Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G129450.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VSS0
Pfam PF07762
Panther DB PTHR33086 PTHR33086:SF7
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g20310.3 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G060100 alliin lyase precursor, putative, expressed K16903: L-tryptophan---pyruvate aminotransferase
2 Sobic.001G136000 PINHEAD, putative, expressed K11593: ELF2C, eukaryotic translation initiation factor 2C
3 Sobic.005G058600 csAtPR5, putative, expressed -
4 Sobic.007G082100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
5 Sobic.003G133201 - -
6 Sobic.003G191200 expressed protein -
7 Sobic.010G123800 expressed protein -
8 Sobic.005G058300 expressed protein -
9 Sobic.007G081100 MBTB21 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
10 Sobic.004G046700 OsFBLD3 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
11 Sobic.007G081800 MBTB22 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
12 Sobic.007G110800 expressed protein -
13 Sobic.007G167950 - -
14 Sobic.005G087732 - -
15 Sobic.006G224400 ubiquitin family protein, putative, expressed K08770: ubiquitin C
K12158: ubiquitin-like protein Nedd8
K04551: ubiquitin B
16 Sobic.007G128000 cytochrome P450, putative, expressed -
17 Sobic.007G031200 - -
18 Sobic.004G050900 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
19 Sobic.005G077001 - -
20 Sobic.004G086900 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G129450 Sobic010G129450 Sobic009G060100 Sobic009G060100 Sobic010G129450--Sobic009G060100 Sobic001G136000 Sobic001G136000 Sobic010G129450--Sobic001G136000 Sobic005G058600 Sobic005G058600 Sobic010G129450--Sobic005G058600 Sobic007G082100 Sobic007G082100 Sobic010G129450--Sobic007G082100 Sobic003G133201 Sobic003G133201 Sobic010G129450--Sobic003G133201 Sobic003G191200 Sobic003G191200 Sobic010G129450--Sobic003G191200 Sobic010G123800 Sobic010G123800 Sobic010G129450--Sobic010G123800 Sobic005G058300 Sobic005G058300 Sobic010G129450--Sobic005G058300 Sobic007G081100 Sobic007G081100 Sobic010G129450--Sobic007G081100 Sobic009G060100--Sobic005G058300 Sobic009G060100--Sobic010G123800 Sobic007G081800 Sobic007G081800 Sobic009G060100--Sobic007G081800 Sobic009G060100--Sobic007G082100 Sobic004G046700 Sobic004G046700 Sobic009G060100--Sobic004G046700 Sobic006G224400 Sobic006G224400 Sobic009G060100--Sobic006G224400 Sobic007G167950 Sobic007G167950 Sobic009G060100--Sobic007G167950 Sobic005G087732 Sobic005G087732 Sobic009G060100--Sobic005G087732 Sobic007G110800 Sobic007G110800 Sobic009G060100--Sobic007G110800 Sobic007G128000 Sobic007G128000 Sobic001G136000--Sobic007G128000 Sobic001G417700 Sobic001G417700 Sobic001G136000--Sobic001G417700 Sobic001G136000--Sobic009G060100 Sobic001G136000--Sobic010G129450 Sobic002G101600 Sobic002G101600 Sobic001G136000--Sobic002G101600 Sobic006G266400 Sobic006G266400 Sobic001G136000--Sobic006G266400 Sobic001G136000--Sobic007G082100 Sobic001G136000--Sobic007G081100 Sobic001G240600 Sobic001G240600 Sobic001G136000--Sobic001G240600 Sobic005G058600--Sobic003G133201 Sobic007G031200 Sobic007G031200 Sobic005G058600--Sobic007G031200 Sobic004G050900 Sobic004G050900 Sobic005G058600--Sobic004G050900 Sobic008G169101 Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic008G169101 Sobic005G058600--Sobic003G191200 Sobic009G110333 Sobic009G110333 Sobic005G058600--Sobic009G110333 Sobic002G402900 Sobic002G402900 Sobic005G058600--Sobic002G402900 Sobic005G077001 Sobic005G077001 Sobic005G058600--Sobic005G077001 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic005G058600--Sobic005G000900 Sobic007G082100--Sobic003G191200 Sobic007G082100--Sobic004G046700 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic007G082100--Sobic001G211700 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic007G082100--Sobic006G017900 Sobic007G082100--Sobic010G123800 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic007G082100--Sobic002G182701 Sobic007G082100--Sobic009G060100 Sobic007G082100--Sobic007G031200 Sobic007G082100--Sobic007G081800 Sobic003G133201--Sobic004G050900 Sobic003G133201--Sobic005G058600 Sobic003G133201--Sobic009G110333 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic009G182100 Sobic003G133201--Sobic005G000900 Sobic002G266500 Sobic002G266500 Sobic003G133201--Sobic002G266500 Sobic009G047100 Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic009G047100 Sobic003G133201--Sobic007G031200 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic003G133201--Sobic006G017700 Sobic003G191200--Sobic007G082100 Sobic003G191200--Sobic007G031200 Sobic003G191200--Sobic004G046700 Sobic003G191200--Sobic010G123800 Sobic003G191200--Sobic007G081800 Sobic003G191200--Sobic005G058300 Sobic003G191200--Sobic006G017900 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic003G191200--Sobic004G100300 Sobic003G191200--Sobic001G211700 Sobic010G123800--Sobic004G046700 Sobic010G123800--Sobic007G081800 Sobic010G123800--Sobic005G058300 Sobic010G123800--Sobic006G224400 Sobic010G123800--Sobic007G167950 Sobic010G123800--Sobic005G087732 Sobic010G123800--Sobic006G017900 Sobic010G123800--Sobic001G211700 Sobic010G123800--Sobic007G082100 Sobic005G058300--Sobic007G081800 Sobic005G058300--Sobic010G123800 Sobic005G058300--Sobic004G046700 Sobic005G058300--Sobic007G167950 Sobic005G058300--Sobic005G087732 Sobic005G058300--Sobic006G224400 Sobic005G058300--Sobic007G110800 Sobic005G058300--Sobic009G060100 Sobic004G086900 Sobic004G086900 Sobic005G058300--Sobic004G086900 Sobic002G204500 Sobic002G204500 Sobic007G081100--Sobic002G204500 Sobic007G081100--Sobic007G082100 Sobic007G081100--Sobic003G191200 Sobic003G070400 Sobic003G070400 Sobic007G081100--Sobic003G070400 Sobic007G081100--Sobic007G031200 Sobic007G081100--Sobic004G100300 Sobic007G081100--Sobic009G060100 Sobic007G081100--Sobic002G182701 Sobic007G081100--Sobic001G211700
Octagon: transcription factors


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