001G253750--Sobic006G224400 Sobic008G078200 Sobic008G078200 Sobic001G253750--Sobic008G078200 Sobic009G047900 Sobic009G047900 Sobic008G144701--Sobic009G047900 Sobic010G196700 Sobic010G196700 Sobic008G144701--Sobic010G196700 Sobic002G307400 Sobic002G307400 Sobic008G144701--Sobic002G307400 Sobic008G144701--Sobic004G086900 Sobic008G144701--Sobic007G082300 Sobic008G144701--Sobic007G110800 Sobic008G144701--Sobic005G087732 Sobic008G144701--Sobic007G167950 Sobic008G144701--Sobic001G253750 Sobic004G086900--Sobic007G082300 Sobic004G086900--Sobic005G087732 Sobic004G086900--Sobic007G167950 Sobic004G086900--Sobic007G110800 Sobic004G086900--Sobic006G224400 Sobic004G086900--Sobic005G058300 Sobic005G058200 Sobic005G058200 Sobic004G086900--Sobic005G058200 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic004G086900--Sobic007G081800 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic004G086900--Sobic010G123800 Sobic007G082300--Sobic004G086900 Sobic007G082300--Sobic005G087732 Sobic007G082300--Sobic007G167950 Sobic007G082300--Sobic007G110800 Sobic007G082300--Sobic005G058200 Sobic007G082300--Sobic006G224400 Sobic007G082300--Sobic005G058300 Sobic005G007200 Sobic005G007200 Sobic007G082300--Sobic005G007200 Sobic007G082300--Sobic007G081800 Sobic005G087732--Sobic007G167950 Sobic005G087732--Sobic007G110800 Sobic005G087732--Sobic004G086900 Sobic005G087732--Sobic007G082300 Sobic005G087732--Sobic005G058300 Sobic005G087732--Sobic006G224400 Sobic005G087732--Sobic007G081800 Sobic005G087732--Sobic010G123800 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic005G087732--Sobic004G046700 Sobic007G167950--Sobic005G087732 Sobic007G167950--Sobic007G110800 Sobic007G167950--Sobic004G086900 Sobic007G167950--Sobic007G082300 Sobic007G167950--Sobic005G058300 Sobic007G167950--Sobic006G224400 Sobic007G167950--Sobic007G081800 Sobic007G167950--Sobic010G123800 Sobic007G167950--Sobic004G046700 Sobic007G110800--Sobic005G087732 Sobic007G110800--Sobic007G167950 Sobic007G110800--Sobic004G086900 Sobic007G110800--Sobic007G082300 Sobic007G110800--Sobic005G058300 Sobic007G110800--Sobic006G224400 Sobic007G110800--Sobic007G081800 Sobic007G110800--Sobic010G123800 Sobic007G110800--Sobic004G046700 Sobic005G058300--Sobic007G081800 Sobic005G058300--Sobic010G123800 Sobic005G058300--Sobic004G046700 Sobic005G058300--Sobic007G167950 Sobic005G058300--Sobic005G087732 Sobic005G058300--Sobic006G224400 Sobic005G058300--Sobic007G110800 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic005G058300--Sobic009G060100 Sobic005G058300--Sobic004G086900 Sobic006G224400--Sobic005G058300 Sobic006G224400--Sobic007G167950 Sobic006G224400--Sobic007G081800 Sobic006G224400--Sobic005G087732 Sobic006G224400--Sobic007G110800 Sobic006G224400--Sobic010G123800 Sobic006G224400--Sobic004G046700 Sobic006G224400--Sobic004G086900 Sobic006G224400--Sobic007G082300 Sobic008G078200--Sobic005G058300 Sobic008G078200--Sobic007G167950 Sobic008G078200--Sobic005G087732 Sobic008G078200--Sobic007G081800 Sobic008G078200--Sobic010G123800 Sobic008G078200--Sobic004G046700 Sobic008G078200--Sobic007G110800 Sobic008G078200--Sobic004G086900 Sobic008G078200--Sobic006G224400
Octagon: transcription factors


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